Вопросы с тегом «mixed-model»

10
Повторные измерения anova: lm vs lmer

Я пытаюсь воспроизвести несколько тестов взаимодействия между обоими lmи lmerна повторных измерениях (2x2x2). Причина, по которой я хочу сравнить оба метода, состоит в том, что GLM SPSS для повторных измерений дает те же самые результаты, что и lmподход, представленный здесь, поэтому в конце я хочу...

10
Почему трудно учитывать неопределенность в случайных эффектах при прогнозировании по смешанным моделям?

В R-sig-ME есть несколько потоков о получении доверительных интервалов для прогнозов с использованием lme4и nlmeв R. Например, здесь и здесь, в 2010 году, включая некоторые комментарии Дугалса Бейтса, одного из авторов обоих пакетов. Я стесняюсь цитировать его дословно, так как боюсь, что их вырвут...

10
Обобщенные линейные смешанные модели: выбор модели

Этот вопрос / тема возникла в дискуссии с коллегой, и я искал несколько мнений по этому поводу: Я моделирую некоторые данные, используя логистическую регрессию со случайными эффектами, точнее - логистическую регрессию со случайным перехватом. Для фиксированных эффектов у меня есть 9 переменных,...

10
Идея смешанной модели и байесовский метод

В смешанной модели мы предполагаем, что случайные эффекты (параметры) являются случайными величинами, которые следуют нормальному распределению. Это выглядит очень похоже на байесовский метод, в котором все параметры предполагаются случайными. Так является ли модель случайных эффектов частным...

10
Верны ли степени свободы в lmerTest :: anova? Они сильно отличаются от RM-ANOVA

Я анализирую результаты эксперимента времени реакции в R. Я провел повторные измерения ANOVA (1 внутри-субъектный фактор с 2 уровнями и 1 между субъектный фактор с 2 уровнями). Я запустил аналогичную линейную смешанную модель, и я хотел обобщить результаты lmer в виде таблицы ANOVA с использованием...

10
Дисперсионно-ковариационная структура для случайных эффектов в lme4

Какова структура дисперсии-ковариации по умолчанию для случайных эффектов в glmerили lmerв lme4пакете? Как определить другую дисперсионно-ковариационную структуру для случайных эффектов в коде? Я не мог найти информацию об этом в...

10
Значение P для члена взаимодействия в моделях смешанных эффектов с использованием lme4

Я анализирую некоторые поведенческие данные, используя lme4in R, в основном следуя отличным учебникам Бодо Винтера , но не понимаю, правильно ли я обрабатываю взаимодействия. Хуже того, никто другой, участвующий в этом исследовании, не использует смешанные модели, поэтому я немного волнуюсь, чтобы...

10
Коэффициент внутриклассовой корреляции в смешанной модели со случайными наклонами

У меня есть следующие модели m_plotснабжены lme4::lmerсо скрещенными случайными эффектами для участников ( lfdn) и элементов ( content): Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. Corr lfdn (Intercept) 172.173 13.121 role1 62.351 7.896 0.03 inference1 24.640 4.964 0.08 -0.30 inference2 52.366...

10
Остаточная диагностика и однородность дисперсий в линейной смешанной модели

Прежде чем задать этот вопрос, я сделал поиск наш сайт и нашел много подобных вопросов, (например , здесь , здесь и здесь ). Но я чувствую, что эти смежные вопросы не получили должного ответа или обсуждения, поэтому я хотел бы снова поднять этот вопрос. Я чувствую, что должно быть большое...

10
Как мне моделировать взаимодействия между объясняющими переменными, если одна из них может иметь квадратные и кубические члены?

Я искренне надеюсь, что я сформулировал этот вопрос таким образом, чтобы на него можно было дать окончательный ответ - если нет, пожалуйста, дайте мне знать, и я попробую еще раз! Я должен также предположить, что я буду использовать R для этих анализов. У меня есть несколько мер, plant performance...

