Метаанализ на исследованиях с 0-частотными клетками

9

Я знаком с мета-анализом и мета-регрессионными методами (используя пакет R metaforот Viechtbauer), но недавно я наткнулся на проблему, которую не могу легко решить. Скажем, у нас есть болезнь, которая может передаваться от матери к нерожденному ребенку, и она изучалась уже несколько раз. Мать и ребенок были проверены на вирус сразу после рождения. Поскольку нерожденный ребенок не может получить вирус, кроме матери, можно ожидать кросс-таблицы, такие как:

           | neg kid | pos kid
mother neg |    A    |   C=0
-----------|---------|--------
mother pos |    B    |   D

Очевидно, что использование отношения шансов (ИЛИ) приводит к ошибкам, которые можно было бы разделить на 0. То же самое для относительных рисков:

A/(A+В)0/(0+D)

Теперь исследователи хотят проверить (бессмысленную) гипотезу о том, связана ли инфекция ребенка с инфекцией матери (что кажется очень и очень очевидным). Я пытаюсь переформулировать гипотезу и придумать что-то, что имеет смысл, но я не могу что-то найти.

Чтобы усложнить ситуацию, некоторые дети с отрицательными мамами на самом деле являются положительными, вероятно, из-за инфекции в первую неделю. Так что у меня есть только ряд исследований, где C = 0.

У кого-нибудь есть идея о том, как статистически суммировать данные различных исследований по такой схеме. Ссылки на научные статьи также приветствуются.

Йорис Мейс
источник
Я бы не назвал эти данные «неверно сформированными» - у них просто есть ячейка с нулевой частотой, что в значительной степени связано с большим эффектом. С точки зрения приложения это «хорошая вещь».
Анико
@Aniko: Я согласен, слово «уродливый» - это неправильное слово, но я не знал, как это сказать иначе.
Йорис Мейс

Ответы:

5

Мне кажется, это одна из редких ситуаций, в которых может быть лучше провести мета-анализ различий риска, а не коэффициентов риска или коэффициентов шансов. Разница риска оценивается в каждом исследовании как . Это должно быть конечным во всех исследованиях, даже когда , поэтому не должно быть проблем с метаанализом.п(Кяd+|MUм+)-п(Кяd+|MUм-)D/(В+D)-С/(A+С)Сзнак равно0

Я согласен, что кажется довольно бессмысленным рассматривать гипотезу о том, что эта разница риска равна нулю. Но имеет смысл оценить, насколько он велик, то есть, насколько вероятнее, что у ребенка есть вирус, когда его мама имеет, чем когда его нет.

универсальный
источник
Различия в риске - это действительно путь, который можно понять и статистикам. Принятый.
Йорис Мейс
6

Обычно 0 означают, что вы должны использовать точные методы, а не полагаться на асимптотические методы, такие как метаанализ с коэффициентами шансов. Если вы хотите предположить, что эффект от обучения установлен, точный тест Maentel-Hanszel является подходящим вариантом. Для точного анализа случайных эффектов необходимо использовать модель биномиальной регрессии с эффектом случайного исследования. Я сделал и то, и другое в недавней прикладной статье, но раздел «Методы» не будет для вас более полезным, поскольку он по существу передает эту информацию.

редактировать

Эта статья не применяется, но именно здесь я получил идею, когда столкнулся с той же проблемой:
[1] Ханс К. ван Хоуилинген, Лидия Р. Арендс и Тео Стийнен. Продвинутые методы в метаанализе: многомерный подход и метарегрессия. Статистика в медицине , 2002; 21: 589-624

Вот статья, в которой я использовал этот подход (он неочевиден в аннотации, но упоминается в разделе методов):
[2] Триведи Х, Наделла Р, Сабо А. Гидратация бикарбонатом натрия для предотвращения контраста, вызванного нефропатия: метаанализ рандомизированных контролируемых исследований. Клин Нефрол. 2010 окт; 74 (4): 288-96.

Анико
источник
1
+1 за использование биномиальных моделей со смешанным эффектом. Увы, это было отклонено как «не стандартный метод». Если вы можете дать мне несколько ссылок на статьи, где этот подход используется в настройках мета-анализа, вы бы мне очень помогли. Заранее спасибо.
Йорис Мейс
Я отредактировал свой ответ с некоторыми ссылками.
Анико
0

В документации пакета metafor говорится, что «Добавление небольшой константы в ячейки таблиц 2x2 является распространенным решением этой проблемы». а также предоставляет возможность сделать это в вызове rma ().

jokel
источник
Общие решения не всегда правильные решения.
Йорис Мейс