Вопросы с тегом «lme4-nlme»

27
В многоуровневой модели, каковы практические значения оценки параметров корреляции случайных эффектов, а не оценки?

В многоуровневой модели, каковы практические и связанные с интерпретацией последствия оценки, а не оценки параметров корреляции случайных эффектов? Практическая причина спрашивать это состоит в том, что в структуре Лмера в R нет реализованного метода для оценки p-значений с помощью методов MCMC,...

27
функция предиката () для моделей со смешанными эффектами

Проблема: Я читал в других сообщениях, которые predictнедоступны для lmerмоделей со смешанными эффектами {lme4} в [R]. Я пытался исследовать эту тему с набором игрушечных данных ... Задний план: Набор данных адаптирован из этого источника и доступен как ... require(gsheet) data <- read.csv(text...

27
Может ли AIC сравнивать разные модели?

Я использую AIC (информационный критерий Акаике) для сравнения нелинейных моделей в R. Допустимо ли сравнивать AIC разных типов моделей? В частности, я сравниваю модель, подобранную с помощью glm, с моделью со случайным термином эффекта, подобранной с помощью glmer (lme4). Если нет, то есть ли...

26
Как проверить и избежать мультиколлинеарности в смешанной линейной модели?

В настоящее время я использую линейные модели со смешанным эффектом. Я использую пакет "lme4" в R. Мои модели принимают форму: model <- lmer(response ~ predictor1 + predictor2 + (1 | random effect)) Перед запуском моих моделей я проверил возможную мультиколлинеарность между предикторами. Я...

26
Как я могу интерпретировать «корреляции фиксированных эффектов» в моем блеске?

У меня есть следующий вывод: Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS2 +sAG2 +sSHDI2 +sbare +season +crop +(1|landscape) AIC BIC logLik deviance 4062 4093 -2022 4044 Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. landscape (Intercept) 0.82453 0.90804...

26
Правильно ли я указал свою модель в lmer?

Я просмотрел множество справочных сайтов и все еще не понимаю, как указать более сложные вложенные термины в смешанной модели. Меня также смущает использование :и /и |при указании взаимодействий и вложений со случайными факторами, использующимися lmer()в lme4пакете в R. Для целей этого вопроса...

25
Аппроксимации Саттертвейта и Кенварда-Роджера для степеней свободы в смешанных моделях

lmerTestПакет предоставляет anova()функцию для линейных смешанных моделей с необязательно приближением Саттервейта ( по умолчанию) или Кенворд-Роже степеней свободы (DF). В чем разница между этими двумя подходами? Когда выбрать...

25
Когда теоретически обоснованы смешанные модели с нулевой корреляцией?

Приведенная ниже блок-цитата от лидеров в области моделирования смешанных эффектов утверждает, что координаты сдвигов в моделях с нулевой корреляцией между случайными эффектами (модели «ZCP») изменяют предсказания модели. Но кто-то может уточнить или обосновать свои требования? Заявления о которых...

25
Проверка предположений смешанных моделей lmer / lme в R

Я выполнил повторный проект, в ходе которого я протестировал 30 мужчин и 30 женщин в трех разных заданиях. Я хочу понять, как поведение мужчин и женщин отличается и как это зависит от задачи. Я использовал оба пакета lmer и lme4, чтобы исследовать это, однако я застрял при попытке проверить...

25
Задание нескольких (отдельных) случайных эффектов в lme [closed]

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто 6 месяцев назад . Я работал в R-пакетах nlme и lme4 , пытаясь указать модели с несколькими случайными эффектами. Я...

24
Почему lme и aov возвращают разные результаты для повторных измерений ANOVA в R?

Я пытаюсь перейти от использования ezпакета lmeдля повторных измерений ANOVA (как я надеюсь, я смогу использовать пользовательские контрасты с lme). Следуя совету из этого поста в блоге, я смог настроить одну и ту же модель, используя обе функции aov(как это делается ezпри запросе) и lme. Однако, в...

23
Имеет ли смысл вкладывать фиксированный эффект в случайный или как кодировать повторяющиеся измерения в R (aov и lmer)?

Я просматривал этот обзор формул lm / lmer R от @conjugateprior и был озадачен следующей записью: Теперь предположим, что A случайный, но B фиксирован, а B вложен в A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Ниже приведена аналогичная смешанная модельная формула lmer(Y ~ B + (1 | A:B), data=d) для того же...

22
Внутриклассная корреляция (ICC) для взаимодействия?

Предположим, у меня есть некоторые измерения для каждого предмета на каждом сайте. Две переменные, субъект и сайт, представляют интерес с точки зрения вычисления значений внутриклассовой корреляции (ICC). Обычно я использую функцию lmerиз пакета R lme4и запускаю lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject)...

22
Почему я получаю нулевую дисперсию случайного эффекта в моей смешанной модели, несмотря на некоторые различия в данных?

Мы запустили логистическую регрессию со смешанными эффектами, используя следующий синтаксис; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Предмет и Предмет - случайные эффекты. Мы получаем странный...

21
Как применить биномиальный GLMM (glmer) к процентам, а не к счетам да-нет?

У меня есть эксперимент с повторными измерениями, где зависимая переменная представляет собой процент, и у меня есть несколько факторов в качестве независимых переменных. Я хотел бы использовать glmerиз пакета R, lme4чтобы рассматривать его как проблему логистической регрессии (путем указания...

21
Предупреждение «Модель не сходится» в lmer ()

В следующем наборе данных я хотел посмотреть, изменится ли ответ (эффект) в отношении сайтов, сезона, продолжительности и их взаимодействий. Некоторые онлайн-форумы по статистике предложили мне продолжить работу с линейными моделями со смешанными эффектами, но проблема в том, что, поскольку...

20
Допускается сравнение моделей смешанных эффектов (в первую очередь случайные эффекты)

Я смотрел на моделирование смешанных эффектов с использованием пакета lme4 в R. Я в основном использую lmerкоманду, поэтому я задам свой вопрос через код, который использует этот синтаксис. Я предполагаю, что общий простой вопрос может состоять в том, можно ли сравнивать любые две модели,...

20
Парный t-критерий как частный случай линейного смешанного моделирования

Мы знаем, что парное t- тестирование - это всего лишь частный случай одностороннего повторного измерения (или внутри субъекта) ANOVA, а также линейной модели смешанного эффекта, которую можно продемонстрировать с помощью функции lme () пакета nlme в R как показано ниже. #response data from 10...

20
lme () и lmer () дают противоречивые результаты

Я работал с некоторыми данными, которые имеют некоторые проблемы с повторными измерениями. При этом я заметил очень различное поведение lme()и lmer()использование моих тестовых данных и хочу знать почему. Поддельный набор данных, который я создал, содержит измерения роста и веса для 10 предметов,...