Какой метод является предпочтительным для проведения специальных тестов для внутрисубъектных тестов? Я видел опубликованную работу, где используется HSD Тьюки, но обзор Keppel и Maxwell & Delaney предполагает, что вероятное нарушение сферичности в этих конструкциях делает ошибочный термин ошибочным, и этот подход проблематичным. Maxwell & Delaney предлагают подход к проблеме в своей книге, но я никогда не видел, чтобы это было так в любом пакете статистики. Является ли подход, который они предлагают, уместным? Будет ли разумной поправка Бонферрони или Сидака на множественные парные выборочные t-тесты? Приемлемый ответ предоставит общий код R, который может выполнять пост-специальные операции на простых, многоцелевых и смешанных схемах, созданных ezANOVA
функцией в ez
пакете, и соответствующие цитаты, которые, вероятно, будут обсуждаться с рецензентами.
источник
lme
илиlmer
функцией или с некоторыми более традиционными методами , как Т-тест или ANOVA (как я в настоящее время пытаюсь использовать его с ANOVAs).lme
, см. Комментарии к принятому ответу: stats.stackexchange.com/q/14088/442 С объектом класса, которыйlme
вы можете использоватьmultcomp
для внутрисубъектных эффектов. Он предлагает различные типы корректировки альфа-ошибок, но в основном те, которые вам не особенно нравятся (как предложенный мной вариант, который был признан сообществом «правильным»). Помимо виньетки, есть также книга,multcomp
которая объясняет все методы. Если вы хотите пост-hocs без настройки, используйте либоfit.contrast
из, либо изgmodel
новогоcontrast
пакета.ezANOVA
функции? Если это так, я думаю, что могу ответить на этот вопрос, но A будет полагаться на тесты для одномерных моделей, для которых сферичность является критическим допущением. Если вам не нужно, чтобы A ограничивался вычислениямиez
пакета ANOVA , я мог бы дать A, который использует многовариантные модели для специальных тестов.Ответы:
Посмотрите на пакет multcomp и его виньетку « Одновременный вывод в общих параметрических моделях» . Я думаю, что он должен делать то, чего не хотел, и виньетка имеет очень хорошие примеры и обширные ссылки.
источник
В настоящее время я пишу статью, в которой имею удовольствие проводить сравнения как между предметами, так и внутри них. После обсуждения с моим руководителем мы решили запустить t -tests и использовать довольно простой
Holm-Bonferroni method
( википедия ) для исправления кумуляции альфа-ошибок. Он контролирует семейную частоту ошибок, но обладает большей мощностью, чем обычная процедура Бонферрони. Процедура:Cite Holm (1979), которую можно скачать по ссылке в википедии .
источник
pairwise.t.test()
для парных сравнений либо метод Бонферрони, либо метод Хольма-Бонфа, но результаты резко различаются в зависимости от того, использую ли я объединенный sd или рассматриваю каждое сравнение как отдельное, независимое значение. -тестовое задание. Благодарность!Я вспоминаю некоторые дискуссии по этому вопросу в прошлом; Я не знаю о какой-либо реализации подхода Максвелла и Делани, хотя это не должно быть слишком сложно сделать. Взгляните на « Повторные измерения ANOVA с использованием R », где также показан один метод решения проблемы сферичности в HSD Тьюки .
Вы также можете найти это описание теста интереса Фридмана .
источник
Есть два варианта для выводимых F-тестов в SPSS. Multivariate НЕ предполагает сферичность, поэтому использует различные попарные корреляции для каждой пары переменных. «Тесты эффектов внутри субъекта», включая любые специальные тесты, предполагают сферичность и вносят некоторые исправления для использования общей корреляции во всех тестах. Эти процедуры являются наследием тех дней, когда вычисления были дорогостоящими, и они являются пустой тратой времени на современные вычислительные средства.
Моя рекомендация заключается в том, чтобы принять омнибус МНОГООБРАЗНЫЙ F для любых повторных мер. Затем проведите последующий парный t-критерий или ANOVA только с двумя уровнями в каждом повторном измерении сравнения, если есть также факторы между субъектами. Я бы сделал простую поправку bon ferroni деления уровня альфа на количество тестов.
Также обязательно посмотрите на размер эффекта [доступно в диалоге опций]. Большие величины эффекта, которые «близки» к значительным, могут быть более достойны внимания [и будущих экспериментов], чем небольшие, но значимые эффекты.
Более сложный подход доступен в процедуре SPSS MIXED, а также в менее удобных [но бесплатных] пакетах, таких как R.
Подводя итоги, в SPSSS, многовариантный F, за которым следуют парные специальные столбцы с Bon Ferroni с Bonferroni, должно быть достаточно для большинства потребностей.
источник
Я буду использовать R-функцию qtukey (1-alpha, означает, df), чтобы сделать семейные CI.
источник