Вопросы с тегом «bugs»

ОШИБКИ - это аббревиатура от байесовского вывода с использованием выборки Гиббса; BUGS также является программным пакетом для этого.

41
OpenBugs против JAGS

Я собираюсь опробовать среду стиля BUGS для оценки байесовских моделей. Есть ли какие-то важные преимущества при выборе между OpenBugs или JAGS? Может ли один заменить другой в обозримом будущем? Я буду использовать выбранный Gibbs Sampler с R. У меня пока нет конкретного приложения, но я решаю,...

31
Для каких распределений параметры параметризации в BUGS и R различны?

Я нашел несколько дистрибутивов, для которых BUGS и R имеют разные параметризации: Normal, log-Normal и Weibull. Для каждого из них я понимаю, что второй параметр, используемый R, необходимо преобразовать в обратном направлении (1 / параметр), прежде чем использовать в BUGS (или в моем случае...

29
Как работать с иерархическими / вложенными данными в машинном обучении

Я объясню мою проблему на примере. Предположим, вы хотите предсказать доход человека с учетом некоторых атрибутов: {Возраст, Пол, Страна, Регион, Город}. У вас есть тренировочный набор данных, как так train <- data.frame(CountryID=c(1,1,1,1, 2,2,2,2, 3,3,3,3), RegionID=c(1,1,1,2, 3,3,4,4,...

16
Как анализировать данные продольного счета: учет временной автокорреляции в GLMM?

Здравствуйте, статистические гуру и мастера программирования R, Я заинтересован в моделировании захвата животных в зависимости от условий окружающей среды и дня года. Как часть другого исследования, у меня есть подсчеты по ~ 160 дней за три года. В каждый из этих дней у меня есть температура,...

16
Байесовская оценка

Этот вопрос является техническим продолжением этого вопроса . У меня проблемы с пониманием и тиражированием модели, представленной в Raftery (1988): Вывод для биномиального параметра : иерархический байесовский подходNNN в WinBUGS / OpenBUGS / JAGS. Речь идет не только о коде, поэтому он должен...

14
Оптимальный программный пакет для байесовского анализа

Мне было интересно, какой пакет статистических программ вы, ребята, порекомендуете для выполнения байесовского вывода. Например, я знаю, что вы можете запускать openBUGS или winBUGS как автономные или вы также можете вызывать их из R. Но R также имеет несколько своих собственных пакетов (MCMCPack,...

13
R только альтернативы ошибок [закрыт]

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время он не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто 12 месяцев назад . Я слежу за курсом по байесовской статистике с использованием BUGS и R. Теперь я уже знаю BUGS,...

12
Критерии выбора «лучшей» модели в скрытой марковской модели

У меня есть набор данных временного ряда, к которому я пытаюсь подогнать скрытую марковскую модель (HMM), чтобы оценить количество скрытых состояний в данных. Мой псевдокод для этого следующий: for( i in 2 : max_number_of_states ){ ... calculate HMM with i states ... optimal_number_of_states =...

12
Какой метод мета-анализа сети является лучшим?

В настоящее время существует несколько различных подходов для выполнения сетевого мета-анализа или сравнения смешанного лечения. Наиболее часто используемые и доступные из них, вероятно, следующие: в байесовских рамках : подход взаимодействия дизайн-за-лечением в WinBUGS (например, Jackson et al );...

11
Как программы типа BUGS / JAGS автоматически определяют условные распределения для выборки Гиббса?

Похоже, что полные условия часто довольно трудно получить, но программы, такие как JAGS и BUGS, получают их автоматически. Может кто-нибудь объяснить, как они алгоритмически генерируют полные условия для любой произвольной спецификации...

10
Отсутствующие значения в переменной ответа в JAGS

Гельман и Хилл (2006) говорят: В ошибках, пропущенные результаты в регрессии могут быть легко обработаны, просто включив вектор данных, NA и все. Ошибка явно моделирует выходную переменную, и поэтому тривиально использовать эту модель, чтобы влиять на пропущенные значения на каждой итерации. Это...

10
Как получить прогноз для конкретной переменной в WinBUGS?

Я новый пользователь WinBUGS и у меня есть один вопрос для вашей помощи. После запуска следующего кода я получил параметры beta0сквозного beta4(статистика, плотность), но я не знаю, как получить прогноз последнего значения h, которое я установил NAдля моделирования в коде. Кто-нибудь может дать мне...

10
Winbugs и другие MCMC без информации для предварительного распространения

Что происходит, когда у вас нет представления о распределении параметров? Какой подход мы должны использовать? В большинстве случаев мы стремимся недооценивать, влияет ли определенная переменная на наличие / отсутствие определенного вида, и принимается или нет переменная в соответствии с важностью...

10
Как я могу смоделировать пропорции с BUGS / JAGS / STAN?

Я пытаюсь построить модель, в которой ответ является пропорцией (фактически это доля голосов, которую партия получает в избирательных округах). Его распределение не является нормальным, поэтому я решил смоделировать его с помощью бета-версии. У меня также есть несколько предикторов. Однако я не...

10
Модель истории дискретного времени (выживания) в R

Я пытаюсь вписать модель с дискретным временем в R, но я не уверен, как это сделать. Я читал, что вы можете организовать зависимую переменную в разных строках, по одной для каждого временного наблюдения, и использовать glmфункцию со ссылкой logit или cloglog. В этом смысле, у меня есть три колонки:...

10
Взвешенная обобщенная регрессия в BUGS, JAGS

В R«предварительном весе» мы можем glmрегрессировать через параметр весов . Например: glm.D93 <- glm(counts ~ outcome + treatment, family = poisson(), weights=w) Как это можно сделать в JAGSили BUGSмодели? Я нашел некоторые документы, обсуждающие это, но ни один из них не дает пример. Меня...

9
Как я могу сгенерировать график, похожий на тот, который создается plot.bugs и plot.jags из mcmc.list? [закрыто]

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время он не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто 2 года назад . R , кажется , чтобы иметь возможность вывод хороших краткие заговоры от bugsи jagsобъектов ,...