Есть несколько особенностей орбиты Плутона. Эти:
Его высокий орбитальный эксцентриситет (e = 0,25) приводит к тому, что перигелий Плутона становится немного меньше перигелия Нептуна.
Плутон имеет орбитальный резонанс с Нептуном. Его орбитальный период составляет ровно 3/2 от Нептуна. Этот орбитальный резонанс является причиной его орбитального эксцентриситета, о котором вы спрашиваете.
Плутон имеет наклонение орбиты к эклиптике 17 градусов. Никто не знает почему, мы можем только догадываться.
Происхождение эксцентричности Плутона объясняется:
На более поздних этапах формирования планет, в этой ранней Солнечной системе, планеты еще формировались. Нептун обменялся моментом импульса с остальными планетезималами, и его орбита расширилась наружу. Если бы Плутон находился на почти круговой орбите, большей, чем у Нептуна (около 33 а.е. ), существует высокая вероятность того, что Нептун сможет захватить Плутон и зафиксировать его орбитальный резонанс (это, вероятно, произошло, когда Нептун находился на уровне около 25 а.е.). Поскольку орбита Нептуна продолжала расширяться наружу, это расширение вытягивало эксцентриситет орбиты Плутона.
Источник и дальнейшее чтение: Происхождение орбиты Плутона: последствия для Солнечной системы за пределами Нептуна