Я знаю, что этот вопрос задавался ранее: Справочник по экологическим исследованиям, но это не то, что я ищу.
Что я ищу, так это если бы кто-нибудь мог порекомендовать хорошую книгу (или канонический справочник) по статистической экологии? У меня очень хорошее понимание статистики, поэтому книга действительно может быть на любом уровне. Я бы использовал эту книгу, чтобы больше узнать о применении статистики в экологии, чем о чем-либо еще, поэтому я бы высоко оценил даже вводную книгу с хорошими / интересными примерами. Кроме того, мое исследование, как правило, ориентировано на байесовскую статистику, поэтому книга, включающая байесовскую статистику, еще лучше!
self-study
references
ecology
user25658
источник
источник
Ответы:
Вот некоторые хорошие книги, которые я лично рекомендую:
Hilborn & Mangel (1997) Экологический детектив: сопоставление моделей с данными . Издательство Принстонского университета.
Это больше о статистике с экологическими примерами, но в этом нет ничего плохого. Это дало бы хорошее представление о том, как статистика может использоваться в экологии. Обратите внимание на дату; это не будет охватывать некоторые из последних разработок или приложений.
М. Генри Х. Стивенс (2009) Учебник экологии с R . Springer.
Возможно, слишком простой и не особенно пространственный, но он охватывает различные темы, которые мы преподаем экологам, и иллюстрирует экологическую теорию и модели с помощью кода R.
BM Bolker (2008) Экологические модели и данных в R . Издательство Принстонского университета.
Я люблю эту книгу. В нем рассматриваются темы, с которыми вы будете знакомы, если учесть свой опыт в области статистики, но в экологическом контексте. Акцент на подборе моделей и их оптимизации из базовых принципов с использованием кода R.
Джеймс С. Кларк (2007). Модели экологических данных: введение . Издательство Принстонского университета.
Не откладывайте на «введение» в названии; это не что иное, как введение. Широкий охват, много теории, упор на подбор моделей вручную с использованием байесовских подходов (например, в руководстве по лаборатории R обсуждается написание ваших собственных сэмплеров Gibbs!)
Не книга, но я добавлю это, поскольку вы особо упомянули свой интерес к гауссовским процессам. Взгляните на Интегрированную Вложенную Аппроксимацию Лапласа (INLA), которая имеет веб-сайт . Это пакет R и имеет много примеров для игры. Если вы посмотрите на их FAQ, вы найдете несколько статей, описывающих подход, в частности:
Х. Рю, С. Мартино и Н. Шопен. Приближенный байесовский вывод для скрытых гауссовских моделей с использованием интегрированных вложенных аппроксимаций Лапласа (с обсуждением). Журнал Королевского статистического общества, Серия B, 71 (2): 319 {392, 2009. (PDF доступен здесь ).
источник
Вот некоторые хорошие книги по экологии, основанные на байесовской статистике:
Кери, М. 2010. Введение в WinBUGS для экологов: байесовский подход к регрессии, ANOVA, смешанные модели и связанный анализ . Академическая пресса.
Кери М. и М. Шауб. 2011. Байесовский анализ населения с использованием WinBUGS: иерархическая перспектива . Академическая пресса.
Ройл, JA и RM Dorazio. 2008. Иерархическое моделирование и логический вывод в экологии: анализ данных о населении, метапопуляции и сообществах . Академическая пресса
Я также нахожу Zuur et al. (2009) очень полезно.
Зуур А., Э. Н. Иено, Н. Уокер, А. А. Савельей и Г. М. Смит. Смешанные эффекты Модель и расширение в области экологии с R . Springer.
источник
Джек Вайс (пусть он пухом ) был превосходным обученным статистиком, который также действительно хорошо разбирался в принципах экологии / экологии. Он служил бесценным статистическим консультантом для ученых-экологов в США и даже во всем мире.
Хотя у него нет книг, о которых я знаю, его заметки о курсах все еще доступны в Интернете :
Статистические методы в экологии [или 2012 версия ]
Статистика для науки об окружающей среде [или 2007 ; Версия 2012 ]
Статистика по экологии и эволюции
Экология 145 - Статистический анализ
Я уверен, что существует множество совпадений между курсами, но его заметки (и код R) доступны для каждого из этих курсов и должны оказаться очень полезными для большинства людей, посещающих этот пост.
источник