Вопросы с тегом «cox-model»

12
Точный критерий Фишера и гипергеометрическое распределение

Я хотел лучше понять точный критерий Фишера, поэтому я разработал следующий пример игрушки, где f и m соответствуют мужской и женской части, а n и y соответствуют «потреблению соды», например: > soda_gender f m n 0 5 y 5 0 Очевидно, это резкое упрощение, но я не хотел, чтобы контекст мешал....

fishers-exact hypergeometric clustering supervised-learning modeling econometrics r regression residuals heteroscedasticity independence distributions self-study matlab libsvm self-study conditional-probability conditional-expectation hypothesis-testing self-study multiple-comparisons mode statistical-significance chi-squared multiple-comparisons maximum-likelihood poisson-process optimization uncertainty genetic-algorithms bayesian model-selection overfitting maximum-likelihood optimization approximation r prediction model-evaluation r machine-learning survival neural-networks cox-model machine-learning bayesian bayesian-network hierarchical-bayesian pooling
11
Взвешивание показателя склонности в анализе Кокса PH и выборе ковариат

Относительно взвешивания по шкале склонности (IPTW) при моделировании пропорциональных рисков Кокса для данных о выживаемости от времени к событию: У меня есть проспективные данные реестра, где мы заинтересованы в том, чтобы посмотреть на эффект лечения от лекарств, которые в большинстве случаев...

r survival cox-model propensity-scores
11
Остатки Шенфельда

В модели пропорциональных рисков Кокса со многими переменными, если остатки Шенфельда не являются плоскими для одной из переменных, делает ли это недействительной всю модель или можно игнорировать только неэффективную переменную? То есть интерпретировать коэффициенты для других переменных, но не...

residuals cox-model schoenfeld-residuals
11
Как рассчитать прогнозируемые уровни опасности по модели Кокса PH?

У меня есть следующая модель Кокса PH: (Время, Событие) ~ X + Y + Z Я хотел бы получить оценки опасности скорости (я говорю о скоростях опасности НЕ опасности коэффициентов) даны конкретные значения X, Y, Z. Я знаю, что пакет muhaz R может рассчитывать наблюдаемые уровни опасности, но мне интересна...

r survival hazard cox-model
11
Как лучше всего анализировать данные о продолжительности пребывания в РКИ в больнице?

Мне интересно знать, существует ли консенсус относительно оптимального способа анализа данных о продолжительности пребывания в больнице (LOS) из РКИ. Это, как правило, распределение с очень правильным перекосом, при котором большинство пациентов выписывается в течение нескольких дней или недели, но...

t-test power skewness cox-model logrank
10
Сравнение CPH, модели времени ускоренного отказа или нейронных сетей для анализа выживаемости

Я новичок в анализе выживания, и недавно я узнал, что есть разные способы сделать это с определенной целью. Я заинтересован в фактической реализации и целесообразности этих методов. Мне представили традиционные модели пропорционального риска Кокса , модели времени ускоренного отказа и нейронные...

r machine-learning survival neural-networks cox-model
10
Есть ли функциональная разница между соотношением шансов и коэффициентом опасности?

В логистической регрессии отношение шансов 2 означает, что событие в 2 раза более вероятно, учитывая увеличение на одну единицу предиктора. В регрессии Кокса коэффициент опасности 2 означает, что событие будет происходить в два раза чаще в каждый момент времени с учетом увеличения предиктора на...

logistic cox-model odds-ratio hazard
10
R линейная регрессия категориальной переменной «скрытое» значение

Это всего лишь пример, с которым я сталкивался несколько раз, поэтому у меня нет примеров данных. Запуск модели линейной регрессии в R: a.lm = lm(Y ~ x1 + x2) x1является непрерывной переменной x2является категориальным и имеет три значения, например, «Низкий», «Средний» и «Высокий». Однако вывод,...

r regression categorical-data regression-coefficients categorical-encoding machine-learning random-forest anova spss r self-study bootstrap monte-carlo r multiple-regression partitioning neural-networks normalization machine-learning svm kernel-trick self-study survival cox-model repeated-measures survey likert correlation variance sampling meta-analysis anova independence sample assumptions bayesian covariance r regression time-series mathematical-statistics graphical-model machine-learning linear-model kernel-trick linear-algebra self-study moments function correlation spss probability confidence-interval sampling mean population r generalized-linear-model prediction offset data-visualization clustering sas cart binning sas logistic causality regression self-study standard-error r distributions r regression time-series multiple-regression python chi-squared independence sample clustering data-mining rapidminer probability stochastic-processes clustering binary-data dimensionality-reduction svd correspondence-analysis data-visualization excel c# hypothesis-testing econometrics survey rating composite regression least-squares mcmc markov-process kullback-leibler convergence predictive-models r regression anova confidence-interval survival cox-model hazard normal-distribution autoregressive mixed-model r mixed-model sas hypothesis-testing mediation interaction
10
Точно, как R coxph () обрабатывает повторные измерения?

