Как подогнать регрессию типа

9

У меня есть данные временного ряда, где измеряемая переменная представляет собой дискретные положительные целые числа (числа). Я хочу проверить, есть ли тенденция со временем (или нет). Независимая переменная (x) находится в диапазоне 0-500, а зависимая переменная (y) находится в диапазоне 0-8.

Я думал, что я отвечу на это, подгоняя регрессию формы, y = floor(a*x + b)используя обычные наименьшие квадраты (OLS).

Как бы я сделал это с помощью R (или Python)? Существует ли существующий пакет для него, или мне лучше написать свой собственный алгоритм?

PS: я знаю, что это не идеальный метод, но мне нужно сделать относительно простой анализ, который я действительно могу понять - мой опыт - биология, а не математика. Я знаю, что нарушаю предположения об ошибке в измеряемой переменной и независимости измерений от времени.

r regression python afaulconbridge
источник

5

Хотя математически естественно попытаться регрессировать эту форму, за ней скрывается статистическая ошибка: теперь термин ошибки будет сильно коррелировать с прогнозируемым значением. Это довольно серьезное нарушение допущений OLS. Вместо этого используйте технику, основанную на подсчете, как предложено в ответе Грега Сноу (Я с радостью проголосовал за этот вопрос, потому что он отражает некоторые реальные мысли и ум. Спасибо, что

задали

11

Вы можете вписать модель, которую вы указали, используя nlsфункцию (нелинейных наименьших квадратов) R, но, как вы сказали, это нарушит многие из предположений и все же, вероятно, не будет иметь большого смысла (вы говорите, что прогнозируемый результат является случайным на шаге функция, а не целые значения вокруг плавно растущих отношений).

Более распространенный способ подбора данных подсчета - это использование регрессии Пуассона с использованием glmфункции in. RПервый пример на странице справки - это регрессия Пуассона, хотя, если вы не очень хорошо знакомы со статистикой, лучше проконсультироваться со статистиком, чтобы убедиться, что что вы делаете вещи правильно.

Если значение 8 является абсолютным максимумом (невозможно увидеть большее количество, а не только то, что вы видели), то вы можете рассмотреть вопрос о пропорциональной регрессии логистических шансов, есть несколько инструментов, чтобы сделать это в пакетах R, но вы действительно стоит привлечь статистика, если вы хотите это сделать.

Грег Сноу
источник

«Вы говорите, что прогнозируемый результат является случайным для пошаговой функции, а не для целочисленных значений вокруг плавно растущих отношений». В итоге я пошел с пуассоновской регрессией по glm. Это не идеальный выбор, но «достаточно хороший» для того, что мне нужно.

afaulconbridge

10

$\def\lf{\lfloor}\def\rf{\rfloor}\def\pnorm{\mathrm{pnorm}}$ Очевидно, что предложение Грега - первое, что нужно попробовать: регрессия Пуассона является естественной моделью во многих конкретных случаях. ситуации.

Однако модель, которую вы предлагаете, может появиться, например, когда вы наблюдаете округленные данные: с обычными ошибками .

Y_{i} = ⌊ a x_{i} + b + ϵ_{i} ⌋,

$Y_i = \lf ax_i + b + \epsilon_i \rf,$

ϵ_{i}

$\epsilon_i$

Я думаю, что интересно посмотреть, что можно с этим сделать. Обозначим через cdf стандартной нормальной переменной. Если , то с использованием знакомых компьютерных обозначений. $F$ $\epsilon \sim \mathcal N(0,\sigma^2)$

\begin{aligned} P (⌊ a x + b + ϵ ⌋ = k) & = F (\frac{k - b + 1 - a x}{σ}) - F (\frac{k - b - a x}{σ}) \\ = p n o r m (k + 1 - a x - b, s d = σ) - p n o r m (k - a x - b, s d = σ), \end{aligned}

$\begin{align*} \mathbb P\left(\lf ax + b + \epsilon \rf = k\right) &= F\left({k-b+1-ax\over \sigma}\right) - F\left({k-b-ax\over \sigma}\right)\\ &= \pnorm(k+1-ax-b,sd=\sigma) - \pnorm(k-ax-b,sd=\sigma),\end{align*}$

Вы наблюдаете точки данных . Логарифмическая вероятность определяется как Это не идентично наименьших квадратов. Вы можете попытаться максимизировать это с помощью численного метода. Вот иллюстрация в R: $(x_i,y_i)$

ℓ (a, b, σ) = \sum_{i} \log (F (\frac{y_{i} - b + 1 - a x_{i}}{σ}) - F (\frac{y_{i} - b - a x_{i}}{σ})) .

$\ell(a,b,\sigma) = \sum_i \log\left( F\left({y_i-b+1-ax_i\over \sigma}\right) - F\left({y_i-b-ax_i\over \sigma}\right) \right).$

log_lik <- function(a,b,s,x,y)
  sum(log(pnorm(y+1-a*x-b, sd=s) - pnorm(y-a*x-b, sd=s)));

x <- 0:20
y <- floor(x+3+rnorm(length(x), sd=3))
plot(x,y, pch=19)
optim(c(1,1,1), function(p) -log_lik(p[1], p[2], p[3], x, y)) -> r
abline(r$par[2], r$par[1], lty=2, col="red")
t <- seq(0,20,by=0.01)
lines(t, floor( r$par[1]*t+r$par[2]), col="green")

lm(y~x) -> r1
abline(r1, lty=2, col="blue");

округленная линейная модель

В красном и синем цвете линии найдены путем численного максимизации этой вероятности и наименьших квадратов соответственно. Зеленая лестница - это для найденного по максимальному правдоподобию ... это говорит о том, что вы можете использовать наименьшие квадраты, вплоть до перевода на 0,5, и получить примерно такой же результат; или, что наименьшие квадраты хорошо соответствуют модели где - ближайшее целое число. Округленные данные встречаются так часто, что я уверен, что это известно и было тщательно изучено ... $ax+b$ $\lf ax +b\rf$ $a,b$ $b$

Y_{i} = [a x_{i} + b + ϵ_{i}],

$Y_i = [ a x_i + b +\epsilon_i],$

[x] = ⌊ x + 0.5 ⌋

$[x] = \lf x + 0.5 \rf$

Элвис
источник

4

+1 Я люблю эту технику и несколько лет назад действительно написал статью об этом в журнал анализа рисков. (Некоторые аналитики риска весьма заинтересованы в интервальных данных.) Они были отклонены как «слишком математические» для их аудитории. :-(. Один совет: при использовании численных методов всегда полезно указывать хорошие начальные значения для решения. Рассмотрите возможность применения OLS к необработанным данным, чтобы получить эти значения, а затем «отшлифуйте» их с помощью числового оптимизатора.

whuber

Да, это хорошее предложение. На самом деле, в этом случае я выбираю удаленные значения, чтобы подчеркнуть, что «это работает», но на практике ваше предложение будет единственным решением, чтобы избежать начала из очень плоской области, в зависимости от данных ...

Элвис

Как подогнать регрессию типа

Ответы: