Это может быть лучше всего объяснено следующим описанием.
Пакет многоцелевого назначения или пакет MT - это набор эталонных сборок, который соответствует определенной платформе .NET Framework и версии. Эталонная сборка - это сборка .NET Framework, которая обычно не имеет тел методов и внутренних или частных API. Справочные сборки содержат только ту информацию, которая нужна компилятору.
Например, существуют пакеты с множественным таргетингом для .NET Framework 3.5, .NET Framework 4, обновление 4.0.x для .NET Framework 4, .NET Framework 4.5, Windows Phone 7.5, приложения в стиле Windows Metro, Portable Class Библиотека и тд.
Visual Studio устанавливает набор пакетов многоцелевого назначения, а также такие SDK, как Visual Studio SDK, Silverlight SDK и Windows Phone SDK. Как правило, пакеты с множественным таргетингом устанавливаются
на 32-разрядном компьютере “%ProgramFiles(x86)%\Reference Assemblies\Microsoft\Framework”
или “%ProgramFiles%\Reference Assemblies\Microsoft\Framework”
на нем).
Следующее изображение от Microsoft обеспечивает ясность приведенному выше описанию.
Нужны ли эти пакеты, если я хочу использовать Visual Studio только для создания мобильных приложений WP10?
Если вы собираетесь использовать только Windows Phone 10, то установка пакетов не обязательна для публикации приложения в Магазине Windows. Вы не можете нацеливаться на неподдерживаемые версии .NET Framework и публиковать свое приложение в Магазине Windows, а это значит, что все ваши сборки будут скомпилированы для одной и той же версии .NET Framework.
Источник: Рекомендации по многоцелевому таргетингу для инструментов для управляемого кода [Мирча]