контекст Я пытаюсь понять, как R coxph () принимает и обрабатывает повторяющиеся записи для субъектов (или пациента / клиента, если вы предпочитаете). Некоторые называют это длинным форматом, другие называют это «повторными измерениями». Посмотрите, например, набор данных, который включает столбец...

r repeated-measures survival cox-model frailty
9
Интервал цензурированной модели пропорциональных рисков Кокса в R

С учетом цензурированного интервала времени выживания, как я могу выполнить интервальную цензуру модели Кокса PH в R? Поиск в rseek обнаруживает пакет intcox, которого больше нет в Rхранилище. Я почти уверен, что coxphфункция в survivalпакете не может обрабатывать данные выживания с интервалом...

r survival cox-model interval-censoring
9
Структура данных и вызов функции для данных повторяющихся событий с переменными во времени

Я пытаюсь оценить влияние 2 препаратов ( drug1, drug2) на вероятность падения пациента ( event). Пациенты могут падать более одного раза и могут быть введены или сняты с лекарств в любой момент. Мой вопрос заключается в том, как данные должны быть структурированы с учетом периода времени (дней), в...

r survival cox-model
9
Как сравнить наблюдаемые и ожидаемые события?

Предположим, у меня есть одна выборка частот из 4 возможных событий: Event1 - 5 E2 - 1 E3 - 0 E4 - 12 и у меня есть ожидаемые вероятности того, что мои события произойдут: p1 - 0.2 p2 - 0.1 p3 - 0.1 p4 - 0.6 С суммой наблюдаемых частот моих четырех событий (18) я могу рассчитать ожидаемые частоты...

r statistical-significance chi-squared multivariate-analysis exponential joint-distribution statistical-significance self-study standard-deviation probability normal-distribution spss interpretation assumptions cox-model reporting cox-model statistical-significance reliability method-comparison classification boosting ensemble adaboost confidence-interval cross-validation prediction prediction-interval regression machine-learning svm regularization regression sampling survey probit matlab feature-selection information-theory mutual-information time-series forecasting simulation classification boosting ensemble adaboost normal-distribution multivariate-analysis covariance gini clustering text-mining distance-functions information-retrieval similarities regression logistic stata group-differences r anova confidence-interval repeated-measures r logistic lme4-nlme inference fiducial kalman-filter classification discriminant-analysis linear-algebra computing statistical-significance time-series panel-data missing-data uncertainty probability multivariate-analysis r classification spss k-means discriminant-analysis poisson-distribution average r random-forest importance probability conditional-probability distributions standard-deviation time-series machine-learning online forecasting r pca dataset data-visualization bayes distributions mathematical-statistics degrees-of-freedom
9
Как генерировать данные о выживаемости с зависимыми от времени ковариатами, используя R

Я хочу сгенерировать время выживания из модели пропорциональных рисков Кокса, которая содержит зависящий от времени ковариат. Модель h ( t | Xя) = ч0( т ) опыт( γИкся+ α мя( т ) )h(t|Xi)=h0(t)exp⁡(γXi+αmi(t))h(t|X_i) =h_0(t) \exp(\gamma X_i + \alpha m_{i}(t)) где генерируется из бинома (1,0.5) и m...

r survival cox-model time-varying-covariate
9
Модель пропорционального риска Кокса и интерпретация коэффициентов, когда задействовано взаимодействие в верхнем регистре

Вот краткий вывод использованной мною модели Кокша (я использовал R, и вывод основан на наилучшей конечной модели, т.е. включены все значимые объясняющие переменные и их взаимодействия): coxph(formula = Y ~ LT + Food + Temp2 + LT:Food + LT:Temp2 + Food:Temp2 + LT:Food:Temp2) #...

r interaction regression-coefficients cox-model
9
Модель пропорционального риска Кокса и не случайно выбранная выборка

Существуют ли методы для исправления смещения в модели пропорционального риска Кокса, вызванного неслучайно выбранной выборкой (что-то вроде коррекции Хекмана)? Справочная информация : Допустим, ситуация выглядит следующим образом: - В течение первых двух лет все клиенты принимаются. - После этих...

bias cox-model
9
Другой прогнозный график от выживаемости coxph и rms cph

Я создал свою немного улучшенную версию termplot, которую я использую в этом примере, вы можете найти ее здесь . Ранее я писал о SO, но чем больше я об этом думаю, тем больше думаю, что это скорее связано с интерпретацией модели пропорциональных рисков Кокса, чем с фактическим кодированием....

r survival cox-model
9
Как мне интерпретировать кривую выживания модели риска Кокса?

Как вы интерпретируете кривую выживания из модели пропорционального риска Кокса? В этом игрушечном примере предположим, что у нас есть модель пропорционального риска Кокса для ageпеременной в kidneyданных, и сгенерируем кривую выживания. library(survival) fit <- coxph(Surv(time, status)~age,...

r survival cox-model likelihood machine-learning deep-learning generative-models machine-learning reinforcement-learning q-learning regression multicollinearity convergence beta-distribution bernoulli-distribution machine-learning self-study pattern-recognition neural-networks stochastic-processes linear
9
Кривые Каплана-Мейера, кажется, говорят иначе, чем регрессия Кокса

В R я делаю анализ данных выживаемости больных раком. Я читал очень полезные материалы об анализе выживания в CrossValidated и других местах и ​​думаю, что понял, как интерпретировать результаты регрессии Кокса. Тем не менее, один результат по-прежнему меня беспокоит ... Я сравниваю выживание...

r survival cox-model kaplan-meier