Нужен ли Python SciPy BLAS?

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError: 
    Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting
    the BLAS environment variable.

Какой смол мне нужно скачать с этого сайта?

Я пробовал Фортранс, но я получаю эту ошибку (очевидно, после установки переменной среды).

SciPy веб - страницы используется для обеспечения сборки и инструкции по установке, но инструкции там теперь полагаются на ОС бинарных дистрибутивов. Чтобы собрать SciPy (и NumPy) в операционных системах без предварительно скомпилированных пакетов необходимых библиотек, вы должны собрать, а затем статически связать с библиотеками Fortran BLAS и LAPACK :

mkdir -p ~/src/
cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz
tar xzf blas.tgz
cd BLAS-*

## NOTE: The selected Fortran compiler must be consistent for BLAS, LAPACK, NumPy, and SciPy.
## For GNU compiler on 32-bit systems:
#g77 -O2 -fno-second-underscore -c *.f                     # with g77
#gfortran -O2 -std=legacy -fno-second-underscore -c *.f    # with gfortran
## OR for GNU compiler on 64-bit systems:
#g77 -O3 -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f                     # with g77
gfortran -O3 -std=legacy -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f    # with gfortran
## OR for Intel compiler:
#ifort -FI -w90 -w95 -cm -O3 -unroll -c *.f

# Continue below irrespective of compiler:
ar r libfblas.a *.o
ranlib libfblas.a
rm -rf *.o
export BLAS=~/src/BLAS-*/libfblas.a

Выполните только одну из пяти команд g77 / gfortran / ifort. Я закомментировал все, кроме gfortran, который я использую. Для последующей установки LAPACK требуется компилятор Fortran 90 , и, поскольку обе установки должны использовать один и тот же компилятор Fortran, g77 не следует использовать для BLAS.

Затем вам нужно установить LAPACK. Инструкции на веб-странице SciPy помогли мне и здесь, но мне пришлось изменить их в соответствии с моей средой:

mkdir -p ~/src
cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/lapack/lapack.tgz
tar xzf lapack.tgz
cd lapack-*/
cp INSTALL/make.inc.gfortran make.inc          # On Linux with lapack-3.2.1 or newer
make lapacklib
make clean
export LAPACK=~/src/lapack-*/liblapack.a

Обновление от 3 сентября 2015 года: проверено несколько комментариев сегодня (спасибо всем): Перед запуском make lapacklibотредактируйте make.incфайл и добавьте -fPICопцию OPTSи NOOPTнастройки. Если вы используете 64-битную архитектуру или хотите скомпилировать ее, также добавьте -m64. Важно, чтобы BLAS и LAPACK были скомпилированы с одинаковыми значениями этих параметров. Если вы забудете, -fPICSciPy выдаст ошибку об отсутствующих символах и порекомендует этот переключатель. Конкретный раздел make.incвыглядит так в моей настройке:

FORTRAN  = gfortran 
OPTS     = -O2 -frecursive -fPIC -m64
DRVOPTS  = $(OPTS)
NOOPT    = -O0 -frecursive -fPIC -m64
LOADER   = gfortran

На старых машинах (например, RedHat 5) gfortran может быть установлен в более старой версии (например, 4.1.2) и не понимает опцию -frecursive. Просто удалите его из make.incфайла в таких случаях.

Цель теста Lapack теста Makefile не удалась в моей установке, потому что он не может найти библиотеки blas. Если вы внимательны, вы можете временно переместить библиотеку blas в указанное место, чтобы протестировать ноутбук. Я ленивый человек, поэтому я доверяю разработчикам, чтобы он работал и проверял только в SciPy.

Если вам нужно использовать последние версии SciPy, а не упакованную версию, не прибегая к хлопотам сборки BLAS и LAPACK, вы можете выполнить следующую процедуру.

Установить библиотеки линейной алгебры из репозитория (для Ubuntu),

sudo apt-get install gfortran libopenblas-dev liblapack-dev

Затем установите SciPy (после загрузки исходного кода SciPy): python setup.py installили

pip install scipy

В зависимости от обстоятельств.

На Fedora это работает:

 yum install lapack lapack-devel blas blas-devel
 pip install numpy
 pip install scipy

Не забудьте установить « lapack-devel » и « blas-devel » в дополнение к «blas» и «lapack», в противном случае вы получите указанную ошибку или ошибку «numpy.distutils.system_info. LapackNotFoundError ».

Я полагаю, вы говорите об установке в Ubuntu. Просто используйте:

apt-get install python-numpy python-scipy

Это должно заботиться и о компиляции библиотек BLAS. Иначе, компиляция библиотек BLAS очень сложна.

Для пользователей Windows есть хороший двоичный пакет от Криса (предупреждение: это довольно большая загрузка, 191 МБ):

• http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#scipy-stack

Следование инструкциям, приведенным в 'cfi', работает для меня, хотя есть несколько фрагментов, которые вам могут понадобиться:

1) Ваш каталог lapack после распаковки может называться lapack-XY (номер версии), поэтому вы можете просто переименовать его в LAPACK.

cd ~/src
mv lapack-[tab] LAPACK

2) В этом каталоге вам может понадобиться:

cd ~/src/LAPACK 
cp lapack_LINUX.a libflapack.a

Попробуйте использовать

sudo apt-get install python3-scipy