pandasUDF и пиарроу 0.15.0

12

Недавно я начал получать кучу ошибок на ряде pysparkзаданий, работающих на кластерах EMR. Ошибки

java.lang.IllegalArgumentException
    at java.nio.ByteBuffer.allocate(ByteBuffer.java:334)
    at org.apache.arrow.vector.ipc.message.MessageSerializer.readMessage(MessageSerializer.java:543)
    at org.apache.arrow.vector.ipc.message.MessageChannelReader.readNext(MessageChannelReader.java:58)
    at org.apache.arrow.vector.ipc.ArrowStreamReader.readSchema(ArrowStreamReader.java:132)
    at org.apache.arrow.vector.ipc.ArrowReader.initialize(ArrowReader.java:181)
    at org.apache.arrow.vector.ipc.ArrowReader.ensureInitialized(ArrowReader.java:172)
    at org.apache.arrow.vector.ipc.ArrowReader.getVectorSchemaRoot(ArrowReader.java:65)
    at org.apache.spark.sql.execution.python.ArrowPythonRunner$$anon$1.read(ArrowPythonRunner.scala:162)
    at org.apache.spark.sql.execution.python.ArrowPythonRunner$$anon$1.read(ArrowPythonRunner.scala:122)
    at org.apache.spark.api.python.BasePythonRunner$ReaderIterator.hasNext(PythonRunner.scala:406)
    at org.apache.spark.InterruptibleIterator.hasNext(InterruptibleIterator.scala:37)
    at org.apache.spark.sql.execution.python.ArrowEvalPythonExec$$anon$2.<init>(ArrowEvalPythonExec.scala:98)
    at org.apache.spark.sql.execution.python.ArrowEvalPythonExec.evaluate(ArrowEvalPythonExec.scala:96)
    at org.apache.spark.sql.execution.python.EvalPythonExec$$anonfun$doExecute$1.apply(EvalPythonExec.scala:127)...

Все они, кажется, происходят в applyфункциях серии панд. Единственное изменение, которое я обнаружил, - это pyarrowобновление в субботу (10.05.2009). Тесты, похоже, работают с 0.14.1

Поэтому мой вопрос: кто-нибудь знает, является ли это ошибкой в ​​новом обновленном pyarrow или есть какие-то существенные изменения, которые затруднят использование pandasUDF в будущем?

ilijaluve
источник

Ответы:

15

Это не ошибка. Мы внесли важное изменение в протокол 0.15.0, которое делает поведение pyarrow по умолчанию несовместимым со старыми версиями Arrow в Java - кажется, что ваша среда Spark использует более старую версию.

Ваши варианты

  • Установите переменную окружения, ARROW_PRE_0_15_IPC_FORMAT=1из которой вы используете Python
  • Понижение до pyarrow <0.15.0 на данный момент.

Надеемся, что сообщество Spark вскоре сможет обновить Java до 0.15.0, поэтому эта проблема исчезнет.

Это обсуждается в http://arrow.apache.org/blog/2019/10/06/0.15.0-release/

Уэс МакКинни
источник