Транспонировать фрейм данных

107

Мне нужно перенести большой фрейм данных, поэтому я использовал:

df.aree <- t(df.aree)
df.aree <- as.data.frame(df.aree)

Вот что я получаю:

df.aree[c(1:5),c(1:5)]
                         10428        10760        12148        11865
    name                M231T3       M961T5       M960T6      M231T19
    GS04.A        5.847557e+03 0.000000e+00 3.165891e+04 2.119232e+04
    GS16.A        5.248690e+04 4.047780e+03 3.763850e+04 1.187454e+04
    GS20.A        5.370910e+03 9.518396e+03 3.552036e+04 1.497956e+04
    GS40.A        3.640794e+03 1.084391e+04 4.651735e+04 4.120606e+04

Моя проблема - это новые имена столбцов (10428, 10760, 12148, 11865), которые мне нужно удалить, потому что мне нужно использовать первую строку в качестве имен столбцов.

Я пробовал использовать col.names()функцию, но не получил того, что мне нужно.

Есть ли у вас предложения?

РЕДАКТИРОВАТЬ

Спасибо за предложение !!! Используя его, я получаю:

df.aree[c(1:5),c(1:5)]
                        M231T3       M961T5       M960T6      M231T19
    GS04.A        5.847557e+03 0.000000e+00 3.165891e+04 2.119232e+04
    GS16.A        5.248690e+04 4.047780e+03 3.763850e+04 1.187454e+04
    GS20.A        5.370910e+03 9.518396e+03 3.552036e+04 1.497956e+04
    GS40.A        3.640794e+03 1.084391e+04 4.651735e+04 4.120606e+04
    GS44.A        1.225938e+04 2.681887e+03 1.154924e+04 4.202394e+04

Теперь мне нужно преобразовать имена строк (GS ..) в факторный столбец ....

r dataframe Риккардо
источник
1
Вы пробовали colnames(df.aree)<-df.aree[1,];df.aree<-df.aree[2:nrow(df.aree),]?
5
Фреймы данных, естественно, не предназначены для переноса. Если ваш, то, возможно, он должен быть в матричной форме.
Richie Cotton
Согласен; tФрейм данных также довольно неэффективен. Если можете, используйте матрицу.
mbq
5
Транспонирование data.frame, содержащего строковый столбец, превращает ВСЕ значения в строки! Не хорошо. См. Мой ответ ниже.
Tommy

Ответы:

109

Лучше не переносить data.frame, пока в нем находится столбец name - все числовые значения будут преобразованы в строки!

Вот решение, которое сохраняет числа как числа:

# first remember the names
n <- df.aree$name

# transpose all but the first column (name)
df.aree <- as.data.frame(t(df.aree[,-1]))
colnames(df.aree) <- n
df.aree$myfactor <- factor(row.names(df.aree))

str(df.aree) # Check the column types
Томми
источник
49 
df.aree <- as.data.frame(t(df.aree))
colnames(df.aree) <- df.aree[1, ]
df.aree <- df.aree[-1, ]
df.aree$myfactor <- factor(row.names(df.aree))
Фрэнк
источник
@Riccardo Если да, примите его ответ, щелкнув серую галочку рядом с ним.
mbq
4
одна проблема с этим - имена столбцов принимают числовое представление уровня фактора.
Гарри Палмер
48

Вы можете использовать transposeфункцию из data.tableбиблиотеки. Простое и быстрое решение, сохраняющее numericзначения как numeric.

library(data.table)

# get data
  data("mtcars")

# transpose
  t_mtcars <- transpose(mtcars)

# get row and colnames in order
  colnames(t_mtcars) <- rownames(mtcars)
  rownames(t_mtcars) <- colnames(mtcars)
rafa.pereira
источник
4
кроме того, это setnames(t_mtcars, rownames(mtcars))был бы data.tableспособ установки имен в таблице data.table (и если бы вы использовали data.tableобъект, который вы бы не задавали rownames)
SymbolixAU
Это, безусловно, лучшее решение! +1.
HelloWorld
1

Воспользуйтесь as.matrix:

# keep the first column 
names <-  df.aree[,1]

# Transpose everything other than the first column
df.aree.T <- as.data.frame(as.matrix(t(df.aree[,-1])))

# Assign first column as the column names of the transposed dataframe
colnames(df.aree.T) <- names
Газель
источник