Вопросы с тегом «r»

13
Понимание сравнений результатов кластеризации

Я экспериментирую с классификацией данных по группам. Я довольно новичок в этой теме, и пытаюсь понять вывод некоторых из анализа. Используя примеры из Quick-R , предлагается несколько Rпакетов. Я попытался использовать два из этих пакетов ( fpcс помощью kmeansфункции и mclust). Один из аспектов...

13
В чем разница между использованием aov () и lme () при анализе продольного набора данных?

Может кто-нибудь сказать мне разницу между использованием aov()и lme()для анализа продольных данных и как интерпретировать результаты этих двух методов? Ниже я анализирую один и тот же набор данных aov()и получаю lme()2 разных результата. Таким образом aov(), я получил значительный результат во...

13
R / Stata пакет для отрицательно усеченного отрицательного бинома GEE?

Это мой первый пост. Я действительно благодарен за это сообщество. Я пытаюсь проанализировать данные продольного счета, которые укорочены до нуля (вероятность того, что переменная отклика = 0 равна 0), а среднее значение! = Дисперсия, поэтому для пуассона было выбрано отрицательное биномиальное...

13
Интерпретация диапазонов в R's plot.stl?

У меня проблемы с выяснением, что plot.stlименно означают диапазоны . Я нашел пост Гэвина по этому вопросу и прочитал документацию, я понимаю, что они говорят об относительной величине разложенных компонентов, но все же я не совсем уверен, как они работают. Например: данные: крошечный столбик, без...

13
Несмещенная оценка для меньшей из двух случайных величин

Предположим, что X∼N(μx,σ2x)X∼N(μx,σx2)X \sim \mathcal{N}(\mu_x, \sigma^2_x) и Y∼N(μy,σ2y)Y∼N(μy,σy2)Y \sim \mathcal{N}(\mu_y, \sigma^2_y) z=min(μx,μy)z=min(μx,μy)z = \min(\mu_x, \mu_y)zzz Простая оценка где и являются примерами средних значений и , например, смещена (хотя и непротиворечива). Это...

13
Сравнивая важность различных наборов предикторов

Я советовал студенту-исследователю с конкретной проблемой, и я хотел, чтобы на этом сайте присутствовали другие. Контекст: Исследователь имел три типа предикторных переменных. Каждый тип содержал различное количество переменных-предикторов. Каждый предиктор был непрерывной переменной: Социальные:...

13
Интерпретация результатов логистической регрессии в R

Я работаю над множественной логистической регрессией в R, используя glm. Переменные предиктора являются непрерывными и категориальными. Выдержка из резюме модели показывает следующее: Coefficients: Estimate Std. Error z value Pr(>|z|) (Intercept) 2.451e+00 2.439e+00 1.005 0.3150 Age 5.747e-02...

13
Формула для автокорреляции в R против Excel

Я пытаюсь выяснить, как R вычисляет автокорреляцию lag-k (очевидно, это та же формула, что используется Minitab и SAS), так что я могу сравнить ее с использованием функции CORREL в Excel, примененной к серии, и ее версии с k-lagged. R и Excel (используя CORREL) дают немного разные значения...

13
PCA и оценки компонентов, основанные на сочетании непрерывных и двоичных переменных

Я хочу применить PCA к набору данных, который состоит из переменных смешанного типа (непрерывных и двоичных). Чтобы проиллюстрировать процедуру, я вставил минимальный воспроизводимый пример в R ниже. # Generate synthetic dataset set.seed(12345) n <- 100 x1 <- rnorm(n) x2 <- runif(n, -2, 2)...

13
Boxplot в отношении двух факторов, использующих ggplot2 в R

Locked . Этот вопрос и его ответы заблокированы, потому что вопрос не по теме, но имеет историческое значение. В настоящее время он не принимает новые ответы или взаимодействия. Я очень плохо знаком с R и любыми пакетами в R. Я посмотрел документацию по ggplot2, но не смог найти это. Я хочу график...

13
R только альтернативы ошибок [закрыт]

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время он не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто 12 месяцев назад . Я слежу за курсом по байесовской статистике с использованием BUGS и R. Теперь я уже знаю BUGS,...

13
Пакет R для определения отношений между переменными [закрыт]

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время он не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто 4 года назад . Есть ли пакет R, который я могу использовать, чтобы выяснить, существуют ли отношения между...

13
Нарисуйте несколько графиков на одном графике в R?

Используя следующий код, я попытался нарисовать четыре графика на графике R. Я не доволен этой цифрой, потому что между графиками много места, поэтому ширина графиков недостаточна для анализа графиков. Может ли кто-нибудь помочь мне создать хороший график с четырьмя графиками? Как сохранить метки...

13
Как рассчитывается ANOVA для расчета повторных измерений: aov () против lm () в R

Название говорит само за себя, и я в замешательстве. Следующее запускает повторные измерения aov () в R и выполняет то, что я думал, было эквивалентным вызовом lm (), но они возвращают различные остатки ошибок (хотя суммы квадратов одинаковы). Ясно, что остатки и подогнанные значения из aov () -...

13
Вычисление вероятности совпадения списка генов между последовательностью РНК и набором данных чипа

Надеюсь, кто-то на этих форумах поможет мне с этой основной проблемой в исследованиях экспрессии генов. Я сделал глубокое секвенирование экспериментальной и контрольной ткани. Затем я получил значения кратного обогащения генов в экспериментальном образце для контроля. Эталонный геном имеет ~ 15 000...

13
Оценка моделей логистической регрессии

Этот вопрос возникает из-за моей путаницы в том, как решить, достаточно ли хороша логистическая модель. У меня есть модели, которые используют состояние пар индивидуальный проект через два года после их формирования в качестве зависимой переменной. Результат успешен (1) или нет (0). У меня есть...

13
lme4 или другой код пакета с открытым исходным кодом R, эквивалентный asreml-R

Я хочу приспособить смешанную модель, используя lme4, nlme, пакет байсовой регрессии или любой доступный. Смешанная модель в соглашениях о кодировании Asreml-R прежде чем углубляться в детали, мы можем захотеть узнать подробности о соглашениях asreml-R для тех, кто не знаком с кодами ASREML. y = Xτ...

13
Как я могу рассчитать критическое значение т, используя R?

Извините, если это новый вопрос; Я пытаюсь научить себя статистике в первый раз. Я думаю, что у меня есть базовая процедура, но я изо всех сил пытаюсь выполнить ее с R. Итак, я пытаюсь оценить значимость коэффициентов регрессии в множественной линейной регрессии формы y^=Xβ^y^=Xβ^ \hat y = X \hat...

13
Расчеты мощности / размер выборки для исследования биомаркеров

У нас есть потенциальный биомаркер для предсказания, есть ли у пациента рак или нет. Результат теста биомаркера - бинарный, положительный или отрицательный. Мы хотим получить представление о количестве пациентов, которые необходимо протестировать, чтобы определить, является ли этот биомаркер...