Вопросы с тегом «mixed-model»

25
Аппроксимации Саттертвейта и Кенварда-Роджера для степеней свободы в смешанных моделях

lmerTestПакет предоставляет anova()функцию для линейных смешанных моделей с необязательно приближением Саттервейта ( по умолчанию) или Кенворд-Роже степеней свободы (DF). В чем разница между этими двумя подходами? Когда выбрать...

25
Проверка предположений смешанных моделей lmer / lme в R

Я выполнил повторный проект, в ходе которого я протестировал 30 мужчин и 30 женщин в трех разных заданиях. Я хочу понять, как поведение мужчин и женщин отличается и как это зависит от задачи. Я использовал оба пакета lmer и lme4, чтобы исследовать это, однако я застрял при попытке проверить...

24
Какова польза от рассмотрения фактора как случайного в смешанной модели?

У меня есть проблема, заключающаяся в использовании преимуществ маркировки модельного фактора как случайного по нескольким причинам. Мне кажется, что почти во всех случаях оптимальное решение состоит в том, чтобы рассматривать все факторы как фиксированные. Во-первых, различие между фиксированным и...

24
Почему lme и aov возвращают разные результаты для повторных измерений ANOVA в R?

Я пытаюсь перейти от использования ezпакета lmeдля повторных измерений ANOVA (как я надеюсь, я смогу использовать пользовательские контрасты с lme). Следуя совету из этого поста в блоге, я смог настроить одну и ту же модель, используя обе функции aov(как это делается ezпри запросе) и lme. Однако, в...

24
Полезны ли смешанные модели в качестве прогностических моделей?

Я немного озадачен преимуществами смешанных моделей в отношении прогнозного моделирования. Поскольку прогнозирующие модели обычно предназначены для прогнозирования значений ранее неизвестных наблюдений, для меня кажется очевидным, что единственная возможность, с которой смешанная модель может быть...

23
Имеет ли смысл вкладывать фиксированный эффект в случайный или как кодировать повторяющиеся измерения в R (aov и lmer)?

Я просматривал этот обзор формул lm / lmer R от @conjugateprior и был озадачен следующей записью: Теперь предположим, что A случайный, но B фиксирован, а B вложен в A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Ниже приведена аналогичная смешанная модельная формула lmer(Y ~ B + (1 | A:B), data=d) для того же...

22
Почему я получаю нулевую дисперсию случайного эффекта в моей смешанной модели, несмотря на некоторые различия в данных?

Мы запустили логистическую регрессию со смешанными эффектами, используя следующий синтаксис; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Предмет и Предмет - случайные эффекты. Мы получаем странный...

22
Как следует сравнивать и / или проверять модели смешанных эффектов?

Как (линейные) модели смешанных эффектов обычно сравниваются друг с другом? Я знаю, что могут использоваться тесты отношения правдоподобия, но это не работает, если одна модель не является «подмножеством» другой, верно? Всегда ли оценка моделей df проста? Количество фиксированных эффектов +...

21
Как применить биномиальный GLMM (glmer) к процентам, а не к счетам да-нет?

У меня есть эксперимент с повторными измерениями, где зависимая переменная представляет собой процент, и у меня есть несколько факторов в качестве независимых переменных. Я хотел бы использовать glmerиз пакета R, lme4чтобы рассматривать его как проблему логистической регрессии (путем указания...

21
Предупреждение «Модель не сходится» в lmer ()

В следующем наборе данных я хотел посмотреть, изменится ли ответ (эффект) в отношении сайтов, сезона, продолжительности и их взаимодействий. Некоторые онлайн-форумы по статистике предложили мне продолжить работу с линейными моделями со смешанными эффектами, но проблема в том, что, поскольку...

21
Показано, что 100 измерений для 5 предметов дают гораздо меньше информации, чем 5 измерений для 100 предметов

На конференции я услышал следующее утверждение: 100 измерений для 5 предметов дают гораздо меньше информации, чем 5 измерений для 100 предметов. Очевидно, что это правда, но мне было интересно, как можно это доказать математически ... Я думаю, что можно использовать линейную смешанную модель. Тем...

21
Как спроецировать новый вектор на пространство PCA?

После выполнения анализа главных компонентов (PCA) я хочу спроецировать новый вектор на пространство PCA (т.е. найти его координаты в системе координат PCA). Я рассчитал PCA на языке R, используя prcomp. Теперь я должен быть в состоянии умножить свой вектор на матрицу вращения PCA. Должны ли...

21
Остаточная диагностика в регрессионных моделях на основе MCMC

Недавно я приступил к подгонке регрессионно-смешанных моделей в байесовской структуре, используя алгоритм MCMC (функция MCMCglmm в R на самом деле). Я полагаю, что я понял, как диагностировать сходимость процесса оценки (след, график Гьюке, автокорреляция, апостериорное распределение ...). Одна из...

21
Как интерпретировать основные эффекты, когда эффект взаимодействия незначителен?

Я запустил обобщенную линейную смешанную модель в R и включил эффект взаимодействия между двумя предикторами. Взаимодействие не было значительным, но основные эффекты (два предиктора) были оба. Теперь многие примеры из учебников говорят мне, что, если взаимодействие имеет существенный эффект,...

20
Каковы правильные значения для точности и отзыва в крайних случаях?

Точность определяется как: p = true positives / (true positives + false positives) Является ли это исправить , что, как true positivesи false positivesподход 0, точность приближается к 1? Тот же вопрос для отзыва: r = true positives / (true positives + false negatives) В настоящее время я выполняю...

20
Парный t-критерий как частный случай линейного смешанного моделирования

Мы знаем, что парное t- тестирование - это всего лишь частный случай одностороннего повторного измерения (или внутри субъекта) ANOVA, а также линейной модели смешанного эффекта, которую можно продемонстрировать с помощью функции lme () пакета nlme в R как показано ниже. #response data from 10...

20
Как я могу объединить апостериорные средства и достоверные интервалы после многократного вменения?

Я использовал множественное вменение для получения ряда завершенных наборов данных. Я использовал байесовские методы на каждом из законченных наборов данных, чтобы получить апостериорные распределения для параметра (случайный эффект). Как я могу объединить / объединить результаты для этого...

20
Как работает распределение Пуассона при моделировании непрерывных данных и приводит ли это к потере информации?

Сотрудница анализирует некоторые биологические данные для своей диссертации с некоторой неприятной гетероскедастичностью (рисунок ниже). Она анализирует это по смешанной модели, но все еще имеет проблемы с остатками. Лог-преобразование переменных ответа проясняет ситуацию и на основе обратной связи...

20
Допускается сравнение моделей смешанных эффектов (в первую очередь случайные эффекты)

Я смотрел на моделирование смешанных эффектов с использованием пакета lme4 в R. Я в основном использую lmerкоманду, поэтому я задам свой вопрос через код, который использует этот синтаксис. Я предполагаю, что общий простой вопрос может состоять в том, можно ли сравнивать любые две модели,...