Вопросы с тегом «intraclass-correlation»

28

Вычисление повторяемости эффектов по модели Лмера

Я только что наткнулся на эту статью , в которой описывается, как вычислить повторяемость (или надежность, или внутриклассовую корреляцию) измерения с помощью моделирования смешанных эффектов. Код R будет: #fit the model fit = lmer(dv~(1|unit),data=my_data) #obtain the variance estimates vc =...

mixed-model reliability intraclass-correlation repeatability spss factor-analysis survey modeling cross-validation error curve-fitting mediation correlation clustering sampling machine-learning probability classification metric r project-management optimization svm python dataset quality-control checking clustering distributions anova factor-analysis exponential poisson-distribution generalized-linear-model deviance machine-learning k-nearest-neighbour r hypothesis-testing t-test r variance levenes-test bayesian software bayesian-network regression repeated-measures least-squares change-scores variance chi-squared variance nonlinear-regression regression-coefficients multiple-comparisons p-value r statistical-significance excel sampling sample r distributions interpretation goodness-of-fit normality-assumption probability self-study distributions references theory time-series clustering econometrics binomial hypothesis-testing variance t-test paired-comparisons statistical-significance ab-test r references hypothesis-testing t-test normality-assumption wilcoxon-mann-whitney central-limit-theorem t-test data-visualization interactive-visualization goodness-of-fit

22

Внутриклассная корреляция (ICC) для взаимодействия?

Предположим, у меня есть некоторые измерения для каждого предмета на каждом сайте. Две переменные, субъект и сайт, представляют интерес с точки зрения вычисления значений внутриклассовой корреляции (ICC). Обычно я использую функцию lmerиз пакета R lme4и запускаю lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject)...

r lme4-nlme intraclass-correlation

21

Показано, что 100 измерений для 5 предметов дают гораздо меньше информации, чем 5 измерений для 100 предметов

На конференции я услышал следующее утверждение: 100 измерений для 5 предметов дают гораздо меньше информации, чем 5 измерений для 100 предметов. Очевидно, что это правда, но мне было интересно, как можно это доказать математически ... Я думаю, что можно использовать линейную смешанную модель. Тем...

mixed-model variance repeated-measures sample-size intraclass-correlation

20

Каковы правильные значения для точности и отзыва в крайних случаях?

Точность определяется как: p = true positives / (true positives + false positives) Является ли это исправить , что, как true positivesи false positivesподход 0, точность приближается к 1? Тот же вопрос для отзыва: r = true positives / (true positives + false negatives) В настоящее время я выполняю...

precision-recall data-visualization logarithm references r networks data-visualization standard-deviation probability binomial negative-binomial r categorical-data aggregation plyr survival python regression r t-test bayesian logistic data-transformation confidence-interval t-test interpretation distributions data-visualization pca genetics r finance maximum probability standard-deviation probability r information-theory references computational-statistics computing references engineering-statistics t-test hypothesis-testing independence definition r censoring negative-binomial poisson-distribution variance mixed-model correlation intraclass-correlation aggregation interpretation effect-size hypothesis-testing goodness-of-fit normality-assumption small-sample distributions regression normality-assumption t-test anova confidence-interval z-statistic finance hypothesis-testing mean model-selection information-geometry bayesian frequentist terminology type-i-and-ii-errors cross-validation smoothing splines data-transformation normality-assumption variance-stabilizing r spss stata python correlation logistic logit link-function regression predictor pca factor-analysis r bayesian maximum-likelihood mcmc conditional-probability statistical-significance chi-squared proportion estimation error shrinkage application steins-phenomenon

18

Большое расхождение в оценке наклона, когда группы рассматриваются как случайные и фиксированные в смешанной модели

Я понимаю, что мы используем модели случайных эффектов (или смешанных эффектов), когда считаем, что некоторые параметры модели изменяются случайным образом в зависимости от некоторого фактора группировки. У меня есть желание подогнать модель, в которой ответ был нормализован и центрирован (не...

mixed-model random-effects-model fixed-effects-model lme4-nlme intraclass-correlation

15

Точность градиентной машины уменьшается с увеличением числа итераций

Я экспериментирую с алгоритмом машины повышения градиента через caretпакет в R. Используя небольшой набор данных для поступления в колледж, я запустил следующий код: library(caret) ### Load admissions dataset. ### mydata <- read.csv("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/binary.csv") ### Create...

