Я знаю, что одним из преимуществ смешанных моделей является то, что они позволяют задавать дисперсионно-ковариационную матрицу для данных (составная симметрия, авторегрессия, неструктурированная и т. Д.). Однако lmerфункция в R не позволяет легко определить эту матрицу. Кто-нибудь знает, какую...
У меня есть данные от пациентов, получавших 2 разных вида лечения во время операции. Мне нужно проанализировать его влияние на частоту сердечных сокращений. Измерение частоты сердечных сокращений проводится каждые 15 минут. Учитывая, что продолжительность операции может быть разной для каждого...
Скажем, что вы находитесь в библиотеке вашего департамента статистики, и что вы наткнулись на книгу со следующей картинкой на первой странице. Вы, вероятно, подумаете, что это книга о вещах линейной регрессии. Какая картина заставит вас задуматься о линейных смешанных...
Существует ли такой пакет, который обеспечивает нулевую раздувание отрицательной биномиальной оценки модели смешанных эффектов в R? Под этим я подразумеваю: Нулевая инфляция, где вы можете указать биномиальную модель для нулевой инфляции, как в функции zeroinfl в пакете pscl: zeroinfl (y ~ X | Z,...
Я провел компьютерную оценку различных методов подгонки модели определенного типа, используемой в науках о палео. У меня был большой тренировочный набор, и поэтому я случайно (стратифицированная случайная выборка) отложил тестовый набор. Я подгонял различных методов к выборкам обучающих наборов и,...
Учитывая прогнозируемую переменную (P), случайный эффект (R) и фиксированный эффект (F), можно использовать две модели смешанных эффектов ( синтаксис lme4 ): m1 = lmer( P ~ (1|R) + F ) m2 = lmer( P ~ (1+F|R) + F) Насколько я понимаю, вторая модель - это та, которая позволяет фиксированному эффекту...
Модельные формулы в R, такие как y ~ x + a*b + c:d основаны на так называемой записи Уилкинсона : Уилкинсон и Роджерс 1973, Символическое описание факторных моделей для анализа отклонений . В этой статье не обсуждались нотации для смешанных моделей (которых тогда не могло быть). Так, где же...
Здравствуйте, статистические гуру и мастера программирования R, Я заинтересован в моделировании захвата животных в зависимости от условий окружающей среды и дня года. Как часть другого исследования, у меня есть подсчеты по ~ 160 дней за три года. В каждый из этих дней у меня есть температура,...
У меня проблемы с пониманием вывода моей lmer()модели. Это простая модель исходной переменной (Поддержка) с различными перехватами состояний / случайными эффектами состояний: mlm1 <- lmer(Support ~ (1 | State)) Результаты summary(mlm1): Linear mixed model fit by REML Formula: Support ~ (1 |...
Допустим, у нас есть модель mod <- Y ~ X*Condition + (X*Condition|subject) # Y = logit variable # X = continuous variable # Condition = values A and B, dummy coded; the design is repeated # so all participants go through both Conditions # subject = random effects for different subjects...
Различные описания по выбору модели на случайные эффекты линейных смешанных моделей инструктируют использовать REML. Я знаю разницу между REML и ML на некотором уровне, но я не понимаю, почему REML следует использовать, потому что ML смещен. Например, неправильно ли проводить LRT для параметра...
Я недавно использовал MCMCglmmпакет. Меня смущает то, что в документации упоминается как R-структура и G-структура. Похоже, что они связаны со случайными эффектами - в частности, указанием параметров для предварительного распределения по ним, но обсуждение в документации, похоже, предполагает, что...
У меня есть набор данных, состоящий из серии ежемесячных подсчетов случаев «сломанной палки» с нескольких сайтов. Я пытаюсь получить единую сводную оценку из двух разных методов: Техника 1: Установите «сломанную палку» с Poisson GLM с переменной индикатора 0/1 и используя переменную времени и...
У меня есть вопрос относительно правильной методики начальной загрузки для использования с данными, где присутствует сильная кластеризация. Мне было поручено оценить многомерную модель прогнозирования смешанных эффектов для данных страховых требований путем оценки текущей базовой модели на более...
Я хотел бы сравнить выходные данные lmer (действительно glmer) с примером игрушечного бинома. Я прочитал виньетки и, кажется, понимаю, что происходит. Но, видимо, я не. Застряв, я исправил «правду» в терминах случайных эффектов и пошел оценивать только фиксированные эффекты. Я включаю этот код...
Я неплохо знаком с моделями смешанных эффектов (MEM), но недавно один из коллег спросил меня, как они соотносятся с моделями скрытого роста (LGM). Я немного погуглил, и кажется, что LGM - это вариант моделирования структурных уравнений, который применяется к обстоятельствам, когда повторяющиеся...
Тесты перестановки (также называемые тестом рандомизации, тестом повторной рандомизации или точным тестом) очень полезны и оказываются полезными, когда предположение о нормальном распределении, требуемое, например, t-testне выполняется, и когда преобразование значений путем ранжирования...
Я пытаюсь использовать lme4::glmer()для подгонки биномиальной обобщенной смешанной модели (GLMM) с зависимой переменной, которая является не двоичной, а непрерывной переменной от нуля до единицы. Можно думать об этой переменной как о вероятности; на самом деле это вероятность того, как сообщили...
У меня есть вопрос относительно использования группирующей переменной в нелинейной модели. Поскольку функция nls () не учитывает факторные переменные, я изо всех сил пытался выяснить, можно ли проверить влияние фактора на подбор модели. Ниже я привел пример, где я хочу приспособить модель роста...
Одна из проблем, с которыми я всегда сталкивался при работе со смешанными моделями, это выяснение визуализаций данных - таких, которые могут оказаться на бумаге или плакате, - как только кто-то получит результаты. Сейчас я работаю над моделью смешанных эффектов Пуассона с формулой, которая выглядит...