Вопросы с тегом «negative-binomial»

17
Невозможная проблема оценки?

Вопрос Дисперсия отрицательного биномиального (NB) распределения всегда больше его среднего значения. Когда среднее значение выборки превышает ее дисперсию, попытка подобрать параметры NB с максимальной вероятностью или с оценкой момента не удастся (решения с конечными параметрами не существует)....

17
Как подобрать дискретное распределение для подсчета данных?

У меня есть следующая гистограмма данных подсчета. И я хотел бы приспособить к этому дискретное распределение. Я не уверен, как я должен идти об этом. Должен ли я сначала наложить на гистограмму дискретное распределение, скажем, отрицательное биномиальное распределение, чтобы получить параметры...

17
Как я могу моделировать сальто до N успехов?

Мы с тобой решили сыграть в игру, в которой мы по очереди подбрасываем монету. Первый игрок, который перевернет 10 голов, выигрывает игру. Естественно, есть спор о том, кто должен идти первым. Моделирование этой игры показывает, что игрок, который переворачивает первый, выигрывает на 6% больше, чем...

16
Пуассон является экспоненциальным, как Гамма-Пуассон к чему?

Распределение Пуассона может измерять события в единицу времени, а параметр равен λλ\lambda . Экспоненциальное распределение измеряет время до следующего события с параметром 1λ1λ\frac{1}{\lambda} . Можно преобразовать одно распределение в другое, в зависимости от того, проще ли моделировать...

16
Стратегия выбора подходящей модели для подсчета данных

Какова подходящая стратегия для решения, какую модель использовать с данными подсчета? У меня есть данные подсчета, которые мне нужно моделировать как многоуровневые модели, и мне (на этом сайте) было рекомендовано, что лучший способ сделать это - через ошибки или MCMCglmm. Однако я все еще пытаюсь...

16
Обрамление отрицательного биномиального распределения для секвенирования ДНК

Отрицательное биномиальное распределение стало популярной моделью для подсчета данных (в частности, ожидаемое количество считываний секвенирования в пределах данной области генома из данного эксперимента) в биоинформатике. Объяснения различаются: Некоторые объясняют это как то, что работает как...

16
Когда кто-то говорит, что для модели Пуассона остаточное отклонение / df должно составлять ~ 1, насколько приблизительным является приблизительное значение?

Я часто видел советы по проверке того, является ли подход Пуассона более рассредоточенным, включая деление остаточного отклонения на степени свободы. Результирующее соотношение должно быть «примерно 1». Вопрос в том, о каком диапазоне мы говорим о «приблизительном» - каково соотношение, которое...

15
Ожидаемое количество раз, чтобы бросить кубик, пока каждая сторона не появится 3 раза

Какое ожидаемое количество раз вы должны бросить кубик, пока каждая сторона не появится 3 раза? Этот вопрос был задан в начальной школе в Новой Зеландии, и он был решен с помощью моделирования. Каково аналитическое решение этой...

14
Интерпретация коэффициентов заболеваемости

Итак, я хочу подобрать случайную модель негативных биномиальных эффектов. Для такой модели STATA может производить экспоненциальные коэффициенты. Согласно справочному файлу такие коэффициенты можно интерпретировать как коэффициенты заболеваемости. К сожалению, я не являюсь носителем английского...

14
Интерпретация выходных данных .L & .Q из отрицательного биномиального GLM с категориальными данными

Я только что запустил отрицательный биномиальный GLM, и это вывод: Call: glm.nb(formula = small ~ method + site + depth, data = size.dat, init.theta = 1.080668549, link = log) Deviance Residuals: Min 1Q Median 3Q Max -2.2452 -0.9973 -0.3028 0.3864 1.8727 Coefficients: Estimate Std. Error z value...

13
дисперсия в summary.glm ()

Я провел glm.nb по glm1<-glm.nb(x~factor(group)) с группой, являющейся категориальной, и х, являющейся метрической переменной. Когда я пытаюсь получить сводку результатов, я получаю немного разные результаты, в зависимости от того, использую я summary()или summary.glm. summary(glm1)дает мне ......

12
Сверхдисперсность и моделирование в пуассоновских моделях случайных эффектов со смещениями

Я столкнулся с рядом практических вопросов при моделировании данных подсчета из экспериментальных исследований с использованием эксперимента внутри объекта. Я кратко опишу эксперимент, данные и то, что я уже сделал, а затем мои вопросы. Четыре различных фильма были показаны выборке респондентов в...

12
Критерии выбора «лучшей» модели в скрытой марковской модели

У меня есть набор данных временного ряда, к которому я пытаюсь подогнать скрытую марковскую модель (HMM), чтобы оценить количество скрытых состояний в данных. Мой псевдокод для этого следующий: for( i in 2 : max_number_of_states ){ ... calculate HMM with i states ... optimal_number_of_states =...

12
Как бороться с чрезмерной дисперсией в пуассоновской регрессии: квази-правдоподобие, отрицательный биномиальный GLM или случайный эффект на уровне субъекта?

Я натолкнулся на три предложения по поводу чрезмерной дисперсии в переменной отклика Пуассона и стартовой модели с фиксированными эффектами: Используйте квази-модель; Используйте отрицательный биномиальный GLM; Используйте смешанную модель со случайным эффектом на уровне объекта. Но какой на самом...

12
Не можете найти подходящую модель для подсчета данных со смешанными эффектами - ZINB или что-то еще?

У меня есть очень маленький набор данных о численности одиночной пчелы, который мне трудно анализировать. Это данные подсчета, и почти все подсчеты находятся в одной обработке, а большинство нулей в другой обработке. Есть также пара очень высоких значений (по одному на двух из шести сайтов),...

11
Как бороться с «нецелым» предупреждением от отрицательного биномиального GLM?

Я пытаюсь смоделировать среднюю интенсивность паразитов, воздействующих на хозяина в R, используя отрицательную биномиальную модель. Я продолжаю получать 50 или более предупреждений, которые говорят: In dpois(y, mu, log = TRUE) : non-integer x = 251.529000 Как я могу справиться с этим? Мой код...

11
Оценка максимального правдоподобия для отрицательного биномиального распределения

Вопрос в следующем: Случайная выборка из n значений собирается из отрицательного биномиального распределения с параметром k = 3. Найти оценку максимального правдоподобия параметра π. Найти асимптотическую формулу для стандартной ошибки этой оценки. Объясните, почему отрицательное биномиальное...

10
R эквивалентно опции кластера при использовании отрицательной биномиальной регрессии

Я пытаюсь повторить работу коллеги и перемещаю анализ из Stata в R. Модели, которые она использует, вызывают параметр «cluster» в функции nbreg для кластеризации стандартных ошибок. См. Http://repec.org/usug2007/crse.pdf для довольно полного описания того, что и почему этого параметра Мой вопрос:...

10
Переменная масштаба как данные подсчета - правильно или нет?

В этой статье (свободно доступной через PubMed central) авторы используют отрицательную биномиальную регрессию для моделирования оценки на 10-элементном инструменте скрининга, набравшем 0-40. Эта процедура предполагает подсчет данных, что здесь явно не так. Мне бы хотелось узнать ваше мнение о том,...

10
Почему Anova () и drop1 () предоставили разные ответы для GLMM?

У меня есть GLMM формы: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Когда я использую drop1(model, test="Chi"), я получаю другие результаты, чем если бы я использовал Anova(model, type="III")из пакета автомобиля или summary(model). Последние...