С очень высокого уровня, мне кажется, что есть, как правило, 2 типа инструментов управления проектами: Традиционные трекеры, такие как Fogbugz, JIRA, BugZilla, Trac, Redmine и т. Д. Виртуальные платы для карт / инструменты управления гибкими проектами, такие как Pivotal Tracker, GreenHopper,...