Вопросы с тегом «model»

11
Значение начальных переходных вероятностей в скрытой марковской модели

Каковы преимущества придания определенных начальных значений вероятностям перехода в скрытой марковской модели? В конце концов система изучит их, так какой смысл давать значения, отличные от случайных? Имеет ли базовый алгоритм такую ​​разницу, как Баум-Уэлч? Если бы я очень точно знал вероятности...

11
Какие остатки и расстояние Кука используются для GLM?

Кто-нибудь знает, какова формула расстояния Кука? В оригинальной формуле расстояния Кука используются нечеткие невязки, но почему R использует стандартное отклонение. Остатки Пирсона при расчете расстояния Кука для GLM. Я знаю, что для GLM не определены стедентифицированные невязки, но как выглядит...

11
Почему при начальной загрузке остатков из модели смешанных эффектов получаются антиконсервативные доверительные интервалы?

Я обычно имею дело с данными, в которых несколько человек измеряются несколько раз в каждом из двух или более состояний. Недавно я играл с моделированием смешанных эффектов, чтобы оценить доказательства различий между условиями, моделируя individualкак случайный эффект. Чтобы визуализировать...

11
Тестирование одновременных и запаздывающих эффектов в продольных смешанных моделях с изменяющимися во времени ковариатами

Мне недавно сказали, что было невозможно включить изменяющиеся во времени ковариаты в продольных смешанных моделях, не вводя временную задержку для этих ковариат. Вы можете подтвердить / опровергнуть это? Есть ли у вас какие-либо ссылки на эту ситуацию? Я предлагаю простую ситуацию прояснить....

11
Как рассчитать разницу двух склонов?

Есть ли способ понять, если две линии (более или менее) параллельны? У меня есть две линии, сгенерированные из линейных регрессий, и я хотел бы понять, параллельны ли они. Другими словами, я хотел бы получить разные наклоны этих двух линий. Есть ли функция R для расчета этого? РЕДАКТИРОВАТЬ: ... и...

11
Возможные расширения диагностических участков по умолчанию для lm (в R и в целом)?

Я начал немного копаться в функции plot.lm , эта функция дает шесть графиков для lm: График остатков от установленных значений График Scale-Location для sqrt (| остатки |) по отношению к подобранным значениям Нормальный график QQ, график расстояний Кука против меток строк График остатков против...

11
Как лучше всего анализировать данные о продолжительности пребывания в РКИ в больнице?

Мне интересно знать, существует ли консенсус относительно оптимального способа анализа данных о продолжительности пребывания в больнице (LOS) из РКИ. Это, как правило, распределение с очень правильным перекосом, при котором большинство пациентов выписывается в течение нескольких дней или недели, но...

11
Скрытые марковские модели с алгоритмом Баума-Уэлча с использованием питона

Я ищу некоторую реализацию Python (в чистом Python или обертывание существующих материалов) HMM и Baum-Welch. Некоторые идеи? Я только что искал в Google, и я нашел очень плохой материал в отношении других методов машинного обучения....

11
Как выполнить сравнение по принципу взаимодействия с моделью смешанных эффектов?

Я работаю над набором данных, чтобы оценить влияние сушки на микробную активность осадка. Цель состоит в том, чтобы определить, изменяется ли влияние высыхания между типами отложений и / или глубиной внутри отложений. Дизайн эксперимента выглядит следующим образом: Первый фактор отложений...

11
Как рассчитать прогнозируемые уровни опасности по модели Кокса PH?

У меня есть следующая модель Кокса PH: (Время, Событие) ~ X + Y + Z Я хотел бы получить оценки опасности скорости (я говорю о скоростях опасности НЕ опасности коэффициентов) даны конкретные значения X, Y, Z. Я знаю, что пакет muhaz R может рассчитывать наблюдаемые уровни опасности, но мне интересна...

11
Приспособление Пуассона GLM в R - проблемы с показателями по сравнению с количеством

В настоящее время я работаю над проектом, включающим в себя GLM (и, в конечном итоге, GAM), некоторые данные подсчета времени. Обычно я делаю это в SAS, но я пытаюсь перейти на R, и у меня возникают ... проблемы. Когда я подхожу к GLM для подсчета данных, используя следующее: cdi_model <-...

11
Параметр дисперсии в выходных данных GLM

Я запустил glm в R, и в нижней части summary()вывода, он заявляет (Dispersion parameter for gaussian family taken to be 28.35031) Я покопался в Google и узнал, что параметр дисперсии используется для соответствия стандартным ошибкам. Я надеюсь, что кто-то может предоставить более подробную...

11
Остатки Шенфельда

В модели пропорциональных рисков Кокса со многими переменными, если остатки Шенфельда не являются плоскими для одной из переменных, делает ли это недействительной всю модель или можно игнорировать только неэффективную переменную? То есть интерпретировать коэффициенты для других переменных, но не...

11
Могут ли эти данные быть объединены в пропорции для биномиального глм?

Мы попросили 60 человек перечислить как можно больше ресторанных франшиз в Атланте. Общий список включал более 70 ресторанов, но мы исключили те, которые были упомянуты менее чем 10% людей, оставив нам 45. Для этих 45 мы рассчитали долю информантов, которые перечислили франшизу, и нас интересует...

11
Смешанные модели множественных сравнений для взаимодействия между непрерывным и категориальным предиктором

Я хотел бы использовать lme4для подбора регрессии смешанных эффектов и multcompдля вычисления парных сравнений. У меня есть сложный набор данных с несколькими непрерывными и категориальными предикторами, но мой вопрос может быть продемонстрирован на примере встроенного ChickWeightнабора данных: m...

11
Определение динамической байесовской системы и ее связь с HMM?

Из Википедии Динамическая байесовская сеть (DBN) - это байесовская сеть, которая связывает переменные друг с другом в течение смежных временных шагов. Это часто называют BN с двумя временами, потому что оно говорит, что в любой момент времени T значение переменной может быть вычислено из внутренних...

11
Анализ обогащения по уровню дупликации генов

Биологический Фон Со временем некоторые виды растений имеют тенденцию дублировать свои полные геномы, получая дополнительную копию каждого гена. Из-за нестабильности этой установки многие из этих генов затем удаляются, и геном перестраивается и стабилизируется, готовый к повторному дублированию....

11
Взвешивание показателя склонности в анализе Кокса PH и выборе ковариат

Относительно взвешивания по шкале склонности (IPTW) при моделировании пропорциональных рисков Кокса для данных о выживаемости от времени к событию: У меня есть проспективные данные реестра, где мы заинтересованы в том, чтобы посмотреть на эффект лечения от лекарств, которые в большинстве случаев...

11
Функция стоимости для проверки моделей регрессии Пуассона

Для собранных данных я использую регрессию Пуассона для построения моделей. Я делаю это с помощью glmфункции в R, где я использую family = "poisson". Для оценки возможных моделей (у меня есть несколько предикторов) я использую AIC. Все идет нормально. Теперь я хочу выполнить перекрестную проверку....