Вопросы с тегом «cox-model»

Регрессивная пропорциональная регрессия Кокса является полупараметрическим методом анализа выживаемости. Не нужно предполагать никакой формы распределения, только то, что эффект увеличения на одну единицу в ковариате является постоянным кратным.

38
Прогноз в регрессии Кокса

Я делаю многомерную регрессию Кокса, у меня есть значимые независимые переменные и бета-значения. Модель очень хорошо вписывается в мои данные. Теперь я хотел бы использовать мою модель и прогнозировать выживание нового наблюдения. Мне неясно, как это сделать с моделью Кокса. В линейной или...

30
Имеет ли регрессия Кокса основное распределение Пуассона?

Наша небольшая команда провела дискуссию и застряла. Кто-нибудь знает, имеет ли регрессия Кокса основное распределение Пуассона. У нас была дискуссия о том, что, возможно, регрессия Кокса с постоянным временем риска будет иметь сходство с регрессией Пуассона с устойчивой дисперсией. Любые...

24
В анализе выживаемости, почему мы используем полупараметрические модели (пропорциональные риски Кокса) вместо полностью параметрических моделей?

Этот вопрос был перенесен из Математического стека обмена, потому что на него можно ответить по перекрестной проверке. Мигрировал 6 лет назад . Я изучал модель пропорциональных рисков Кокса, и этот вопрос скрыт в большинстве текстов. Кокс предложил подгонку коэффициентов функции Хазарда с...

19
Исходная опасность Кокса

Допустим, у меня есть набор данных «почечный катетер». Я пытаюсь смоделировать кривую выживания, используя модель Кокса. Если я рассматриваю модель Кокса: мне нужна оценка базовой опасности. Используя встроенную функцию пакета R , я легко могу сделать это так:ч (t,Z) =h0exp(b'Z) ,h(T,Z)знак...

18
Какое значение «

Какое значение приведено в сводке модели Кокша в R? Например,R2R2R^2 Rsquare= 0.186 (max possible= 0.991 ) Я по глупости включил его в рукопись в качестве значения и рецензент вскочил на него, сказав, что он не знал об аналоге статистики из классической линейной регрессии, разрабатываемой для...

17
Зависящие от времени коэффициенты в R - как это сделать?

Обновление : Извините за другое обновление, но я нашел несколько возможных решений с дробными полиномами и конкурирующим пакетом риска, с которым мне нужна помощь. Проблема Я не могу найти простой способ сделать зависящий от времени анализ коэффициентов в R. Я хочу иметь возможность взять мой...

17
Как интерпретировать вывод предиката .coxph?

После подбора кокс-модели можно делать прогнозы и получать относительный риск новых данных. Что я не понимаю, так это то, как относительный риск рассчитывается для человека и к чему он относится (то есть для среднего населения)? Любые рекомендации по ресурсам, которые помогут понять (я не очень...

17
Почему значения р часто выше в модели пропорционального риска Кокса, чем в логистической регрессии?

Я узнал о модели пропорционального риска Кокса. У меня большой опыт подбора моделей логистической регрессии, и поэтому для построения интуиции я сравнивал модели, подходящие для использования coxphиз «выживания» R, с моделями логистической регрессии, подходящими для использования glmс...

15
Модель Кокса против логистической регрессии

Допустим, нам дали следующую проблему: Предскажите, какие клиенты, скорее всего, прекратят покупки в нашем магазине в ближайшие 3 месяца. Для каждого клиента мы знаем месяц, когда он начал покупать в нашем магазине, и, кроме того, у нас есть много поведенческих особенностей в ежемесячных агрегатах....

15
Какие варианты в модели пропорциональной регрессии рисков, когда остатки Шенфельда не хороши?

Я делаю пропорциональную регрессию рисков Кокса в R, используя coxphмножество переменных. Остатки Мартингейла выглядят великолепно, а остатки Шенфельда отлично подходят для ПОЧТИ всех переменных. Есть три переменные, чьи остатки Шенфельда не плоские, и природа переменных такова, что имеет смысл,...

