Вопросы с тегом «mcmc»

11
Почему существуют рекомендации против использования Jeffreys или энтропийных априоров для сэмплеров MCMC?

На своей вики-странице разработчики Стэна заявляют: Некоторые принципы нам не нравятся: инвариантность, Джеффрис, энтропия Вместо этого я вижу много нормальных рекомендаций по распространению. До сих пор я использовал байесовские методы, которые не основывались на выборке, и был отчасти рад, что...

10
Учитывая цепочку 10D MCMC, как я могу определить ее апостериорные моды в R?

Вопрос: С 10-мерной цепочкой MCMC, скажем, я готов передать вам матрицу розыгрышей: 100 000 итераций (строк) по 10 параметрам (столбцам), как лучше всего определить апостериорные моды? Я особенно обеспокоен несколькими режимами. Фон:Я считаю себя статистически подкованным статистиком, но когда...

10
Генерация случайных многомерных значений из эмпирических данных

Я работаю над функцией Монте-Карло для оценки нескольких активов с частично коррелированной доходностью. В настоящее время я просто генерирую ковариационную матрицу и подаю rmvnorm()функцию в R. (Генерирует коррелированные случайные значения.) Однако, глядя на распределение доходности актива, он...

10
Цензура / Усечение в ЯГС

У меня есть вопрос о том, как вписать проблему цензуры в JAGS. Я наблюдаю нормальную двумерную смесь, где значения Х имеют погрешность измерения. Я хотел бы смоделировать истинные базовые «средства» наблюдаемых цензурированных значений. ⌈ хт т у й+ ϵ ⌉ = xО Ь сек е г V е г ε ~ N( 0 , с д= .5...

10
Использование MCMC для оценки ожидаемого значения многомерной функции

Я работаю над исследовательским проектом, который связан с оптимизацией, и недавно у меня появилась идея использовать MCMC в этих условиях. К сожалению, я довольно плохо знаком с методами MCMC, поэтому у меня было несколько вопросов. Я начну с описания проблемы, а затем задам свои вопросы. Наша...

10
R линейная регрессия категориальной переменной «скрытое» значение

Это всего лишь пример, с которым я сталкивался несколько раз, поэтому у меня нет примеров данных. Запуск модели линейной регрессии в R: a.lm = lm(Y ~ x1 + x2) x1является непрерывной переменной x2является категориальным и имеет три значения, например, «Низкий», «Средний» и «Высокий». Однако вывод,...

10
Учебник по выводу Метрополиса-Гастингса и Гиббса

У меня довольно хороший практический опыт работы с выборками Метрополиса-Гастингса и Гиббса, но я хочу получить лучшее математическое понимание этих алгоритмов. Какие есть хорошие учебники или статьи, которые доказывают правильность этих сэмплеров (больше алгоритмов также было бы...

10
Winbugs и другие MCMC без информации для предварительного распространения

Что происходит, когда у вас нет представления о распределении параметров? Какой подход мы должны использовать? В большинстве случаев мы стремимся недооценивать, влияет ли определенная переменная на наличие / отсутствие определенного вида, и принимается или нет переменная в соответствии с важностью...

10
Можно ли использовать итерации MCMC после прожига для оценки плотности?

После записи можно ли напрямую использовать итерации MCMC для оценки плотности, например, путем построения гистограммы или оценки плотности ядра? Меня беспокоит то, что итерации MCMC не обязательно независимы, хотя в большинстве случаев они распределены одинаково. Что если мы дополнительно применим...

10
Является ли выборка на основе цепей Маркова «лучшей» для выборки Монте-Карло? Существуют ли альтернативные схемы?

Марковская цепь Монте-Карло - это метод, основанный на цепях Маркова, который позволяет нам получать выборки (в условиях Монте-Карло) из нестандартных распределений, из которых мы не можем напрямую брать выборки. Мой вопрос заключается в том, почему цепь Маркова является «современной» для отбора...

