Вопросы с тегом «survival»

17
Зависящие от времени коэффициенты в R - как это сделать?

Обновление : Извините за другое обновление, но я нашел несколько возможных решений с дробными полиномами и конкурирующим пакетом риска, с которым мне нужна помощь. Проблема Я не могу найти простой способ сделать зависящий от времени анализ коэффициентов в R. Я хочу иметь возможность взять мой...

16
Интуиция за уровнем опасности

Меня смущает уравнение, которое служит определением степени опасности. Я понимаю, что такое уровень опасности, но я просто не понимаю, как уравнение выражает эту интуицию. Если xxx - случайная величина, которая представляет момент времени смерти кого-либо на интервале времени [0,T][0,T][0,T] ....

16
Как рассчитать среднюю продолжительность приверженности вегетарианству, когда у нас есть только данные опросов о текущих вегетарианцах?

Была обследована случайная выборка населения. Их спросили, придерживаются ли они вегетарианской диеты. Если они ответили «да», их также попросили указать, как долго они питались вегетарианской диетой без перерыва. Я хочу использовать эти данные для расчета средней продолжительности приверженности...

15
Как сделать перекрестную проверку с помощью модели пропорциональных рисков Кокса?

Предположим, что я построил модель прогнозирования возникновения конкретной болезни в одном наборе данных (набор данных построения модели) и теперь хочу проверить, насколько хорошо модель работает в новом наборе данных (набор данных проверки). Для модели, построенной с логистической регрессией, я...

15
Модель Кокса против логистической регрессии

Допустим, нам дали следующую проблему: Предскажите, какие клиенты, скорее всего, прекратят покупки в нашем магазине в ближайшие 3 месяца. Для каждого клиента мы знаем месяц, когда он начал покупать в нашем магазине, и, кроме того, у нас есть много поведенческих особенностей в ежемесячных агрегатах....

15
Можно ли перевести соотношение рисков в медианы времени выживания?

В одной статье, описывающей результаты анализа выживаемости, я прочитал утверждение, которое подразумевает, что можно перевести отношение рисков (HR) в отношение средних времен выживания ( и ), используя формулу:М 2M1M1M_1M2M2M_2 ЧАСR = M1M2ЧАСрзнак равноM1M2HR = \frac{M_1}{M_2} Я уверен, что это...

15
Какова интуиция за сменными образцами при нулевой гипотезе?

Тесты перестановки (также называемые тестом рандомизации, тестом повторной рандомизации или точным тестом) очень полезны и оказываются полезными, когда предположение о нормальном распределении, требуемое, например, t-testне выполняется, и когда преобразование значений путем ранжирования...

14
Обучение, тестирование, валидация в задачах анализа выживания

Я просматривал различные темы здесь, но не думаю, что на мой точный вопрос дан ответ. У меня есть набор данных из ~ 50 000 студентов и их время для отсева. Я собираюсь выполнить пропорциональную регрессию рисков с большим количеством потенциальных ковариат. Я также собираюсь провести логистическую...

14
Как получить прогнозы с точки зрения времени выживания из модели Кокса PH?

Я хочу разработать модель прогнозирования (Кокс-РН) для смертности от всех причин в наборе данных участников, из которых (почти) все умерли в конце периода наблюдения (например, 1 год). Вместо того, чтобы прогнозировать абсолютный риск смерти в определенный момент времени, я хотел бы предсказать...

14
В чем разница между «coef» и «(exp) coef» выходом coxph в R?

Я пытался понять, что именно означает "coef" и "(exp) coef" coxph. Кажется, что "(exp) coef" - сравнение первой переменной в модели в соответствии с группой, назначенной в команде. Как функция coxph получает значения для "coef" и "(exp) coef"? Кроме того, как coxph определяет эти значения, когда...

13
Модель регрессии, чья переменная ответа - день года, когда происходит ежегодное событие (обычно)

В данном конкретном случае я имею в виду день замерзания озера. Эта дата «обледенения» встречается только один раз в год, но иногда вообще не происходит (если зима теплая). Таким образом, в один год озеро может замерзнуть в день 20 (20 января), а в другой год оно может вообще не замерзнуть. Цель...

13
Как модели машинного обучения (GBM, NN и т. Д.) Можно использовать для анализа выживания?

Я знаю, что традиционные статистические модели, такие как регрессия пропорциональных рисков Кокса и некоторые модели Каплана-Мейера, могут использоваться для прогнозирования дней до следующего возникновения события, скажем, провала и т. Д., Т. Е. Анализа выживания Вопросов Как можно использовать...

13
Пакет GBM против Карет с использованием GBM

Я занимался настройкой модели caret, но затем перезапустил модель, используя gbmпакет. Насколько я понимаю, caretпакет использует gbmи вывод должен быть одинаковым. Тем не менее, только быстрый запуск теста data(iris)показывает несоответствие в модели около 5% с использованием RMSE и R ^ 2 в...

13
Каковы различия между анализом выживаемости и регрессией Пуассона?

Я работаю над классической проблемой прогнозирования оттока, используя количество посещений сайта данным пользователем, и я подумал, что регрессия Пуассона была подходящим инструментом для моделирования будущего вовлечения этого пользователя. Когда я наткнулся на книгу об анализе выживания и...

13
Как сгенерировать предсказанные кривые выживших из слабых моделей (используя R coxph)?

Я хочу вычислить предсказанную функцию выживания для модели пропорциональных рисков Кокса с ненадежными терминами [используя пакет выживания]. Похоже, что когда в модели присутствуют слабые члены, предсказанная функция выживания не может быть вычислена. ## Example require(survival) data(rats) ##...

13
Отличается ли подгонка модели Кокса со стратами и стратово-ковариатным взаимодействием от подгонки двух моделей Кокса?

В « Стратегиях регрессионного моделирования » Харрелла (второе издание) есть раздел (S. 20.1.7), в котором обсуждаются модели Кокса, включая взаимодействие между ковариатой, основное влияние которой на выживаемость мы также хотим оценить (возраст в примере ниже) и ковариация, основной эффект...

13
Как оценить базовую функцию опасности в модели Кокса с R

Мне нужно оценить базовую функцию риска λ0( т )λ0(T)\lambda_0(t) в зависящей от времени модели Кокса λ ( t ) = λ0( т ) опыт( Z( т )'β)λ(T)знак равноλ0(T)ехр⁡(Z(T)'β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Хотя я проходил курс «Выживание», я помню, что прямая производная функции кумулятивной...

13
Объяснение Леймана цензуры в анализе выживания

Я читал о том, что такое цензура и как ее следует учитывать при анализе выживания, но мне хотелось бы услышать менее математическое определение и более интуитивное определение (картинки были бы хорошими!). Может ли кто-нибудь дать мне объяснение 1) цензуры и 2) как это влияет на такие вещи, как...

13
Интерпретация и проверка модели регрессии пропорциональных рисков Кокса с использованием R на простом английском языке

Может кто-нибудь объяснить мне мою модель Кокса на простом английском? Я использовал следующую модель регрессии Кокса для всех моих данных, используя cphфункцию. Мои данные сохраняются в объекте под названием Data. Переменные w, xи yнепрерывны; zэто фактор двух уровней. Время измеряется месяцами. У...

13
Как сообщить соотношение рисков из модели пропорциональных рисков Кокса на английском языке?

Насколько я понимаю, отношение рисков из модели пропорциональных рисков Кокса сравнивает влияние на степень опасности данного фактора с контрольной группой. Как бы вы сообщили об этом аудитории, которая не знает статистику? Попробуем привести пример. Скажем, мы включаем людей в исследование того,...