14
Как получить прогнозы с точки зрения времени выживания из модели Кокса PH?

Я хочу разработать модель прогнозирования (Кокс-РН) для смертности от всех причин в наборе данных участников, из которых (почти) все умерли в конце периода наблюдения (например, 1 год). Вместо того, чтобы прогнозировать абсолютный риск смерти в определенный момент времени, я хотел бы предсказать...

13
Отличается ли подгонка модели Кокса со стратами и стратово-ковариатным взаимодействием от подгонки двух моделей Кокса?

В « Стратегиях регрессионного моделирования » Харрелла (второе издание) есть раздел (S. 20.1.7), в котором обсуждаются модели Кокса, включая взаимодействие между ковариатой, основное влияние которой на выживаемость мы также хотим оценить (возраст в примере ниже) и ковариация, основной эффект...

13
Пакет GBM против Карет с использованием GBM

Я занимался настройкой модели caret, но затем перезапустил модель, используя gbmпакет. Насколько я понимаю, caretпакет использует gbmи вывод должен быть одинаковым. Тем не менее, только быстрый запуск теста data(iris)показывает несоответствие в модели около 5% с использованием RMSE и R ^ 2 в...

13
Как сгенерировать предсказанные кривые выживших из слабых моделей (используя R coxph)?

Я хочу вычислить предсказанную функцию выживания для модели пропорциональных рисков Кокса с ненадежными терминами [используя пакет выживания]. Похоже, что когда в модели присутствуют слабые члены, предсказанная функция выживания не может быть вычислена. ## Example require(survival) data(rats) ##...

13
Как оценить базовую функцию опасности в модели Кокса с R

Мне нужно оценить базовую функцию риска λ0( т )λ0(T)\lambda_0(t) в зависящей от времени модели Кокса λ ( t ) = λ0( т ) опыт( Z( т )'β)λ(T)знак равноλ0(T)ехр⁡(Z(T)'β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Хотя я проходил курс «Выживание», я помню, что прямая производная функции кумулятивной...

13
Объяснение Леймана цензуры в анализе выживания

Я читал о том, что такое цензура и как ее следует учитывать при анализе выживания, но мне хотелось бы услышать менее математическое определение и более интуитивное определение (картинки были бы хорошими!). Может ли кто-нибудь дать мне объяснение 1) цензуры и 2) как это влияет на такие вещи, как...

13
Интерпретация и проверка модели регрессии пропорциональных рисков Кокса с использованием R на простом английском языке

Может кто-нибудь объяснить мне мою модель Кокса на простом английском? Я использовал следующую модель регрессии Кокса для всех моих данных, используя cphфункцию. Мои данные сохраняются в объекте под названием Data. Переменные w, xи yнепрерывны; zэто фактор двух уровней. Время измеряется месяцами. У...

13
Как модели машинного обучения (GBM, NN и т. Д.) Можно использовать для анализа выживания?

Я знаю, что традиционные статистические модели, такие как регрессия пропорциональных рисков Кокса и некоторые модели Каплана-Мейера, могут использоваться для прогнозирования дней до следующего возникновения события, скажем, провала и т. Д., Т. Е. Анализа выживания Вопросов Как можно использовать...

13
Как сообщить соотношение рисков из модели пропорциональных рисков Кокса на английском языке?

Насколько я понимаю, отношение рисков из модели пропорциональных рисков Кокса сравнивает влияние на степень опасности данного фактора с контрольной группой. Как бы вы сообщили об этом аудитории, которая не знает статистику? Попробуем привести пример. Скажем, мы включаем людей в исследование того,...

12
Как создать данные о выживании игрушек (время до события) с правильной цензурой

Я хочу создать данные о выживаемости игрушек (время до события), которые подвергаются цензуре и следуют некоторому распределению с пропорциональными опасностями и постоянной базовой опасностью. Я создал данные следующим образом, но я не могу получить расчетные коэффициенты опасности, близкие к...