Изучение решения вычислительных задач путем использования нескольких процессоров одновременно.
Я рассматриваю возможность изучения нового языка для использования в проектах численного / имитационного моделирования в качестве (частичной) замены для C ++ и Python, которые я сейчас использую. Я столкнулся с Джулией , которая звучит как-то идеально. Если он выполняет все свои требования, я мог...
В настоящее время я изучаю параллельные методы для интеграции ODE. Существует много новой и старой литературы, описывающей широкий спектр подходов, но я не нашел каких-либо недавних обзоров или обзорных статей, описывающих эту тему в целом. Есть книга Burrage [1], но ей почти 20 лет, и,...
Я ищу информацию от всех, кто пытался использовать OpenCL в своем научном коде. Кто-нибудь пробовал (недавно) ViennaCL ? Если да, то как это сравнить с острием ? Как насчет OCLTools ? Это соответствует обещанию? Если это так, будет ли возможным начать писать математические ядра в...
Есть ли в Python инструменты, которые похожи на парфор Matlab? Я нашел эту ветку , но ей четыре года. Я подумал, что, может быть, кто-то здесь может иметь более свежий опыт Вот пример типа вещи, которую я хотел бы распараллелить: X = np.random.normal(size=(10, 3)) F = np.zeros((10, )) for i in...
Этот вопрос был перенесен из переполнения стека, потому что на него можно ответить в обмене стеками вычислительной науки. Мигрировал 7 лет назад . Существуют ли какие-либо известные проблемы / алгоритмы в научных вычислениях, которые нельзя ускорить распараллеливанием? Во время чтения книг по CUDA...
Как гравитационная проблема n-тела может быть решена численно параллельно? Возможен ли компромисс между точностью и сложностью? Как точность влияет на качество модели?...
Я сейчас не запускаю никакой параллельный код, но я ожидаю, что в будущем буду выполнять параллельный код, используя гибрид OpenMP и MPI. Отладчики были для меня бесценным инструментом при запуске серийных проектов. Кто-нибудь может порекомендовать параллельный отладчик (или несколько отладчиков)...
У меня есть приложение, которое можно тривиально распараллелить, но его производительность в значительной степени связана с вводом / выводом. Приложение считывает один входной массив, хранящийся в файле, размер которого обычно составляет 2-5 ГБ (но я ожидаю, что это число будет расти в будущем)....
Хотите улучшить этот пост? Предоставьте подробные ответы на этот вопрос, включая цитаты и объяснение того, почему ваш ответ правильный. Ответы без достаточной детализации могут быть отредактированы или удалены. Адаптивное уточнение сетки (AMR) является распространенным методом решения проблемы...
Параллельное сокращение предполагает, что соответствующая операция является ассоциативной. Это предположение нарушается при добавлении чисел с плавающей запятой. Вы можете спросить, почему я забочусь об этом. Что ж, это делает результаты менее воспроизводимыми. И это ухудшается, когда моделируемый...
Моя диссертация посвящена разработке численных методов для моделирования снижения горения. Я использую свои методы исключительно в химической модели моделирования горения, и у меня есть много примеров для моделирования 0-D (без потока). Я хотел бы запустить симуляции, в которых есть потоки,...
Большая часть моей собственной работы вращается вокруг того, чтобы алгоритмы масштабировались лучше, и один из предпочтительных способов показать параллельное масштабирование и / или параллельную эффективность - это построить производительность алгоритма / кода по количеству ядер, например где ось...
Извините за длинный пост, но я хотел включить все, что я думал, было актуально с первого взгляда. Что я хочу Я реализую параллельную версию методов подпространств Крылова для плотных матриц. В основном GMRES, QMR и CG. Я понял (после профилирования), что моя рутина DGEMV была жалкой. Поэтому я...
Я запускаю моделирование молекулярной динамики (MD), используя несколько программных пакетов, таких как Gromacs и DL_POLY. Gromacs теперь поддерживает как алгоритмы разложения частиц, так и разложения доменов. По умолчанию в моделированиях Gromacs используется декомпозиция домена, хотя в течение...
Я оптимизирую функцию из 10-20 переменных. Плохая новость заключается в том, что оценка каждой функции обходится дорого, примерно 30 минут последовательного вычисления. Хорошей новостью является то, что в моем распоряжении кластер с несколькими десятками вычислительных узлов. Таким образом, вопрос:...
При численном решении начальных краевых УОП очень распространено использование параллелизма в пространстве . Гораздо реже использовать некоторую форму параллелизма при дискретизации по времени , и этот параллелизм обычно гораздо более ограничен. Мне известно о растущем количестве кодов и...
Я распараллеливаю код для численного решения пятимерной модели баланса населения. В настоящее время у меня есть очень хороший параллельный код MPICH2 в FORTRAN, но когда мы увеличиваем значения параметров, массивы становятся слишком большими, чтобы работать в режиме распределенной памяти. У меня...
Обычно я пишу последовательный код, а когда я делаю, я пишу модульные тесты с помощью некоторой среды тестирования в стиле xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose или среды тестирования Google C ++). Основываясь на беглом поиске в Google, я мало что видел в том, как практикующие юнит тестируют код,...
У меня есть коллекция вычислительных моделей, которые можно описать как асинхронные клеточные автоматы. Эти модели напоминают модель Изинга, но немного сложнее. Кажется, что такие модели выиграли бы от работы на GPU, а не на CPU. К сожалению, распараллелить такую модель довольно непросто, и мне...
Насколько я понимаю, многосеточный метод решает линейную систему, решая более грубую версию той же проблемы (устраняя низкочастотную ошибку), затем проецируя обратно в точную сетку, чтобы сгладить высокочастотные ошибки. Для больших систем я вижу, как итерационный метод может быть реализован...