Диагностика сходимости Гельмана и Рубина, как обобщить работу с векторами?

14

Диагностика Гельмана и Рубина используется для проверки сходимости нескольких параллельных цепочек mcmc. Он сравнивает дисперсию внутри цепочки с дисперсией между цепями, описание приведено ниже:

Шаги (для каждого параметра):

  1. Запустите m ≥ 2 цепочки длиной 2n из перераспределенных начальных значений.
  2. Откажитесь от первых n розыгрышей в каждой цепочке.
  3. Рассчитайте дисперсию внутри цепи и между цепями.
  4. Рассчитайте оценочную дисперсию параметра как взвешенную сумму дисперсии внутри цепи и между цепями.
  5. Рассчитайте потенциальный коэффициент уменьшения масштаба.
  6. Пункт списка

Я хочу использовать эту статистику, но переменные, с которыми я хочу использовать это случайные векторы.

Имеет ли смысл в этом случае брать среднее значение ковариационных матриц?

Тим
источник

Ответы:

17

Рекомендация: просто рассчитайте PSRF отдельно для каждого скалярного компонента

Оригинальная статья Gelman & Rubin [1], а также учебник по анализу байесовских данных Gelman et al. [2] рекомендует рассчитывать потенциальный коэффициент уменьшения масштаба (PSRF) отдельно для каждого интересующего скалярного параметра. Чтобы вывести сходимость, требуется, чтобы все PSRF были близки к 1. Неважно, что ваши параметры интерпретируются как случайные векторы, их компоненты являются скалярами, для которых вы можете вычислять PSRF.

Брукс и Гельман [3] предложили многовариантное расширение PSRF, которое я рассмотрю в следующем разделе этого ответа. Однако, чтобы процитировать Gelman & Shirley [4]:

[...] эти методы могут иногда представлять избыточное количество: отдельные параметры могут быть хорошо оценены, даже если приблизительная сходимость моделирования многомерного распределения может занять очень много времени.

Альтернатива: многомерное расширение Брукса и Гельмана

WB

V^=n1nW+1nB,
nV^,W
R^=maxaaTV^aaTWa=n1n+(m+1m)λ1,
mλ1W1V^/nλ10nR^

Ссылки

[1] Гельман, Эндрю и Дональд Б. Рубин. «Вывод из итеративного моделирования с использованием нескольких последовательностей». Статистическая наука (1992): 457-472.

[2] Gelman, Andrew, et al. Байесовский анализ данных. CRC press, 2013.

[3] Брукс, Стивен П. и Эндрю Гельман. «Общие методы контроля сходимости итерационного моделирования». Журнал вычислительной и графической статистики 7.4 (1998): 434-455.

[4] Гельман, Эндрю и Кеннет Ширли. «Вывод из моделирования и мониторинга конвергенции». (Глава 6 в Brooks, Steve, et al., Eds. Handbook of Markov Chain Monte Carlo. CRC Press, 2011.)

Все статьи, кроме учебника [2], доступны на веб-сайте Эндрю Гельмана Эндрю Гельман .

Юхо Коккала
источник