Раздел химии, посвященный использованию математических моделей для решения задач химии.
Недавно я столкнулся с формулировкой мета-феномена : « два - это легко, три - трудно » (так сформулировал Федерико Полони), которую можно описать следующим образом: Когда определенная проблема сформулирована для двух сущностей, ее относительно легко решить; однако алгоритм для формулировки трех...
Вам удалось наконец выяснить, как атомы пространственно расположены на вашей недавно обнаруженной молекулярной сущности. С помощью, скажем, спектроскопических средств вы теперь обладаете множеством координат атомов, типов атомов, длин связей, типов связей и тому подобного для вашей молекулы. Теперь...
Я читал о вычислительной науке в Википедии, но мое понимание не очень ясно. Включает ли вычислительная наука программирование? Насколько отличается вычислительная наука от вычислительной _ ____ , где пробелом может быть любая дисциплина (материаловедение, инженерия, химия, биология и т. Д.)? (Я...
Что такое коррекция противовеса? Можете ли вы объяснить, когда это необходимо и
В частности, я хочу расширить работу с B3LYP, начатую с Gaussian 03, но продолженную с GAMESS-US. Энергии, предоставляемые стандартными методами B3LYP, не одинаковы. Об этом говорится в руководстве GAMESS-US (раздел «Дополнительная информация»): Обратите внимание, что B3LYP в GAMESS частично...
Существуют ли случаи, когда Хартри-Фок не является хорошим приближением для расчета равновесной геометрии, когда молекула находится в состоянии, не нарушающем связь?...
Есть ли алгоритм, который перечисляет графики, которые соответствуют некоторой тесселяции Делоне точек в 3D? Если да, есть ли эффективная параметризация геометрии, которая соответствует любому «графу Делоне»? Я стремлюсь систематически перечислять все стабильные геометрии молекул определенного...
Белки, как правило, представлены в виде мультфильмов, с β-листами в виде стрелок и α-спиралями в виде катушек: Мне интересно, есть ли где-нибудь ссылка, которая описывает конструкцию этого представления? То есть, какие математические объекты используются для построения этой графики, и на каких...
Я новичок в программировании и пытаюсь решить свою первую большую проблему и написать свою первую большую программу. Я искал примеры кода с открытым исходным кодом для изучения, но до сих пор нашел код только на тех языках, которые я не до конца понимаю, или это делает связанные, но слишком далекие...
Я хотел бы представить молекулярную вибрацию, которая не является нормальным режимом. Я хотел бы представить статическое, векторное представление движения, и мне нужна гибкость в векторном стиле (размер, цвет и т. Д.). Я также заинтересован в создании видео вибрации. Какие хорошие ресурсы для...
Я делаю 1d и 2d изображения с использованием Matlab прямо сейчас для сравнения точности с данной моделью. Мне нужно сравнить мои методы со стандартной гауссовой моделью .wfn, и я собираюсь сделать это путем анализа плотности молекулы, а также лапласиана. Я заинтересован в создании двумерных...
Говорят, что некоторые базисы "согласованы по корреляции". Что это означает на
В методе самосогласованного поля Хартри-Фока для решения не зависящего от времени электронного уравнения Шредингера мы стремимся минимизировать энергию основного состояния, , системы электронов во внешнем поле относительно выбора спина орбитали, .E0E0E_{0}{χi}{χi}\{\chi_{i}\} Мы делаем это путем...