Вопросы с тегом «r»

38
ImageNet: что такое топ-1 и топ-5 ошибок?

В классификационных документах ImageNet показатели ошибок топ-1 и топ-5 являются важными единицами измерения успешности некоторых решений, но каковы эти коэффициенты ошибок? В классификации ImageNet с глубокими сверточными нейронными сетями Крижевский и соавт. каждое решение, основанное на одной...

38
Нужно ли изучать ggplot2 или ggvis?

Нужно ли изучать ggplot2 или ggvis? Я не обязательно хочу изучать оба, если один из них превосходит в любом отношении. Почему сообщество R продолжает создавать новые пакеты с перекрывающимися функциями? В вводном посте не упоминается слово, почему ggvis создан, поскольку сложный пакет для...

38
Есть ли хороший браузер / программа просмотра для просмотра набора данных R (файл .rda)

Я хочу просмотреть файл .rda (набор данных R). Я знаю о View(datasetname)команде. R.app по умолчанию для Mac не имеет очень хорошего браузера для данных (он открывает окно в X11). Мне нравится браузер данных RStudio, который открывается с Viewкомандой. Тем не менее, он показывает только 1000 строк...

38
Вычисленный вручную

Я знаю, что это довольно специфический Rвопрос, но я могу думать о неправильной пропорции, объясненной, R2R2R^2 . Вот оно. Я пытаюсь использовать Rпакет randomForest. У меня есть некоторые тренировочные данные и данные тестирования. Когда я подгоняю модель случайного леса, randomForestфункция...

38
Временной ряд «кластеризация» в R

У меня есть набор данных временных рядов. Каждая серия охватывает один и тот же период, хотя фактические даты в каждом временном ряду могут не совпадать точно. То есть, если бы временной ряд читался в двухмерной матрице, он бы выглядел примерно так: date T1 T2 T3 .... TN 1/1/01 100 59 42 N/A 2/1/01...

38
Случайное число-Set.seed (N) в R [дубликат]

На этот вопрос уже есть ответ здесь: Что такое семя в генераторе случайных чисел? 3 ответа Я понимаю, что один использует set.seed()в R для генерации псевдослучайных чисел. Я также понимаю, что, используя тот же номер, например, set.seed(123)страхует, вы можете воспроизвести результаты. Но я не...

38
Интерпретация вывода R для биномиальной регрессии

Я довольно новичок в этом вопросе с тестами на биномиальные данные, но мне нужно было сделать один, и теперь я не уверен, как интерпретировать результат. Переменная y, переменная отклика, является биномиальной, а объясняющие факторы непрерывны. Вот что я получил при подведении итогов: glm(formula =...

38
Руководство по выбору гиперпараметров в Deep Learning

Я ищу статью, которая могла бы помочь дать руководство о том, как выбирать гиперпараметры глубокой архитектуры, такие как многоуровневые авто-кодеры или сети с глубоким доверием. Существует много гиперпараметров, и я очень запутался в том, как их выбирать. Также использование перекрестной проверки...

37
Что легко интерпретировать, добротность мер соответствия для линейных моделей со смешанными эффектами?

Я в настоящее время использую пакет R lme4 . Я использую линейные модели смешанных эффектов со случайными эффектами: library(lme4) mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect + # random effects...

37
Расстояние Кульбак – Лейблер - Колмогоров-Смирнов

Я вижу, что существует много формальных различий между мерами расстояния Кульбака-Лейблера-Колмогорова-Смирнова. Тем не менее, оба используются для измерения расстояния между распределениями. Есть ли типичная ситуация, когда один должен использоваться вместо другого? Каково обоснование для этого?...

37
Интервал прогнозирования для модели смешанных эффектов lmer () в R

Я хочу получить интервал прогнозирования вокруг прогноза из модели lmer (). Я нашел некоторое обсуждение по этому поводу: http://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/24365_2803ab8299934e888a60e7b16113f619.html http://glmm.wikidot.com/faq но они, похоже, не учитывают неопределенность случайных...

37
Как найти подходящую для полусинусоидальной модели модель R?

Я хочу предположить, что температура поверхности моря в Балтийском море один и тот же год за годом, а затем описать это с помощью функции / линейной модели. У меня была идея просто ввести год в виде десятичного числа (или num_months / 12) и узнать, какой должна быть температура в это время. Бросив...

37
Почему мои p-значения отличаются между выходом логистической регрессии, тестом хи-квадрат и доверительным интервалом для ИЛИ?

Я построил логистическую регрессию, где переменная результата излечивается после получения лечения (по Cureсравнению сNo Cure ). Все пациенты в этом исследовании получали лечение. Мне интересно узнать, связан ли диабет с этим результатом. В R мой вывод по логистической регрессии выглядит следующим...

37
Почему glmer не достигает максимальной вероятности (что подтверждается применением дополнительной общей оптимизации)?

Численно получить MLE из GLMM сложно, и на практике, я знаю, мы не должны использовать оптимизацию методом грубой силы (например, используя optimпростой способ). Но для моих собственных образовательных целей я хочу попробовать, чтобы убедиться, что я правильно понимаю модель (см. Код ниже). Я...

37
Почему тест Мантеля предпочтительнее теста Морана I?

Тест Мантеля широко используется в биологических исследованиях для изучения корреляции между пространственным распределением животных (положение в пространстве), например, с их генетическим родством, скоростью агрессии или каким-либо другим атрибутом. Множество хороших журналов используют его (...

37
Перекрестный анализ временных рядов

Я использовал пакет caret в R для построения прогностических моделей для классификации и регрессии. Caret предоставляет унифицированный интерфейс для настройки гиперпараметров модели путем перекрестной проверки или привязки загрузки. Например, если вы строите простую модель «ближайших соседей» для...

37
Имеет ли значение знак оценок или нагрузок в PCA или FA? Могу ли я поменять знак?

Я выполнил анализ основных компонентов (PCA) с помощью R, используя две разные функции ( prcompи princomp), и заметил, что оценки PCA отличаются по знаку. Как это может быть? Учти это: set.seed(999) prcomp(data.frame(1:10,rnorm(10)))$x PC1 PC2 [1,] -4.508620 -0.2567655 [2,] -3.373772 -1.1369417...

37
Когда и как использовать стандартизированные объясняющие переменные в линейной регрессии

У меня есть 2 простых вопроса о линейной регрессии: Когда рекомендуется стандартизировать объясняющие переменные? Как только можно выполнить оценку с использованием стандартизированных значений, как можно прогнозировать с помощью новых значений (как следует стандартизировать новые значения)?...

37
Понимание параметров внутри отрицательного биномиального распределения

Я пытался соответствовать моим данным в различные модели и выяснил , что fitdistrфункция из библиотеки MASSиз Rдает мне , Negative Binomialкак наиболее подходящее. Теперь со страницы вики определение дается как: Распределение NegBin (r, p) описывает вероятность k неудач и r успехов в k + r...