Вопросы с тегом «bioinformatics»

19
Лучший дистрибутив Linux для научных вычислений? [закрыто]

В настоящее время этот вопрос не очень подходит для нашего формата вопросов и ответов. Мы ожидаем, что ответы будут подтверждены фактами, ссылками или опытом, но этот вопрос, скорее всего, вызовет дебаты, споры, опрос или расширенное обсуждение. Если вы считаете, что этот вопрос можно улучшить и,...

19
Запуск команды для многих файлов

У меня есть папка с множеством файлов (xyz1, xyz2, вплоть до xyz5025), и мне нужно запустить скрипт для каждого из них, получив xyz1.faa, xyz2.faa и т. Д. В качестве выходных данных. Команда для одного файла: ./transeq xyz1 xyz1.faa -table 11 Есть ли способ сделать это автоматически? Может быть,...

9
Как посчитать количество символов в строке, кроме конкретного символа?

Это часть файла N W N N N N N N N N N N C N N N N N N N N N N A N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N G N N N N N N N N N N C N N N C N N N N N N C C N N N N N N N N В каждой строке я хочу подсчитать общее количество всех символов, которые не являются "N" вывод моего желания 1 1 1 0 1 2 2...

8
Удаление строк, содержащих NA в каждом столбце

У меня есть файл с разделителями табуляции, который выглядит следующим образом: gene v1 v2 v3 v4 g1 NA NA NA NA g2 NA NA 2 3 g3 NA NA NA NA g4 1 2 3 2 Количество полей в каждой строке фиксировано и одинаково. Я хочу удалить эти строки из вышеуказанного файла, где все поля для каждой строки от...