Вопросы с тегом «glmnet»

13
Прогнозы с использованием glmnet в R

Я пытаюсь смоделировать некоторые данные, используя glmnetпакет в R. Допустим, у меня есть следующие данные training_x <- data.frame(variable1 = c(1, 2, 3, 2, 3), variable2 = c(1, 2, 3, 4, 5)) y <- c(1, 2, 3, 4, 5) (Это упрощение; мои данные намного сложнее.) Затем я использовал следующий код...

12
Точное определение меры Deviance в пакете glmnet с перекрестной проверкой?

Для моего текущего исследования я использую метод Лассо через пакет glmnet в R для биномиальной зависимой переменной. В glmnet оптимальная лямбда определяется путем перекрестной проверки, и полученные модели можно сравнивать с различными показателями, например, ошибочной классификацией или...

12
Лассо против адаптивного Лассо

LASSO и адаптивный LASSO - это разные вещи, верно? (Для меня штрафы выглядят по-другому, но я просто проверяю, что я что-то упускаю.) Когда вы вообще говорите об эластичной сетке, это особый случай LASSO или адаптивный LASSO? Что делает пакет glmnet, если вы выберете alpha = 1? Адаптивный LASSO...

12
Как обрабатывать значения NA в методе усадки (лассо) с использованием glmnet

Я использую "glmnet" для регрессии лассо в GWAS. Некоторые варианты и отдельные лица имеют пропущенные значения, и кажется, что glmnet не может обработать пропущенные значения. Есть ли решение для этого? или есть другой пакет, который может обрабатывать пропущенные значения в регрессии Лассо? Вот...

11
Результаты регрессии хребта отличаются при использовании lm.ridge и glmnet

Я применил некоторые данные, чтобы найти лучшее решение переменных регрессионной модели с использованием регрессии гребня в R. Я использовал lm.ridgeи glmnet(когда alpha=0), но результаты сильно отличаются, особенно когда lambda=0. Предполагается, что оба оценщика параметров имеют одинаковые...

11
Перекрестная проверка после LASSO в данных комплексного опроса

Я пытаюсь сделать выбор модели для некоторых кандидатов-предикторов, используя LASSO с непрерывным результатом. Цель состоит в том, чтобы выбрать оптимальную модель с наилучшими показателями прогнозирования, что обычно может быть выполнено путем перекрестной проверки в K-кратном порядке после...

11
Разница между ElasticNet в Scikit-Learn Python и Glmnet в R

Кто-нибудь пытался проверить, дает ли соответствие модели Elastic Net ElasticNetв Scikit-Learn в Python и glmnetR в одном наборе данных одинаковые арифметические результаты? Я экспериментировал со многими комбинациями параметров (поскольку две функции различаются значениями по умолчанию, которые...

11
R - Лассо регрессия - разные лямбда на регрессор

Я хочу сделать следующее: 1) регрессия OLS (без штрафных санкций) для получения бета-коэффициентов ; обозначает переменные, используемые для регрессии. Я делаю этоb∗jbj∗b_{j}^{*}jjj lm.model = lm(y~ 0 + x) betas = coefficients(lm.model) 2) регрессия Лассо с условием штрафования, критериями выбора...

11
glmnet: как понять многочленовую параметризацию?

Следующая проблема: я хочу предсказать переменную категориального ответа с одной (или более) категориальными переменными, используя glmnet (). Тем не менее, я не могу понять, какой вывод дает мне glmnet. Хорошо, сначала давайте сгенерируем две связанные категориальные переменные: Генерировать...

11
Как исправить один коэффициент и подогнать другие, используя регрессию

Я хотел бы вручную зафиксировать определенный коэффициент, скажем, , затем подогнать коэффициенты ко всем остальным предикторам, сохраняя при этом β 1 = 1,0 в модели.β1=1.0β1=1.0\beta_1=1.0β1=1.0β1=1.0\beta_1=1.0 Как я могу добиться этого с помощью R? Я бы особенно хотел поработать с LASSO (...

10
RMSE (среднеквадратическая ошибка) для логистических моделей

У меня есть вопрос относительно правильности использования RMSE (среднеквадратичная ошибка) для сравнения различных логистических моделей. Ответ либо, 0либо 1и прогнозы вероятности между 0- 1? Применяется ли приведенный ниже способ и для двоичных ответов? # Using glmnet require(glmnet)...

10
Перекрестная проверка регрессии лассо в R

Функция R cv.glm (library: boot) вычисляет предполагаемую K-кратную ошибку прогнозирования перекрестной проверки для обобщенных линейных моделей и возвращает дельту. Имеет ли смысл использовать эту функцию для регрессии лассо (library: glmnet) и, если да, то как ее можно выполнить? Библиотека...

10
Что является более точным glm или glmnet?

R glm и glmnet используют разные алгоритмы. Я замечаю нетривиальные различия между оценочными коэффициентами, когда использую оба. Меня интересует, когда одно является более точным, чем другое, и время, чтобы решить / точность компромисса. В частности, я имею в виду случай, когда в glmnet-й...

10
Репликация результатов для линейной регрессии glmnet с использованием универсального оптимизатора

Как говорится в заголовке, я пытаюсь воспроизвести результаты из glmnet linear, используя оптимизатор LBFGS из библиотеки lbfgs. Этот оптимизатор позволяет нам добавлять член регуляризатора L1, не беспокоясь о дифференцируемости, если наша целевая функция (без члена регуляризатора L1) выпуклая....

10
Как сделать перекрестную проверку с помощью cv.glmnet (регрессия LASSO в R)?

Мне интересно, как правильно подойти к обучению и тестированию модели LASSO с использованием glmnet в R? В частности, мне интересно, как это сделать, если отсутствие внешнего набора тестовых данных требует использования перекрестной проверки (или другого аналогичного подхода) для тестирования моей...

9
Как glmnet справляется с избыточной дисперсией?

У меня есть вопрос о том, как смоделировать текст поверх данных подсчета, в частности, как я могу использовать эту lassoтехнику для сокращения возможностей. Скажем, у меня есть N онлайн статей и количество просмотров страниц для каждой статьи. Я извлек 1-грамм и 2-грамм для каждой статьи, и я хотел...

9
Ошибка при запуске glmnet в многочлене [закрыто]

Закрыто. Этот вопрос не по теме . В настоящее время он не принимает ответы. Хотите улучшить этот вопрос? Обновите вопрос, чтобы он соответствовал теме перекрестной проверки. Закрыто 9 месяцев назад . Проблема, упомянутая в этом вопросе, исправлена ​​в версии 1.7.3 пакета R glmnet. У меня возникли...

9
Логистическая регрессия: максимизация истинных положительных результатов - ложных положительных результатов

У меня есть модель логистической регрессии (подходит через glmnet в R с упорядоченной упругой сетью), и я хотел бы максимизировать разницу между истинными положительными и ложными положительными сторонами. Для этого на ум пришла следующая процедура: Подходит стандартная модель логистической...