10
Сравнение моделей со смешанными и фиксированными эффектами (тестирование значимости случайных эффектов)

Учитывая три переменные, yи x, которые являются положительными непрерывными, и z, что является категориальным, у меня есть две модели кандидатов, заданные: fit.me <- lmer( y ~ 1 + x + ( 1 + x | factor(z) ) ) а также fit.fe <- lm( y ~ 1 + x ) Я надеюсь сравнить эти модели, чтобы определить,...

10
Последующее тестирование в multcomp :: glht для моделей со смешанными эффектами (lme4) с взаимодействиями

Я выполняю специальные тесты на линейной модели смешанных эффектов в R( lme4пакет). Я использую multcompпакет ( glht()функцию) для выполнения специальных тестов. Мой экспериментальный дизайн - повторные измерения со случайным эффектом блока. Модели указаны как: mymod <- lmer(variable ~ treatment...

10
О чем сообщает lsmeans для обобщенной линейной модели, такой как смешанная модель Пуассона (в соответствии с блеском)?

Я анализирую данные отслеживания глаз из разработанного эксперимента. Упрощенная версия моих данных выглядит следующим образом (Вы можете получить данные dput () здесь ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 9 Face 90 6 9...

10
Модельные матрицы для моделей со смешанными эффектами

В lmerфункции lme4in in Rесть вызов для построения модельной матрицы случайных эффектов , как описано здесь , стр. 7 - 9.ZZZ Вычисление влечет за собой произведения ХатриРао и / или Кронекера двух матриц, и . ZZZJiJiJ_iXiXiX_i Матрица представляет собой глоток: «Матрица индикаторов группирующих...

10
Как смоделировать данные, чтобы продемонстрировать смешанные эффекты с R (lme4)?

Как аналог этого поста , я работал над моделированием данных с непрерывными переменными, подстраиваясь под коррелированные перехваты и уклоны. Хотя на сайте и за его пределами есть отличные сообщения на эту тему , у меня возникли трудности с поиском от начала до конца примера с симулированными...

10
Рассчитать прогноз случайного эффекта вручную для линейной смешанной модели

Я пытаюсь вручную вычислить предсказания случайных эффектов на основе линейной смешанной модели и, используя обозначения, представленные Вудом в Обобщенных аддитивных моделях: введение в R (стр. 294 / стр. 307 в формате pdf), я запутываюсь в том, что каждый из параметров представляет. Ниже...

10
Минимальный размер выборки на кластер в модели случайных эффектов

Существует ли рациональное число наблюдений на кластер в модели случайных эффектов? У меня размер выборки 1500 с 700 кластерами, смоделированными как обменный случайный эффект. У меня есть возможность объединить кластеры, чтобы построить меньше, но больше кластеров. Интересно, как я могу выбрать...

9
Как я могу ускорить расчет фиксированных эффектов в GLMM?

Я занимаюсь имитационным исследованием, которое требует начальной загрузки оценок, полученных из обобщенной линейной смешанной модели (на самом деле, это произведение двух оценок для фиксированных эффектов, одна из GLMM и одна из LMM). Чтобы хорошо провести исследование, потребовалось бы около 1000...

9
Модель случайных эффектов, обрабатывающая избыточность

Я пытаюсь иметь дело с анализом времени на событие, используя повторяющиеся двоичные результаты. Предположим, что время до события измеряется днями, но на данный момент мы делим время на недели. Я хочу приблизить оценку Каплана-Мейера (но учесть ковариаты), используя повторяющиеся двоичные...

9
Могут ли случайные эффекты применяться только к категориальным переменным?

Эти вопросы могут показаться глупыми, но ... верно ли, что случайные эффекты могут применяться только к категориальным переменным (таким как индивидуальный идентификатор, идентификатор популяции, ...), например, скажем, является категориальной переменной:xixix_i β x iyiyiy_i ~βxiβxi\beta_{x_i} N o...