Дисциплина на перекрестке компьютерных наук и биологических наук, которая включает в себя организацию, хранение и анализ данных из таких областей, как молекулярная биология, генетика и геномика.
Я ищу ресурсы (учебные пособия, учебники, веб-трансляции и т. Д.), Чтобы узнать о цепи Маркова и HMM. Я работаю биологом, и в настоящее время я участвую в проекте, связанном с биоинформатикой. Кроме того, каковы необходимые математические знания, необходимые для достаточного понимания моделей...
Мне интересно, имеет ли это значение при интерпретации того, являются ли логически преобразованными только зависимые, как зависимые, так и независимые, или только независимые переменные. Рассмотрим случай log(DV) = Intercept + B1*IV + Error Я могу интерпретировать IV как процентное увеличение, но...
Я знаю, что мой вопрос / название не очень конкретны, поэтому я постараюсь прояснить это: Искусственные нейронные сети имеют относительно строгий дизайн. Конечно, как правило, они находятся под влиянием биологии и пытаются построить математическую модель реальных нейронных сетей, но нашего...
Отрицательное биномиальное (NB) распределение определяется на неотрицательных целых числах и имеет функцию вероятности массыИмеет ли смысл рассматривать непрерывное распределение на неотрицательных вещественных числах, определенных той же формулой (заменив k \ in \ mathbb N_0 на x \ in \ mathbb R _...
Совсем недавно я прочитал две статьи. Первый - об истории корреляции, а второй - о новом методе, названном максимальным информационным коэффициентом (MIC). Мне нужна ваша помощь, чтобы понять метод MIC для оценки нелинейных корреляций между переменными. Более того, инструкции по его использованию в...
Отрицательное биномиальное распределение стало популярной моделью для подсчета данных (в частности, ожидаемое количество считываний секвенирования в пределах данной области генома из данного эксперимента) в биоинформатике. Объяснения различаются: Некоторые объясняют это как то, что работает как...
У меня очень несбалансированный набор тестовых данных. Положительный набор состоит из 100 случаев, а отрицательный - 1500 случаев. Что касается обучения, у меня больше кандидатов: в наборе положительных тренировок 1200 случаев, а в наборе отрицательных - 12000 случаев. Для такого сценария у меня...
Это наивный вопрос от того, кто начинает изучать машинное обучение. Я читаю в эти дни книгу «Машинное обучение: алгоритмическая перспектива» от Марсленда. Я считаю ее полезной в качестве вводной книги, но теперь я хотел бы перейти к продвинутым алгоритмам, которые в настоящее время дают лучшие...
Я недавно закончил со степенью магистра по медицинскому и биологическому моделированию, сопровождаемый инженерной математикой в качестве фона. Несмотря на то, что моя образовательная программа включала в себя значительное количество курсов по математической статистике (список приведен ниже),...
Надеюсь, кто-то на этих форумах поможет мне с этой основной проблемой в исследованиях экспрессии генов. Я сделал глубокое секвенирование экспериментальной и контрольной ткани. Затем я получил значения кратного обогащения генов в экспериментальном образце для контроля. Эталонный геном имеет ~ 15 000...
Зачем использовать возраст и квадрат в качестве ковариат в исследовании генетической ассоциации? Я могу понять использование возраста, если он был определен как значимый ковариат, но я не знаю, как использовать возраст в...
Биологический Фон Со временем некоторые виды растений имеют тенденцию дублировать свои полные геномы, получая дополнительную копию каждого гена. Из-за нестабильности этой установки многие из этих генов затем удаляются, и геном перестраивается и стабилизируется, готовый к повторному дублированию....
Мы всегда говорим, что статистика имеет дело только с данными. Но мы также знаем, что информатика также получает знания от анализа данных. Например, биоинформатики могут полностью обходиться без биостатистики. Я хочу знать, в чем принципиальная разница между статистикой и...
У меня есть GLMM формы: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Когда я использую drop1(model, test="Chi"), я получаю другие результаты, чем если бы я использовал Anova(model, type="III")из пакета автомобиля или summary(model). Последние...
Примеры: у меня есть предложение в должностной инструкции: «Старший инженер Java в Великобритании». Я хочу использовать модель глубокого обучения, чтобы предсказать ее как 2 категории: English и IT jobs. Если я использую традиционную классификационную модель, она может предсказать только 1 метку с...