10
Управление высокой автокорреляцией в MCMC

Я строю довольно сложную иерархическую байесовскую модель для мета-анализа с использованием R и JAGS. Упрощенно, два ключевых уровня модели имеют α j = ∑ h γ h ( j ) + ϵ j, где y i j - i- е наблюдение за конечной точкой (в данном случае , GM против урожайности не-GM культур) в исследовании j , α j...

10
Как сделать выборку из дискретного распределения по неотрицательным целым числам?

У меня есть следующее дискретное распределение, где - известные константы:α,βα,β\alpha,\beta p(x;α,β)=Beta(α+1,β+x)Beta(α,β)for x=0,1,2,…p(x;α,β)=Beta(α+1,β+x)Beta(α,β)for x=0,1,2,… p(x;\alpha,\beta) = \frac{\text{Beta}(\alpha+1, \beta+x)}{\text{Beta}(\alpha,\beta)} \;\;\;\;\text{for } x =...

10
Предотвращение сбоя выборки по важности по Парето (PSIS-LOO)

Недавно я начал использовать перекрестную проверку сглаживания важности по Парето (PSIS-LOO), описанную в следующих статьях: Vehtari, A. & Gelman, A. (2015). Парето сгладил важность выборки. Препринт arXiv ( ссылка ). Вехтари А., Гельман А. и Габри Дж. (2016). Практическая оценка байесовской...

10
Существует ли реализованный пробоотборник Монте-Карло / MCMC, который может работать с изолированными локальными максимумами апостериорного распределения?

В настоящее время я использую байесовский подход для оценки параметров модели, состоящей из нескольких ODE. Поскольку у меня есть 15 параметров для оценки, мое пространство выборки является 15-мерным, и в моем поиске апостериорного распределения, по-видимому, имеется много локальных максимумов,...

10
Почему гамильтонова динамика лучше, чем предложение случайного блуждания в MCMC в некоторых случаях?

Гамильтонова динамика всегда превосходит случайное блуждание в алгоритме Метрополиса в некоторых случаях. Может ли кто-нибудь объяснить причину простыми словами без особой...

10
Распределение предложений для обобщенного нормального распределения

Я моделирую рассредоточение завода, используя обобщенное нормальное распределение ( запись в Википедии ), которое имеет функцию плотности вероятности: b2aΓ(1/b)e−(da)bb2aΓ(1/b)e−(da)b \frac{b}{2a\Gamma(1/b)} e^{-(\frac{d}{a})^b} где - пройденное расстояние, - параметр масштаба, а - параметр формы....

9
Рассчитать кривую ROC для данных

Итак, у меня есть 16 испытаний, в которых я пытаюсь идентифицировать человека по биометрической характеристике, используя расстояние Хэмминга. Мой порог установлен на 3,5. Мои данные ниже, и только пробная версия 1 является истинным положительным результатом: Trial Hamming Distance 1 0.34 2 0.37 3...

9
Показатели приемки для Метрополис-Гастингс с равномерным распределением кандидатов

При использовании алгоритма Метрополис-Гастингс с равномерным распределением кандидатов, какова причина того, что показатели приемлемости составляют около 20%? Мое мышление таково: если истинные (или близкие к истинным) значения параметров обнаружены, то новый набор значений параметров-кандидатов...

9
Путаница, связанная с выборкой Гиббса

Я наткнулся на эту статью, где говорится, что в выборке Гиббса принимается каждый образец. Я немного смущен. Как получится, если каждый принятый образец сходится к стационарному распределению. В общем Алгоритм Метрополиса мы принимаем как min (1, p (x *) / p (x)), где x * - точка выборки. Я...

9
Определение точки переключения с вероятностным программированием (pymc)

В настоящее время я читаю "книгу" вероятностного программирования и байесовских методов для хакеров . Я прочитал несколько глав, и я думал о первой главе, где первый пример с pymc состоит из обнаружения точки ведьмы в текстовых сообщениях. В этом примере случайная величина, указывающая, когда...