Вопросы с тегом «survival»

10
Как сделать ROC-анализ в R с помощью модели Кокса

Я создал несколько моделей регрессии Кокса, и мне хотелось бы посмотреть, насколько хорошо работают эти модели, и я подумал, что, возможно, ROC-кривая или c-статистика могут быть полезны, как в этой статье: JN Armitage och JH van der Meulen, «Идентификация сопутствующей патологии у хирургических...

10
Проверка предположения о пропорциональной опасности в параметрических моделях

Мне известно о тестировании предположения о пропорциональной опасности в контексте моделей Кокса PH, но я не встречал ничего, связанного с параметрическими моделями? Есть ли реальный способ проверить предположение PH некоторых параметрических моделей? Кажется, что следует учитывать, что...

10
Модельное предложение для регрессии Кокса с зависимыми от времени ковариатами

Я моделирую влияние беременности на исход болезни (мертвый жив). Приблизительно 40% пациентов забеременели после постановки диагноза, но в разные моменты времени. До сих пор я делал графики КМ, показывающие явный защитный эффект беременности на выживаемость, а также обычную модель Кокса - однако...

10
Большая картина по анализу выживаемости и анализу данных о жизни

Я слышал об анализе выживания и анализе данных о жизни, но не совсем понимаю общую картину. Мне было интересно, какие темы они затрагивают? Это чистая статистика или просто применение статистики по какой-то конкретной области? Является ли анализ даты жизни частью анализа выживания? Спасибо и всего...

10
Модели дискретного времени опасности (cloglog) в R

survivalПакет вR появляешься , чтобы сосредоточиться на непрерывные моделях выживания времени. Я заинтересован в оценке версии пропорциональной модели риска с дискретным временем, дополнительной модели log-log. У меня довольно простая модель выживания с простой правильной цензурой. Я знаю, что...

10
Сравнение CPH, модели времени ускоренного отказа или нейронных сетей для анализа выживаемости

Я новичок в анализе выживания, и недавно я узнал, что есть разные способы сделать это с определенной целью. Я заинтересован в фактической реализации и целесообразности этих методов. Мне представили традиционные модели пропорционального риска Кокса , модели времени ускоренного отказа и нейронные...

10
Модель истории дискретного времени (выживания) в R

Я пытаюсь вписать модель с дискретным временем в R, но я не уверен, как это сделать. Я читал, что вы можете организовать зависимую переменную в разных строках, по одной для каждого временного наблюдения, и использовать glmфункцию со ссылкой logit или cloglog. В этом смысле, у меня есть три колонки:...

10
Проверьте, выпадают ли люди или уменьшают ставки после повторных проигрышей

У меня есть данные о серии выигрышных и проигрышных ставок за 5 раундов ставок с истощением после каждого раунда. Я использую дерево решений, подобное следующему, для отображения данных. Узлы к вершине дерева - это те, которые имеют выигрышные ставки, а узлы к нижней части дерева имеют ряд...

9
Как проверить чрезвычайно низкий уровень ошибок

Я столкнулся с попыткой продемонстрировать путем тестирования чрезвычайно низкого уровня ошибок для датчика (не более 1 ошибки в 1 000 000 попыток). У нас есть ограниченное время для проведения эксперимента, поэтому мы ожидаем, что не сможем получить более 4000 попыток. Я не вижу проблем,...

9
Другой прогнозный график от выживаемости coxph и rms cph

Я создал свою немного улучшенную версию termplot, которую я использую в этом примере, вы можете найти ее здесь . Ранее я писал о SO, но чем больше я об этом думаю, тем больше думаю, что это скорее связано с интерпретацией модели пропорциональных рисков Кокса, чем с фактическим кодированием....

9
Рассчитать кривую ROC для данных

Итак, у меня есть 16 испытаний, в которых я пытаюсь идентифицировать человека по биометрической характеристике, используя расстояние Хэмминга. Мой порог установлен на 3,5. Мои данные ниже, и только пробная версия 1 является истинным положительным результатом: Trial Hamming Distance 1 0.34 2 0.37 3...

9
Как определить, подходит ли модель выживания с отсутствующими данными?

Проще говоря, у меня есть около миллиона записей, которые записывают время входа и выхода людей в системе, охватывающей около десяти лет. У каждой записи есть время входа, но не у каждой записи есть время выхода. Среднее время в системе составляет ~ 1 год. Отсутствующие времена выхода происходят по...

9
Как выполнить ранговый тест Уилкоксона для данных о выживаемости в R?

Скажем, у вас есть данные о выживании, как это: obs <- data.frame( time = c(floor(runif(100) * 30), floor((runif(100)^2) * 30)), status = c(rbinom(100, 1, 0.2), rbinom(100, 1, 0.7)), group = gl(2,100) ) Чтобы выполнить стандартный тест ранга журнала, можно использовать survdiff(Surv(time,...

9
Модель случайных эффектов, обрабатывающая избыточность

Я пытаюсь иметь дело с анализом времени на событие, используя повторяющиеся двоичные результаты. Предположим, что время до события измеряется днями, но на данный момент мы делим время на недели. Я хочу приблизить оценку Каплана-Мейера (но учесть ковариаты), используя повторяющиеся двоичные...

9
Как оценить качество пригодности для жизненных функций

Я новичок в анализе выживания, хотя у меня есть некоторые знания в области классификации и регрессии. Для регрессии мы имеем статистику MSE и R square. Но как мы можем сказать, что модель выживания A превосходит модель выживания B помимо каких-то графических графиков (кривая КМ)? Если возможно,...

9
Как генерировать данные о выживаемости с зависимыми от времени ковариатами, используя R

Я хочу сгенерировать время выживания из модели пропорциональных рисков Кокса, которая содержит зависящий от времени ковариат. Модель h ( t | Xя) = ч0( т ) опыт( γИкся+ α мя( т ) )h(t|Xi)=h0(t)exp⁡(γXi+αmi(t))h(t|X_i) =h_0(t) \exp(\gamma X_i + \alpha m_{i}(t)) где генерируется из бинома (1,0.5) и m...

9
Анализ выживаемости, когда ковариаты недоступны для цензурированных данных

Я смотрю на время, необходимое судьям для принятия решений. Каждый судья оценивает количество заявителей и может одобрить или не одобрить заявку. Дело завершается, когда судья представляет свой отчет, который может быть через некоторое время после слушания. В конце периода исследования ряд дел все...

9
Интервал цензурированной модели пропорциональных рисков Кокса в R

С учетом цензурированного интервала времени выживания, как я могу выполнить интервальную цензуру модели Кокса PH в R? Поиск в rseek обнаруживает пакет intcox, которого больше нет в Rхранилище. Я почти уверен, что coxphфункция в survivalпакете не может обрабатывать данные выживания с интервалом...

9
Анализ выживания для прогнозирования событий

Для каждой записи в моих наборах данных у меня есть следующая информация (X1 ,… ,Xm ,δ ,T )(X1 ,… ,Xm ,δ ,T ) (X_1 \ , \dots \ , X_m \ , \delta \ , T \ ) где - объекты, - 1, если происходит целевое событие, и 0 в противном случае, а - отметка времени произошедшего события. В частности, может...

9
Регрессия Кокса и шкала времени

Всегда ли переменная Х (опасность) в регрессионном анализе пропорциональной опасности Кокса должна быть временем? Если нет, не могли бы вы привести пример? Может ли возраст больного раком быть переменной величиной? Если да, то можно ли это интерпретировать как риск заболеть раком в определенном...