machine-learning caret boosting gbm hypothesis-testing t-test panel-data psychometrics intraclass-correlation generalized-linear-model categorical-data binomial model intercept causality cross-correlation distributions ranks p-value z-test sign-test time-series references terminology cross-correlation definition probability distributions beta-distribution inverse-gamma missing-data paired-comparisons paired-data clustered-standard-errors cluster-sample time-series arima logistic binary-data odds-ratio medicine hypothesis-testing wilcoxon-mann-whitney unsupervised-learning hierarchical-clustering neural-networks train clustering k-means regression ordinal-data change-scores machine-learning experiment-design roc precision-recall auc stata multilevel-analysis regression fitting nonlinear jmp r data-visualization gam gamm4 r lme4-nlme many-categories regression causality instrumental-variables endogeneity controlling-for-a-variable

13

Внутриклассные коэффициенты корреляции (ICC) с несколькими переменными

Предположим, я измерил некоторую переменную у братьев и сестер, которые вложены в семьи. Структура данных выглядит следующим образом: семейный брат ------ ------- ----- 1 1 год_11 1 2 год_12 2 1 год_21 2 2 y_22 2 3 y_23 ... ... ... Я хочу знать корреляцию между измерениями, сделанными на братьях и...

mixed-model intraclass-correlation

12

ICC как ожидаемая корреляция между двумя случайно выбранными единицами, которые находятся в одной группе

В многоуровневом моделировании внутриклассовая корреляция часто рассчитывается по ANOVA со случайными эффектами yij=γ00+uj+eijyij=γ00+uj+eij y_{ij} = \gamma_{00} + u_j + e_{ij} где - остатки уровня 2, а - остатки уровня 1. Затем мы получаем оценки и для дисперсии и соответственно и включаем их в...

correlation mixed-model intraclass-correlation

11

Сравнение коэффициентов корреляции

У меня есть два набора данных, где у меня есть ~ 250.000 значений для 78 и 35 образцов. Некоторые образцы являются членами семьи, и это может повлиять на данные. Я рассчитал парную корреляцию, и она варьируется между 0,7 и 0,95, но я хотел бы знать, есть ли существенная разница в коэффициентах...

correlation cross-correlation intraclass-correlation

10

Коэффициент внутриклассовой корреляции против F-критерия (односторонний ANOVA)?

Я немного запутался в отношении коэффициента внутриклассовой корреляции и одностороннего ANOVA. Насколько я понимаю, оба рассказывают, насколько похожи наблюдения внутри группы по сравнению с наблюдениями в других группах. Может ли кто-то объяснить это немного лучше и, возможно, объяснить ситуацию,...

anova psychometrics reliability intraclass-correlation

10

Как мне включить инновационный выброс при наблюдении 48 в мою модель ARIMA?

Я работаю над набором данных. После использования некоторых методов идентификации моделей я разработал модель ARIMA (0,2,1). Я использовал detectIOфункцию в пакете TSAв R, чтобы обнаружить инновационный выброс (IO) на 48-м наблюдении за моим исходным набором данных. Как включить этот выброс в мою...

r time-series arima outliers hypergeometric fishers-exact r time-series intraclass-correlation r logistic glmm clogit mixed-model spss repeated-measures ancova machine-learning python scikit-learn distributions data-transformation stochastic-processes web standard-deviation r machine-learning spatial similarities spatio-temporal binomial sparse poisson-process r regression nonparametric r regression logistic simulation power-analysis r svm random-forest anova repeated-measures manova regression statistical-significance cross-validation group-differences model-comparison r spatial model-evaluation parallel-computing generalized-least-squares r stata fitting mixture hypothesis-testing categorical-data hypothesis-testing anova statistical-significance repeated-measures likert wilcoxon-mann-whitney boxplot statistical-significance confidence-interval forecasting prediction-interval regression categorical-data stata least-squares experiment-design skewness reliability cronbachs-alpha r regression splines maximum-likelihood modeling likelihood-ratio profile-likelihood nested-models

10

Коэффициент внутриклассовой корреляции в смешанной модели со случайными наклонами

У меня есть следующие модели m_plotснабжены lme4::lmerсо скрещенными случайными эффектами для участников ( lfdn) и элементов ( content): Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. Corr lfdn (Intercept) 172.173 13.121 role1 62.351 7.896 0.03 inference1 24.640 4.964 0.08 -0.30 inference2 52.366...

mixed-model lme4-nlme intraclass-correlation