Вопросы с тегом «mixed-model»

34
Разница между обобщенными линейными моделями и обобщенными линейными смешанными моделями

Мне интересно, в чем различия между смешанными и несмешанными GLM. Например, в SPSS раскрывающееся меню позволяет пользователям выбрать: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models & analyze-> mixed models-> generalized linear Они имеют дело с отсутствующими...

34
Модель смешанных эффектов с вложенностью

У меня есть данные, собранные из эксперимента, организованного следующим образом: Два участка, каждый с 30 деревьями. 15 лечат, 15 контролируют на каждом участке. Из каждого дерева мы отбираем три куска ствола и три куска корней, так что по 6 образцов первого уровня на дерево, которое представлено...

32
Как мне соответствовать многоуровневой модели для перераспределенных результатов по пуассону?

Я хочу установить многоуровневый GLMM с распределением Пуассона (с избыточной дисперсией), используя R. В настоящее время я использую lme4, но я заметил, что недавно quasipoissonсемейство было удалено. В другом месте я видел, что вы можете моделировать аддитивную избыточную дисперсию для...

32
Отклонение от суммы прогнозируемых значений из модели со смешанным эффектом для временных рядов

У меня есть модель смешанного эффекта (фактически обобщенная аддитивная смешанная модель), которая дает мне прогнозы для временных рядов. Чтобы противодействовать автокорреляции, я использую модель corCAR1, учитывая тот факт, что у меня отсутствуют данные. Предполагается, что данные дают мне полную...

31
Многократные сравнения на модели смешанных эффектов

Я пытаюсь проанализировать некоторые данные, используя модель смешанного эффекта. Собранные мной данные показывают вес некоторых молодых животных с различным генотипом с течением времени. Я использую предлагаемый здесь подход:...

30
Что делает команда anova () с объектом модели lmer?

Надеюсь, что это вопрос, который кто-то здесь может ответить для меня о природе разложения сумм квадратов из модели смешанных эффектов lmer(из пакета lme4 R). Прежде всего я должен сказать, что мне известно о противоречиях с использованием этого подхода, и на практике я бы с большей вероятностью...

30
Сравнение Lme и Lmer

Мне было интересно, сможет ли кто-нибудь рассказать мне о текущих различиях между этими двумя функциями. Я нашел следующий вопрос: Как выбрать библиотеку nlme или lme4 R для моделей со смешанными эффектами? , но это происходит пару лет назад. Это жизнь в кругах программного обеспечения. Мои...

28
Вычисление повторяемости эффектов по модели Лмера

Я только что наткнулся на эту статью , в которой описывается, как вычислить повторяемость (или надежность, или внутриклассовую корреляцию) измерения с помощью моделирования смешанных эффектов. Код R будет: #fit the model fit = lmer(dv~(1|unit),data=my_data) #obtain the variance estimates vc =...

28
Как получить «общее» значение p и величину эффекта для категориального фактора в смешанной модели (lme4)?

Я хотел бы получить p-значение и величину эффекта независимой категориальной переменной (с несколькими уровнями) - то есть «в целом», а не для каждого уровня в отдельности, как нормальный вывод из lme4R. Это так же, как то, о чем люди сообщают при запуске ANOVA. Как я могу получить...

28
Как интерпретировать дисперсию и корреляцию случайных эффектов в модели смешанных эффектов?

Я надеюсь, что вы все не возражаете против этого вопроса, но мне нужна помощь в интерпретации выходных данных для выходных данных модели линейных смешанных эффектов, которые я пытался научиться делать в R. Я новичок в продольном анализе данных и регрессии линейных смешанных эффектов. У меня есть...

27
В чем разница между обобщенными оценочными уравнениями и GLMM?

Я запускаю GEE на 3-уровневых несбалансированных данных, используя ссылку logit. Как это отличается (с точки зрения выводов, которые я могу сделать, и значения коэффициентов) от GLM со смешанными эффектами (GLMM) и логит-связью? Более подробно: наблюдения представляют собой одиночные испытания...

27
Пример отчетов для смешанного модельного анализа с использованием lmer в биологии, психологии и медицине?

Поскольку общий консенсус, по-видимому, заключается в использовании смешанных моделей через lmer()R вместо классического ANOVA (по часто упоминаемым причинам, таким как несбалансированные схемы, перекрестные случайные эффекты и т. Д.), Я хотел бы попробовать его с моими данными. Однако меня...

27
функция предиката () для моделей со смешанными эффектами

Проблема: Я читал в других сообщениях, которые predictнедоступны для lmerмоделей со смешанными эффектами {lme4} в [R]. Я пытался исследовать эту тему с набором игрушечных данных ... Задний план: Набор данных адаптирован из этого источника и доступен как ... require(gsheet) data <- read.csv(text...

27
В многоуровневой модели, каковы практические значения оценки параметров корреляции случайных эффектов, а не оценки?

В многоуровневой модели, каковы практические и связанные с интерпретацией последствия оценки, а не оценки параметров корреляции случайных эффектов? Практическая причина спрашивать это состоит в том, что в структуре Лмера в R нет реализованного метода для оценки p-значений с помощью методов MCMC,...

26
Как проверить и избежать мультиколлинеарности в смешанной линейной модели?

В настоящее время я использую линейные модели со смешанным эффектом. Я использую пакет "lme4" в R. Мои модели принимают форму: model <- lmer(response ~ predictor1 + predictor2 + (1 | random effect)) Перед запуском моих моделей я проверил возможную мультиколлинеарность между предикторами. Я...

26
Правильно ли я указал свою модель в lmer?

Я просмотрел множество справочных сайтов и все еще не понимаю, как указать более сложные вложенные термины в смешанной модели. Меня также смущает использование :и /и |при указании взаимодействий и вложений со случайными факторами, использующимися lmer()в lme4пакете в R. Для целей этого вопроса...

26
Каково минимальное рекомендуемое количество групп для фактора случайных эффектов?

Я использую смешанную модель в R( lme4) для анализа некоторых данных повторных измерений. У меня есть переменная реакции (содержание волокна в кале) и 3 фиксированных эффекта (масса тела и т. Д.). В моем исследовании всего 6 участников, по 16 повторных измерений для каждого (хотя у двух только 12...

26
Как я могу интерпретировать «корреляции фиксированных эффектов» в моем блеске?

У меня есть следующий вывод: Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS2 +sAG2 +sSHDI2 +sbare +season +crop +(1|landscape) AIC BIC logLik deviance 4062 4093 -2022 4044 Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. landscape (Intercept) 0.82453 0.90804...

26
Какова математическая разница между случайными и фиксированными эффектами?

Я нашел много в интернете относительно интерпретации случайных и фиксированных эффектов. Однако я не мог получить источник, фиксирующий следующее: Какова математическая разница между случайными и фиксированными эффектами? Под этим я подразумеваю математическую формулировку модели и способ оценки...

25
Аппроксимации Саттертвейта и Кенварда-Роджера для степеней свободы в смешанных моделях

lmerTestПакет предоставляет anova()функцию для линейных смешанных моделей с необязательно приближением Саттервейта ( по умолчанию) или Кенворд-Роже степеней свободы (DF). В чем разница между этими двумя подходами? Когда выбрать...