Вопросы с тегом «lme4-nlme»

Ради простого примера предположим, что есть две модели линейной регрессии Модель 1 имеет три предсказатели, x1a, x2b, иx2c Модель 2 имеет три предиктора из модели 1 и два дополнительных предиктора x2aиx2b Существует уравнение регрессии населения, где объясняется дисперсия населения для Модели 1 и...

Я анализирую результаты эксперимента времени реакции в R. Я провел повторные измерения ANOVA (1 внутри-субъектный фактор с 2 уровнями и 1 между субъектный фактор с 2 уровнями). Я запустил аналогичную линейную смешанную модель, и я хотел обобщить результаты lmer в виде таблицы ANOVA с использованием...

Какова структура дисперсии-ковариации по умолчанию для случайных эффектов в glmerили lmerв lme4пакете? Как определить другую дисперсионно-ковариационную структуру для случайных эффектов в коде? Я не мог найти информацию об этом в...

Формула, которую нужно указать для обучения многоуровневой модели (используя lmerиз lme4 Rбиблиотеки), всегда меня заводит. Я прочитал бесчисленные учебники и учебные пособия, но никогда не понимал это правильно. Итак, вот пример из этого урока, который я хотел бы видеть сформулированным в...

Я анализирую некоторые поведенческие данные, используя lme4in R, в основном следуя отличным учебникам Бодо Винтера , но не понимаю, правильно ли я обрабатываю взаимодействия. Хуже того, никто другой, участвующий в этом исследовании, не использует смешанные модели, поэтому я немного волнуюсь, чтобы...

У меня есть следующие модели m_plotснабжены lme4::lmerсо скрещенными случайными эффектами для участников ( lfdn) и элементов ( content): Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. Corr lfdn (Intercept) 172.173 13.121 role1 62.351 7.896 0.03 inference1 24.640 4.964 0.08 -0.30 inference2 52.366...

Учитывая три переменные, yи x, которые являются положительными непрерывными, и z, что является категориальным, у меня есть две модели кандидатов, заданные: fit.me <- lmer( y ~ 1 + x + ( 1 + x | factor(z) ) ) а также fit.fe <- lm( y ~ 1 + x ) Я надеюсь сравнить эти модели, чтобы определить,...

Я выполняю специальные тесты на линейной модели смешанных эффектов в R( lme4пакет). Я использую multcompпакет ( glht()функцию) для выполнения специальных тестов. Мой экспериментальный дизайн - повторные измерения со случайным эффектом блока. Модели указаны как: mymod <- lmer(variable ~ treatment...

Я анализирую данные отслеживания глаз из разработанного эксперимента. Упрощенная версия моих данных выглядит следующим образом (Вы можете получить данные dput () здесь ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 9 Face 90 6 9...

В lmerфункции lme4in in Rесть вызов для построения модельной матрицы случайных эффектов , как описано здесь , стр. 7 - 9.ZZZ Вычисление влечет за собой произведения ХатриРао и / или Кронекера двух матриц, и . ZZZJiJiJ_iXiXiX_i Матрица представляет собой глоток: «Матрица индикаторов группирующих...

Как аналог этого поста , я работал над моделированием данных с непрерывными переменными, подстраиваясь под коррелированные перехваты и уклоны. Хотя на сайте и за его пределами есть отличные сообщения на эту тему , у меня возникли трудности с поиском от начала до конца примера с симулированными...

Я пытаюсь вручную вычислить предсказания случайных эффектов на основе линейной смешанной модели и, используя обозначения, представленные Вудом в Обобщенных аддитивных моделях: введение в R (стр. 294 / стр. 307 в формате pdf), я запутываюсь в том, что каждый из параметров представляет. Ниже...

Это скорее концептуальный вопрос, но по мере использования Rя буду ссылаться на пакеты в R. Если цель состоит в том, чтобы подогнать линейную модель для целей прогнозирования, а затем делать прогнозы в тех случаях, когда случайные эффекты могут быть недоступны, есть ли польза от использования...

Итак, у меня есть 16 испытаний, в которых я пытаюсь идентифицировать человека по биометрической характеристике, используя расстояние Хэмминга. Мой порог установлен на 3,5. Мои данные ниже, и только пробная версия 1 является истинным положительным результатом: Trial Hamming Distance 1 0.34 2 0.37 3...

Я искал Google и этот сайт, и я все еще не понимаю функцию lmer в библиотеке lme4. У меня есть некоторые данные, собранные в разных психиатрических отделениях, которые имеют многоуровневую структуру. Для упрощения я выберу две переменные уровня 2 и две переменные уровня 1, хотя на самом деле у меня...

Предположим, у меня есть одна выборка частот из 4 возможных событий: Event1 - 5 E2 - 1 E3 - 0 E4 - 12 и у меня есть ожидаемые вероятности того, что мои события произойдут: p1 - 0.2 p2 - 0.1 p3 - 0.1 p4 - 0.6 С суммой наблюдаемых частот моих четырех событий (18) я могу рассчитать ожидаемые частоты...

В логистической обобщенной линейной смешанной модели (семейство = бином) я не знаю, как интерпретировать дисперсию случайных эффектов: Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. HOSPITAL (Intercept) 0.4295 0.6554 Number of obs: 2275, groups: HOSPITAL, 14 Как мне интерпретировать этот числовой...

Я использую lmer в R, чтобы проверить влияние условия ( cond) на некоторый результат. Вот некоторые составные данные, где s - идентификатор субъекта a, bи c- условия. library("tidyr") library("dplyr") set.seed(123) temp <- data.frame(s = paste0("S", 1:30), a = rnorm(30, -2, 1), b = rnorm(30, -3,...

Я подгоняю модель со смешанными эффектами сплайн-термином в приложении, где известно, что тренд во времени является криволинейным. Тем не менее, я хотел бы оценить, происходит ли криволинейный тренд из-за индивидуального отклонения от линейности, или это эффект на уровне группы, который делает...

У меня есть несколько вопросов, касающихся спецификации и интерпретации GLMM. 3 вопроса, безусловно, являются статистическими, а 2 - более конкретно о R. Я пишу здесь, потому что, в конечном счете, я думаю, что проблема заключается в интерпретации результатов GLMM. В настоящее время я пытаюсь...