Помимо gnuplot и ggobi , какие инструменты с открытым исходным кодом люди используют для визуализации многомерных данных?
Gnuplot - более или менее базовый пакет для построения графиков.
Ггоби может сделать несколько изящных вещей, таких как:
- анимировать данные вдоль измерения или среди дискретных коллекций
- одушевленные линейные комбинации, меняющие коэффициенты
- вычислить основные компоненты и другие преобразования
- визуализировать и вращать трехмерные кластеры данных
- использовать цвета для представления другого измерения
Какие другие полезные подходы основаны на открытом исходном коде и поэтому могут свободно использоваться или настраиваться?
Пожалуйста, предоставьте краткое описание возможностей пакета в ответе.
Ответы:
Как насчет R с ggplot2 ?
Другие инструменты, которые мне действительно нравятся:
источник
источник
Решетчатый пакет в R.
Quick-R имеет краткое введение .
источник
ggobi и R-ссылки на Ggobi действительно хороши для этого. Есть более простые визуализации (iPlots очень хороши, также, как уже упоминалось, интерактивные).
Но это зависит от того, занимаетесь ли вы чем-то более специализированным. Например, TreeView позволяет визуализировать вид кластерных дендрограмм, которые вы получаете из микрочипов.
источник
Пайтона Matplotlib
источник
Точки обзора полезны для множественных наборов данных.
источник
У t-SNE есть много реализаций с открытым исходным кодом . Вероятно, одним из самых простых в использовании
sklearn.manifold.TSNE
.sklearn.manifold
содержит другие методы обучения для построения графиков ваших данных в 2D:источник
Смотрите также библиотеку построения графиков данных SCaVis . Работает на любой платформе начиная с Java. Он поддерживает множество контейнеров данных и стилей печати (2D, 3D и т. Д.)
источник