Можно ли автоматизировать настройку настроек Internet Explorer?

Можно ли автоматизировать настройку некоторых параметров Internet Explorer с помощью какого-либо автономного сценария или программы (а не с помощью групповой политики или управления доменом)?

В частности, мне интересно, можно ли добавить сайт в «Параметры просмотра в режиме совместимости», «Надежные сайты» и можно ли установить всплывающие окна для загрузки в новые вкладки (а не в отдельные всплывающие окна).

Вы можете достичь всего этого через групповую политику.

Перейдите к:

User Configuration -> Policies -> Administrative Templates -> 
Windows Components -> Internet Explorer

Вот пример изменения поведения всплывающих окон:

Есть много вариантов, вы можете прочитать больше о конфигурации здесь .

Чтобы сделать это с помощью скрипта, вы можете редактировать их непосредственно в реестре с помощью VBS или powershell.

Смотрите: Настройки реестра для настроек совместимости IE, чтобы добавить сайт?