Хотите знать, что означает эта диаграмма анализа бобовых графиков?

11

Как интерпретировать и генерировать бин-графики. Вот один пример, взятый из Walkes et al. 2010 . Для каких данных это наиболее полезно?

бобовый сюжет
(источник: biomedcentral.com )

Вансон Самуэль
источник
3
«Beanplot - это альтернатива коробочному графику для визуального сравнения одномерных данных между группами. В beanplot отдельные наблюдения показаны в виде маленьких линий на одномерном графике рассеяния. Рядом с этим видна оценочная плотность распределений и в среднем показано ". Выписка взята отсюда .
Для тех, кто не знает: это близкий родственник скрипичного сюжета (виоплот).

Ответы:

12

Бокплоты действительно были разработаны для обычных данных или, по крайней мере, для унимодальных данных. Beanplot показывает фактическую кривую плотности, которая является более информативной.

Форма - это плотность, а короткие горизонтальные линии представляют каждую точку данных. Это объединяет в себе лучшее из коробочного сюжета, графика плотности и коврика в одном и очень удобочитаемо.

К сожалению, выбранный вами пример решил добавить несколько более длинных строк, которые загромождают график до неузнаваемости (для меня). [Надрез]

РЕДАКТИРОВАТЬ: теперь, работая с beanplot немного больше, более длинные толстые линии являются средним (или, возможно, медианным) для каждого bean-компонента. Более длинные тонкие линии представляют собой данные с некой «укладкой», где более широкие линии указывают на более повторяющиеся значения. (Вы также можете дрожать их, что я предпочитаю, но по крайней мере «нормальная» категория уже имеет достаточную плотность точек, которые могут ухудшить дрожание.)

Я все еще думаю, что пример, который вы выбрали, является довольно загроможденным, который, возможно, можно было бы прояснить, используя джиттер вместо суммирования.

Документ , который описывает пакет R для изготовления боба участков является хорошим для чтения.

Wayne
источник
3
+1 - чтение статьи о бобовом сюжете. Я бы также предложил рабочий документ Хэдли Уикхэма « 40 лет коробочных сюжетов» . Он проходит описание множества графиков с более или менее теми же целями, что и бобовые.
Энди В.
1

Не прочитав всю статью, она, по-видимому, является одним из вариантов коробочного сюжета. Таким образом, вы можете использовать его там, где в противном случае использовали бы коробочную диаграмму, например, сравнивать одномерные распределения нескольких групп. Он отображает линию для каждой точки и накладывает оценку плотности ядра. Глядя на это, я думаю, что он может быть более информативным с небольшими объемами данных, но слишком перегружен большим количеством данных. На первый взгляд это не кажется мне потрясающим. Если вы хотите узнать что-то больше, уточните свой вопрос.

Gung - Восстановить Монику
источник