Вопросы с тегом «mixed-model»

12
Смешанная модель с 1 наблюдением за уровень

Я подгоняю модель случайных эффектов glmerк некоторым бизнес-данным. Цель состоит в том, чтобы проанализировать показатели продаж по дистрибьюторам с учетом региональных различий. У меня есть следующие переменные: distcode: идентификатор дистрибьютора, около 800 уровней region: географический...

12
Путаница с lmer и p-значениями: как p-значения из пакета memisc сравниваются с MCMC?

У меня сложилось впечатление, что функция lmer()в lme4пакете не производит p-значения (см. lmerP-значения и все такое ). Я использую MCMC сгенерированных значений р вместо как на этот вопрос: Значительный эффект в lme4смешанной модели и на этот вопрос: Не удается найти р-значения в выводе из...

12
Вывод о фиксированных эффектах в модели смешанных эффектов

Я сопоставил данные и использую модель смешанных эффектов логистической регрессии для оценки индивидуального уровня (условного) эффекта для предиктора интереса. Я знаю, что для стандартных маржинальных моделей логический вывод параметров модели с использованием теста Вальда согласуется с критериями...

12
Рассчитать логарифмическое правдоподобие «вручную» для обобщенной нелинейной регрессии наименьших квадратов (nlme)

Я пытаюсь вычислить логарифмическую вероятность для обобщенной нелинейной регрессии наименьших квадратов для функции оптимизированной с помощью функция в пакете R , используя ковариационную матрицу дисперсии, генерируемую расстояниями на филогенетическом дереве, предполагающем броуновское движение...

12
Не можете найти подходящую модель для подсчета данных со смешанными эффектами - ZINB или что-то еще?

У меня есть очень маленький набор данных о численности одиночной пчелы, который мне трудно анализировать. Это данные подсчета, и почти все подсчеты находятся в одной обработке, а большинство нулей в другой обработке. Есть также пара очень высоких значений (по одному на двух из шести сайтов),...

12
Отчетность о результатах линейной модели смешанных эффектов

Линейные модели со смешанными эффектами обычно не используются в моей области биологии, и мне нужно сообщить о статистическом тесте, который я использовал в статье, которую я пытаюсь написать. Я знаю, что осведомленность о многоуровневом моделировании начинает появляться в некоторых областях...

11
Два года данных, описывающих возникновение ассоциации тестирования насилия с количеством пациентов в палате

У меня есть данные за два года, которые выглядят примерно так: Дата _ __ Насилие Y / N? _ Количество пациентов 01.01.2008 _ ___ 0 __ _ __ _ ____ 11 01.02.2008 _ __ _ 0 _ __ _ __ _ __ 11 01.03.2008 _ ____ 1 __ _ __ _ ____ 12 01.04.2008 _ ____ 0 __ _ __ _ ____ 12 ... 31/12 / 2009_ _ __ 0_ _ __ _ __ _...

11
R / mgcv: Почему тензорные продукты te () и ti () производят разные поверхности?

mgcvПакет Rимеет две функции для установки взаимодействия Тензор продукта: te()и ti(). Я понимаю основное разделение труда между ними (подгонка нелинейного взаимодействия против разложения этого взаимодействия на основные эффекты и взаимодействие). Чего я не понимаю, так это почему te(x1, x2)и...

11
Почему при начальной загрузке остатков из модели смешанных эффектов получаются антиконсервативные доверительные интервалы?

Я обычно имею дело с данными, в которых несколько человек измеряются несколько раз в каждом из двух или более состояний. Недавно я играл с моделированием смешанных эффектов, чтобы оценить доказательства различий между условиями, моделируя individualкак случайный эффект. Чтобы визуализировать...

11
получение степеней свободы от лмера

Я подобрал модель lmer со следующим (хотя и скомпонованным выводом): Random effects: Groups Name Std.Dev. day:sample (Intercept) 0.09 sample (Intercept) 0.42 Residual 0.023 Я действительно хотел бы построить доверительный интервал для каждого эффекта, используя следующую формулу:...

11
Тестирование одновременных и запаздывающих эффектов в продольных смешанных моделях с изменяющимися во времени ковариатами

Мне недавно сказали, что было невозможно включить изменяющиеся во времени ковариаты в продольных смешанных моделях, не вводя временную задержку для этих ковариат. Вы можете подтвердить / опровергнуть это? Есть ли у вас какие-либо ссылки на эту ситуацию? Я предлагаю простую ситуацию прояснить....

11
Модель смешанного эффекта с переменной выборки

Я пытаюсь указать формулу для линейной модели смешанного эффекта (с lme4) для моего экспериментального дизайна, но я не уверен, что я делаю это правильно. Дизайн: в основном я измеряю параметр отклика на растениях. У меня 4 уровня лечения и 2 уровня орошения. Растения сгруппированы в 16 участков, в...

11
Как выполнить сравнение по принципу взаимодействия с моделью смешанных эффектов?

Я работаю над набором данных, чтобы оценить влияние сушки на микробную активность осадка. Цель состоит в том, чтобы определить, изменяется ли влияние высыхания между типами отложений и / или глубиной внутри отложений. Дизайн эксперимента выглядит следующим образом: Первый фактор отложений...

11
Смешанные модели множественных сравнений для взаимодействия между непрерывным и категориальным предиктором

Я хотел бы использовать lme4для подбора регрессии смешанных эффектов и multcompдля вычисления парных сравнений. У меня есть сложный набор данных с несколькими непрерывными и категориальными предикторами, но мой вопрос может быть продемонстрирован на примере встроенного ChickWeightнабора данных: m...

11
Когда использовать модель со смешанным эффектом?

Модели линейных смешанных эффектов - это расширения моделей линейной регрессии для данных, которые собираются и обобщаются в группы. Ключевым преимуществом является то, что коэффициенты могут варьироваться по отношению к одной или нескольким групповым переменным. Тем не менее, я борюсь с тем, когда...

11
Подгонка многоуровневых моделей к сложным данным обследования в R

Я ищу совет о том, как анализировать сложные данные опросов с помощью многоуровневых моделей в R. Я использовал этот surveyпакет для взвешивания неравных вероятностей выбора в одноуровневых моделях, но этот пакет не имеет функций для многоуровневого моделирования. lme4Пакет отлично подходит для...

11
Модель случайного пересечения против GEE

Рассмотрим линейную модель со случайным перехватом. Это эквивалентно линейной регрессии GEE с заменяемой рабочей корреляционной матрицей. Предположим, что предикторами являются и а коэффициентами для этих предикторов являются , и . Какова интерпретация коэффициентов в модели случайного пересечения?...

11
Что такое эквивалент lme4 :: lmer трехсторонних повторяющихся мер ANOVA?

Мой вопрос основан на этом ответе, который показал, какая lme4::lmerмодель соответствует двусторонним повторным измерениям ANOVA: require(lme4) set.seed(1234) d <- data.frame( y = rnorm(96), subject = factor(rep(1:12, 4)), a = factor(rep(1:2, each=24)), b = factor(rep(rep(1:2, each=12))), c =...