Вопросы с тегом «computational-biology»

17
Разбор данных о структуре белка в С

Мой опыт в области геномики, но я недавно работал над проблемами, связанными со структурой белка. Я написал несколько соответствующих программ на C, создавая собственный анализатор PDB-файлов с самого начала. Я не беспокоился о создании действительно надежного синтаксического анализатора, я просто...

14
Лучшие практики для описания агентных моделей

Я довольно много работаю в области математической биологии / эпидемиологии, где в большинстве работ по моделированию / вычислительной науке все еще преобладают наборы ODE, правда, иногда довольно сложные их наборы. Одним из плюсов этих моделей является то, что их довольно легко описать и...

10
Как сделать хорошую сетку в биологически точной модели с очень маленькими доменами

Я пытался создать биологически точную двухмерную пространственную модель слоев ткани, где бывают разные физиологические процессы. Это включает главным образом химические реакции, диффузию и потоки через границы. Я делаю эту модель в COMSOL Multiphysics, программном пакете с конечными элементами,...

9
Символьное решение системы из 7 нелинейных уравнений

У меня есть система обыкновенных дифференциальных уравнений - 7 уравнений и ~ 30 параметров, управляющих их поведением, как часть математической модели передачи болезни. Я бы хотел , чтобы найти устойчивые состояния для этих уравнений Changing dx/dt = rest of the equationдля 0 = equationкаждого из...