Вопросы с тегом «r»

14
Что означают стрелки в биплоте PCA?

Рассмотрим следующий биплот PCA: library(mvtnorm) set.seed(1) x <- rmvnorm(2000, rep(0, 6), diag(c(5, rep(1,5)))) x <- scale(x, center=T, scale=F) pc <- princomp(x) biplot(pc) Есть куча красных стрелок, что они означают? Я знал, что первая стрелка, помеченная «Var1», должна указывать самое...

14
Как оценить компоненты дисперсии с помощью lmer для моделей со случайными эффектами и сравнить их с результатами lme

Я выполнил эксперимент, в котором я воспитывал разные семьи из двух разных групп населения. Каждой семье был назначен один из двух видов лечения. После эксперимента я измерил несколько признаков на каждого человека. Чтобы проверить эффект лечения или источника, а также их взаимодействие, я...

14
Стандартная ошибка подсчета

У меня есть набор данных об инцидентах по сезонам редких заболеваний. Например, скажем, было 180 случаев весной, 90 летом, 45 осенью и 210 зимой. Я борюсь с тем, уместно ли прикреплять стандартные ошибки к этим числам. Цели исследования являются выводными в том смысле, что мы ищем сезонную картину...

14
Ищем шаг на примере факторного анализа дихотомических данных (бинарных переменных) с использованием R

У меня есть некоторые дихотомические данные, только двоичные переменные, и мой начальник попросил меня выполнить факторный анализ с использованием матрицы тетрахорических корреляций. Ранее я был в состоянии научить себя, как проводить различные анализы, основываясь на примерах здесь и на сайте...

14
Что вы можете сделать, когда у вас есть предикторные переменные, основанные на средних значениях группы с различными размерами выборки?

Рассмотрим классическую задачу анализа данных, где у вас есть результат и как он связан с рядом предикторов . Основным типом приложения здесь является то, что Х я 1 , . , , , Х я рYiYiY_{i}Xi1,...,XipXi1,...,XipX_{i1}, ..., X_{ip} YiYiY_{i} - это некоторый результат на уровне группы, например,...

14
Как минимизировать остаточную сумму квадратов экспоненциальной подгонки?

У меня есть следующие данные, и я хотел бы приспособить к ним модель отрицательного экспоненциального роста: Days <- c( 1,5,12,16,22,27,36,43) Emissions <- c( 936.76, 1458.68, 1787.23, 1840.04, 1928.97, 1963.63, 1965.37, 1985.71) plot(Days, Emissions) fit <- nls(Emissions ~ a*...

14
Как бороться со смесью двоичных и непрерывных входов в нейронных сетях?

Я использую пакет nnet в R, чтобы попытаться построить ANN для прогнозирования цен на недвижимость для квартир (личный проект). Я новичок в этом и не имею математического образования, поэтому, пожалуйста, держись со мной. У меня есть входные переменные, которые являются двоичными и непрерывными....

14
Почему в этом отрывке говорится, что объективная оценка стандартного отклонения обычно не актуальна?

Я читал о вычислении объективной оценки стандартного отклонения и источника, который я прочитал (...) за исключением некоторых важных ситуаций, задача имеет мало отношения к приложениям статистики, поскольку ее необходимость избегается стандартными процедурами, такими как использование тестов...

14
Оптимальный программный пакет для байесовского анализа

Мне было интересно, какой пакет статистических программ вы, ребята, порекомендуете для выполнения байесовского вывода. Например, я знаю, что вы можете запускать openBUGS или winBUGS как автономные или вы также можете вызывать их из R. Но R также имеет несколько своих собственных пакетов (MCMCPack,...

14
Доверительный интервал для модели GAM

Чтение mgcv::gamсправочной страницы: доверительные / достоверные интервалы легко доступны для любого количества, предсказанного с использованием подобранной модели Однако я не могу придумать, как его получить. Я думал, predict.gamчто есть type=confidenceи levelпараметр, но это не так. Можете ли вы...

14
Существует ли оптимальная пропускная способность для оценки плотности ядра производных?

Мне нужно оценить функцию плотности на основе набора наблюдений, используя оценщик плотности ядра. Основываясь на том же наборе наблюдений, мне также нужно оценить первую и вторую производные плотности, используя производные оценки плотности ядра. Пропускная способность, безусловно, будет иметь...

14
Удаление посторонних точек возле центра QQ-графика

Я пытаюсь построить QQ-график с двумя наборами данных около 1,2 млн. Точек в R (используя qqplot и передавая данные в ggplot2). Вычисление достаточно простое, но полученный график очень медленно загружается, потому что точек очень много. Я пробовал линейное приближение, чтобы уменьшить количество...

14
Есть ли альтернатива критерию Колмогорова-Смирнова для связанных данных с коррекцией?

У меня есть набор данных из двух выборок (контрольной и обработанной), каждая из которых содержит несколько тысяч значений, которые должны пройти проверку на значимость в R. Теоретически значения должны быть непрерывными, но из-за округления, выполняемого программным обеспечением для измерения, они...

14
Когда фильтр Калмана даст лучшие результаты, чем простая скользящая средняя?

Недавно я применил фильтр Калмана на простом примере измерения положения частиц со случайной скоростью и ускорением. Я обнаружил, что фильтр Калмана работает хорошо, но потом спросил себя, в чем разница между этим и просто скользящим средним? Я обнаружил, что если я использовал окно из примерно 10...

14
Параметры без определенных априоров в Stan

Я только начал учиться использовать Стэн и rstan. Если я не всегда был озадачен тем, как работают JAGS / BUGS, я думал, что вы всегда должны были определять какое-то предварительное распределение для каждого параметра в модели, из которой нужно извлечь. Похоже, что вам не нужно делать это в Stan на...

14
Почему при расчете доверительных интервалов с использованием метода bca генерируется ошибка «оценочная корректировка« a »является NA» из загрузочного пакета R?

У меня есть вектор чисел, который я загрузил здесь (... / code / MyData.Rdata), используя dput. Я хотел бы получить bca ci, поэтому я написал этот код: my.mean <- function(dat, idx){ return (mean(dat[idx], na.rm = TRUE)) } boot.out<-boot(data=my.data, statistic = my.mean, R=1000) Но когда я...

14
RandomForest - интерпретация сюжета MDS

Я использовал randomForest для классификации 6 поведений животных (например, стоя, ходьбы, плавания и т. Д.) На основе 8 переменных (различные позы тела и движения). MDSplot в пакете randomForest дает мне этот вывод, и у меня возникают проблемы с интерпретацией результата. Я сделал PCA на тех же...

14
Какова функция стоимости в cv.glm в загрузочном пакете R?

Я делаю перекрестную проверку, используя метод "оставь один". Я получил бинарный ответ и использую загрузочный пакет для R и функцию cv.glm . Моя проблема в том, что я не до конца понимаю часть затрат в этой функции. Из того, что я могу понять, это функция, которая решает, следует ли...

14
Можно ли использовать среднеквадратичную ошибку для классификации?

Я знаю формулу среднеквадратичной ошибки и как ее вычислить. Когда мы говорим о регрессии, мы можем вычислить среднеквадратическую ошибку. Однако можно ли говорить о MSE для задачи классификации и как ее...

14
Как бы вы сделали байесовский ANOVA и регрессия в R? [закрыто]

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время он не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто 2 года назад . У меня есть довольно простой набор данных, состоящий из одной независимой переменной, одной зависимой...