Оценка вероятности выживания в R

14

Основываясь на выборке из времен выживания, я хотел бы оценить вероятность времени выживания для некоторого конкретного , используя оценку Каплана-Мейера. Возможно ли сделать это в ? Пожалуйста, обратите внимание, что не обязательно время события.nttRt

user7064
источник
1
Конечно: посмотрите на функцию Survfit () пакета для выживания [type help (package = "Survival))]
Стефан Лоран,
3
@Stephane Laurent: функция surfit () выводит приблизительную выживаемость во время событий. Но я хотел бы иметь автоматическую процедуру для вычисления этого выживания в любое время t. Спасибо ...
user7064
Тогда используйте прибл. ()
Стефан Лоран
можно пример?
user7064

Ответы:

23

Вы можете использовать вывод survfitфункции из survivalпакета и передать его stepfun.

km <- survfit(Surv(time, status)~1, data=veteran)
survest <- stepfun(km$time, c(1, km$surv))

Теперь survestэто функция, которая может быть оценена в любое время.

> survest(0:100)
  [1] 1.0000000 0.9854015 0.9781022 0.9708029 0.9635036 0.9635036 0.9635036
  [8] 0.9416058 0.9124088 0.9124088 0.8978102 0.8905109 0.8759124 0.8613139
 [15] 0.8613139 0.8467153 0.8394161 0.8394161 0.8175182 0.8029197 0.7883212
 [22] 0.7737226 0.7664234 0.7664234 0.7518248 0.7299270 0.7299270 0.7225540
 [29] 0.7225540 0.7151810 0.7004350 0.6856890 0.6856890 0.6783160 0.6783160
 [36] 0.6709430 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700
 [43] 0.6561970 0.6488240 0.6414510 0.6340780 0.6340780 0.6340780 0.6267050
 [50] 0.6193320 0.6193320 0.5972130 0.5750940 0.5677210 0.5529750 0.5529750
 [57] 0.5456020 0.5456020 0.5456020 0.5382290 0.5382290 0.5308560 0.5308560
 [64] 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830
 [71] 0.5234830 0.5234830 0.5161100 0.5087370 0.5087370 0.5087370 0.5087370
 [78] 0.5087370 0.5087370 0.5087370 0.4939910 0.4939910 0.4866180 0.4866180
 [85] 0.4791316 0.4791316 0.4791316 0.4716451 0.4716451 0.4716451 0.4640380
 [92] 0.4640380 0.4564308 0.4564308 0.4564308 0.4412164 0.4412164 0.4412164
 [99] 0.4412164 0.4257351 0.4179945
Брайан Диггс
источник
У Сюрреала возникла проблема: он ищет ответ на StackExchange, находит тот же вопрос и понимает, что вы ответили на него почти 7 лет назад ...
Брайан Диггс
7

Параметр времени может быть передан в итоговую функцию объекта перестройки:

summary(km, times=100)

Вектор также может быть передан:

summary(km, times=0:100)
bensentropy
источник