Вопросы с тегом «mixed-model»

Проще говоря, как бы вы объяснили (возможно, простыми примерами) разницу между моделями с фиксированным, случайным и смешанным эффектами?

На этом форуме много обсуждается вопрос о том, как правильно указать различные иерархические модели lmer. Я думал, что было бы здорово иметь всю информацию в одном месте. Пара вопросов для начала: Как указать несколько уровней, где одна группа вложена в другую: это (1|group1:group2)или нет...

Вот как я понял вложенные и скрещенные случайные эффекты: Вложенные случайные эффекты возникают, когда фактор более низкого уровня появляется только в пределах определенного уровня фактора более высокого уровня. Например, ученики в классах в определенный момент времени. В lme4Я думал , что мы...

Если мы подгоняем блеск, мы можем получить предупреждение, которое говорит нам, что модели трудно сойтись ... например >Warning message: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, : Model failed to converge with max|grad| = 0.00389462 (tol = 0.001) Другой способ...

У меня подходят несколько смешанных моделей эффектов ( в частности , продольные модели) с использованием lme4в Rно хотел бы, чтобы действительно мастер модели и код , который идет с ними. Однако, прежде чем погрузиться обеими ногами (и купить несколько книг), я хочу убедиться, что я изучаю...

Я прочитал в реферате этой статьи, что: «Процедура максимального правдоподобия (ML) в Hartley aud Rao модифицируется путем адаптации преобразования Паттерсона и Томпсона, которое делит нормальность правдоподобия на две части, одна из которых не имеет фиксированных эффектов. Максимизация этой части...

Рассмотрим следующие три явления. Парадокс Штейна: учитывая некоторые данные из многомерного нормального распределения в Rn,n≥3Rn,n≥3\mathbb R^n, \: n\ge 3 , среднее значение выборки не очень хорошая оценка истинного среднего. Можно получить оценку с меньшей среднеквадратичной ошибкой, если...

Я довольно долго использовал модели смешанных эффектов с продольными данными. Хотелось бы, чтобы я соответствовал отношениям AR в lmer (думаю, я прав, что не могу этого сделать?), Но я не думаю, что это отчаянно важно, поэтому я не слишком беспокоюсь. Я только что натолкнулся на обобщенные...

Я использую lme4 в R, чтобы соответствовать смешанной модели lmer(value~status+(1|experiment))) где значение непрерывно, статус и эксперимент являются факторами, и я получаю Linear mixed model fit by REML Formula: value ~ status + (1 | experiment) AIC BIC logLik deviance REMLdev 29.1 46.98 -9.548...

Недавно я измерил, как значение нового слова приобретается после многократных воздействий (практика: день с 1 по 10) путем измерения ERP (ЭЭГ), когда слово рассматривалось в разных контекстах. Я также контролировал свойства контекста, например, его полезность для открытия нового значения слова...

Мне интересно, имеет ли это значение при интерпретации того, являются ли логически преобразованными только зависимые, как зависимые, так и независимые, или только независимые переменные. Рассмотрим случай log(DV) = Intercept + B1*IV + Error Я могу интерпретировать IV как процентное увеличение, но...

РЕДАКТИРОВАТЬ 2: Первоначально я думал, что мне нужно запустить двухфакторный ANOVA с повторными измерениями на один фактор, но теперь я думаю, что линейная модель смешанного эффекта будет работать лучше для моих данных. Я думаю, что почти знаю, что должно произойти, но все еще смущен несколькими...

Я рассчитал AIC и AICc для сравнения двух общих линейных смешанных моделей; AIC положительны с моделью 1, имеющей более низкий AIC, чем модель 2. Однако оба значения AICc являются отрицательными (модель 1 по-прежнему <модель 2). Допустимо ли использовать и сравнивать отрицательные значения...

Я в настоящее время использую пакет R lme4 . Я использую линейные модели смешанных эффектов со случайными эффектами: library(lme4) mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect + # random effects...

Я хочу получить интервал прогнозирования вокруг прогноза из модели lmer (). Я нашел некоторое обсуждение по этому поводу: http://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/24365_2803ab8299934e888a60e7b16113f619.html http://glmm.wikidot.com/faq но они, похоже, не учитывают неопределенность случайных...

При каких условиях следует рассмотреть возможность использования многоуровневого / иерархического анализа в отличие от более базового / традиционного анализа (например, ANOVA, регрессия OLS и т. Д.)? Есть ли ситуации, в которых это можно считать обязательным? Существуют ли ситуации, в которых...

EffectsПакет предоставляет очень быстрый и удобный способ для построения результатов линейной модели смешанного эффекта, полученных с помощью lme4пакета . В effectфункции вычисляет доверительные интервалы (ДИ) очень быстро, но , как заслуживающие доверия этих доверительные интервалы? Например:...

Недавно я понял, что смешанная модель с единственным субъектом в качестве случайного фактора и другими факторами в качестве фиксированных факторов эквивалентна ANOVA при настройке корреляционной структуры смешанной модели на составную симметрию. Поэтому я хотел бы знать, что означает составная...

Я пытаюсь понять, когда использовать случайный эффект, а когда он не нужен. Мне сказали, что эмпирическое правило, если у вас есть 4 или более групп / отдельных лиц, которые я делаю (15 отдельных лосей). Некоторые из этих лосей были эксперименты 2 или 3 раза в общей сложности 29 испытаний. Я хочу...

У меня есть данные, собранные из эксперимента, организованного следующим образом: Два участка, каждый с 30 деревьями. 15 лечат, 15 контролируют на каждом участке. Из каждого дерева мы отбираем три куска ствола и три куска корней, так что по 6 образцов первого уровня на дерево, которое представлено...