Вопросы с тегом «mixed-model»

13
Модели линейных смешанных эффектов

Я часто слышал, что модели LME более надежны при анализе данных о точности (т. Е. В психологических экспериментах), поскольку они могут работать с биномиальными и другими ненормальными распределениями, которые не могут традиционные методы (например, ANOVA). Какова математическая основа моделей LME,...

13
В чем разница между использованием aov () и lme () при анализе продольного набора данных?

Может кто-нибудь сказать мне разницу между использованием aov()и lme()для анализа продольных данных и как интерпретировать результаты этих двух методов? Ниже я анализирую один и тот же набор данных aov()и получаю lme()2 разных результата. Таким образом aov(), я получил значительный результат во...

13
Графики для иллюстрации результатов модели линейного смешанного эффекта

Я анализировал некоторые данные с использованием линейного моделирования смешанных эффектов в R. Я планирую сделать плакат с результатами, и мне было просто интересно, может ли кто-нибудь, имеющий опыт работы с моделями смешанных эффектов, предложить, какие графики использовать для иллюстрации...

13
Внутриклассные коэффициенты корреляции (ICC) с несколькими переменными

Предположим, я измерил некоторую переменную у братьев и сестер, которые вложены в семьи. Структура данных выглядит следующим образом: семейный брат ------ ------- ----- 1 1 год_11 1 2 год_12 2 1 год_21 2 2 y_22 2 3 y_23 ... ... ... Я хочу знать корреляцию между измерениями, сделанными на братьях и...

13
Расчет

Я читал о расчете значений в смешанных моделях и после прочтения FAQ по R-sig, других постов на этом форуме (я бы связал несколько, но мне не хватает репутации) и нескольких других ссылок, которые я понимаю, используя Значения в контексте смешанных моделей сложны.R 2р2R2R^2р2R2R^2 Однако недавно я...

13
Извлечение откосов для случаев из модели смешанных эффектов (lme4)

Я хотел бы извлечь наклоны для каждого человека в модели смешанного эффекта, как обрисовано в общих чертах в следующем параграфе Модели смешанных эффектов использовались для характеристики отдельных путей изменения показателей когнитивной сводки, включая термины для возраста, пола и года обучения в...

13
Прогнозирование на моделях со смешанным эффектом: что делать со случайными эффектами?

Давайте рассмотрим этот гипотетический набор данных: set.seed(12345) num.subjects <- 10 dose <- rep(c(1,10,50,100), num.subjects) subject <- rep(1:num.subjects, each=4) group <- rep(1:2, each=num.subjects/2*4) response <- dose*dose/10 * group + rnorm(length(dose), 50, 30) df <-...

13
Неверный вывод, когда наблюдения не являются независимыми

Из элементарной статистики я узнал, что с общей линейной моделью, чтобы выводы были достоверными, наблюдения должны быть независимыми. Когда происходит кластеризация, независимость может больше не сохраняться, приводя к неверному выводу, если это не учитывается. Одним из способов учета такой...

13
ANOVA полагается на метод моментов, а не на максимальную вероятность?

Я вижу упомянутое в разных местах, что ANOVA делает оценку, используя метод моментов. Меня смущает это утверждение, потому что, хотя я не знаком с методом моментов, я понимаю, что это нечто отличное от метода максимальной вероятности и не эквивалентное ему; с другой стороны, ANOVA можно...

13
Эквивалентность (0 + фактор | группа) и (1 | группа) + (1 | группа: фактор) характеристики случайных эффектов в случае составной симметрии

Дуглас Бейтс утверждает, что следующие модели эквивалентны «если матрица дисперсии-ковариации для векторно-значных случайных эффектов имеет особую форму, называемую составной симметрией» ( слайд 91 в этой презентации ): m1 <- lmer(y ~ factor + (0 + factor|group), data) m2 <- lmer(y ~ factor +...

12
Доверительные интервалы прогнозов для нелинейной смешанной модели (nlme)

Я хотел бы получить 95% доверительные интервалы на предсказаниях нелинейной смешанной nlmeмодели. Поскольку для этого не предусмотрено ничего стандартного nlme, мне хотелось бы знать, правильно ли использовать метод «интервалов прогнозирования населения», как описано в главе книги Бена Болкера в...

12
Как можно проверить гипотезу MCMC на регрессионной модели со смешанным эффектом со случайными наклонами?

Библиотека languageR предоставляет метод (pvals.fnc) для проверки значимости MCMC фиксированных эффектов в модели регрессии смешанного эффекта, подходящей с использованием lmer. Однако pvals.fnc выдает ошибку, когда модель lmer включает случайные наклоны. Есть ли способ сделать проверку гипотезы...

12
Потенциальная путаница в дизайне эксперимента

Обзор вопроса Предупреждение: этот вопрос требует много настроек. Пожалуйста, потерпите меня. Мой коллега и я работаем над проектом эксперимента. Дизайн должен работать с большим количеством ограничений, которые я перечислю ниже. Я разработал схему, которая удовлетворяет ограничениям и дает нам...

12
Линейная регрессия с повторными измерениями в R

Я не смог понять, как выполнить линейную регрессию в R для повторного измерения проекта. В предыдущем вопросе (все еще без ответа) мне было предложено не использовать, lmа использовать смешанные модели. Я использовал lmследующим образом: lm.velocity_vs_Velocity_response <-...

12
Оптимизатор lme4 по умолчанию требует много итераций для многомерных данных

TL; DR: lme4оптимизация кажется линейной по количеству параметров модели по умолчанию и намного медленнее, чем эквивалентная glmмодель с фиктивными переменными для групп. Что я могу сделать, чтобы ускорить это? Я пытаюсь соответствовать довольно большой иерархической модели логита (~ 50 тыс. Строк,...

12
Смешанная модель с 1 наблюдением за уровень

Я подгоняю модель случайных эффектов glmerк некоторым бизнес-данным. Цель состоит в том, чтобы проанализировать показатели продаж по дистрибьюторам с учетом региональных различий. У меня есть следующие переменные: distcode: идентификатор дистрибьютора, около 800 уровней region: географический...

12
Путаница с lmer и p-значениями: как p-значения из пакета memisc сравниваются с MCMC?

У меня сложилось впечатление, что функция lmer()в lme4пакете не производит p-значения (см. lmerP-значения и все такое ). Я использую MCMC сгенерированных значений р вместо как на этот вопрос: Значительный эффект в lme4смешанной модели и на этот вопрос: Не удается найти р-значения в выводе из...

12
Вывод о фиксированных эффектах в модели смешанных эффектов

Я сопоставил данные и использую модель смешанных эффектов логистической регрессии для оценки индивидуального уровня (условного) эффекта для предиктора интереса. Я знаю, что для стандартных маржинальных моделей логический вывод параметров модели с использованием теста Вальда согласуется с критериями...