Я использую boto3 для получения файлов из ведра s3. Мне нужна аналогичная функциональность, напримерaws s3 sync
Мой текущий код
#!/usr/bin/python
import boto3
s3=boto3.client('s3')
list=s3.list_objects(Bucket='my_bucket_name')['Contents']
for key in list:
s3.download_file('my_bucket_name', key['Key'], key['Key'])
Это нормально работает, пока в корзине есть только файлы. Если внутри ведра присутствует папка, выдает ошибку
Traceback (most recent call last):
File "./test", line 6, in <module>
s3.download_file('my_bucket_name', key['Key'], key['Key'])
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/boto3/s3/inject.py", line 58, in download_file
extra_args=ExtraArgs, callback=Callback)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/boto3/s3/transfer.py", line 651, in download_file
extra_args, callback)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/boto3/s3/transfer.py", line 666, in _download_file
self._get_object(bucket, key, filename, extra_args, callback)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/boto3/s3/transfer.py", line 690, in _get_object
extra_args, callback)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/boto3/s3/transfer.py", line 707, in _do_get_object
with self._osutil.open(filename, 'wb') as f:
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/boto3/s3/transfer.py", line 323, in open
return open(filename, mode)
IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'my_folder/.8Df54234'
Это правильный способ загрузить полную корзину s3 с помощью boto3. Как скачивать папки.
Ответы:
При работе с бакетами, которые содержат более 1000 объектов, необходимо реализовать решение, которое использует
NextContinuationToken
последовательные наборы из максимум 1000 ключей. Это решение сначала составляет список объектов, затем итеративно создает указанные каталоги и загружает существующие объекты.import boto3 import os s3_client = boto3.client('s3') def download_dir(prefix, local, bucket, client=s3_client): """ params: - prefix: pattern to match in s3 - local: local path to folder in which to place files - bucket: s3 bucket with target contents - client: initialized s3 client object """ keys = [] dirs = [] next_token = '' base_kwargs = { 'Bucket':bucket, 'Prefix':prefix, } while next_token is not None: kwargs = base_kwargs.copy() if next_token != '': kwargs.update({'ContinuationToken': next_token}) results = client.list_objects_v2(**kwargs) contents = results.get('Contents') for i in contents: k = i.get('Key') if k[-1] != '/': keys.append(k) else: dirs.append(k) next_token = results.get('NextContinuationToken') for d in dirs: dest_pathname = os.path.join(local, d) if not os.path.exists(os.path.dirname(dest_pathname)): os.makedirs(os.path.dirname(dest_pathname)) for k in keys: dest_pathname = os.path.join(local, k) if not os.path.exists(os.path.dirname(dest_pathname)): os.makedirs(os.path.dirname(dest_pathname)) client.download_file(bucket, k, dest_pathname)
источник
while next_token is not None:
У меня те же потребности, и я создал следующую функцию, которая рекурсивно загружает файлы.
Каталоги создаются локально, только если они содержат файлы.
import boto3 import os def download_dir(client, resource, dist, local='/tmp', bucket='your_bucket'): paginator = client.get_paginator('list_objects') for result in paginator.paginate(Bucket=bucket, Delimiter='/', Prefix=dist): if result.get('CommonPrefixes') is not None: for subdir in result.get('CommonPrefixes'): download_dir(client, resource, subdir.get('Prefix'), local, bucket) for file in result.get('Contents', []): dest_pathname = os.path.join(local, file.get('Key')) if not os.path.exists(os.path.dirname(dest_pathname)): os.makedirs(os.path.dirname(dest_pathname)) resource.meta.client.download_file(bucket, file.get('Key'), dest_pathname)
Функция вызывается так:
def _start(): client = boto3.client('s3') resource = boto3.resource('s3') download_dir(client, resource, 'clientconf/', '/tmp', bucket='my-bucket')
источник
resource.meta.client
.OSError: [Errno 21] Is a directory
поэтому я обернул вызов download_file,if not file.get('Key').endswith('/')
чтобы разрешить. Спасибо @glefait и @Shanaws s3 sync
в библиотеке boto3 эквивалента команды aws- cli?dist
здесь?Amazon S3 не имеет папок / каталогов. Это плоская файловая структура .
Для сохранения внешнего вида каталогов имена путей сохраняются как часть объекта Key (имя файла). Например:
images/foo.jpg
В этом случае весь Ключ
images/foo.jpg
, а не простоfoo.jpg
.Я подозреваю, что ваша проблема в том, что
boto
возвращает файл с именемmy_folder/.8Df54234
и пытается сохранить его в локальной файловой системе. Однако ваша локальная файловая система интерпретируетmy_folder/
часть как имя каталога, а этот каталог не существует в вашей локальной файловой системе .Вы можете либо обрезать имя файла, чтобы сохранить только
.8Df54234
часть, либо вам придется создать необходимые каталоги перед записью файлов. Обратите внимание, что это могут быть многоуровневые вложенные каталоги.Более простым способом было бы использовать интерфейс командной строки AWS (CLI) , который сделает всю эту работу за вас, например:
Также есть
sync
опция, которая копирует только новые и измененные файлы.источник
aws s3 sync
. Возможно ли в boto3.foo/bar.txt
), вы должны будете создать каталог (foo
) перед вызовомs3.download_file
. Это не автоматическая возможностьboto
.s3.list_objects(Bucket='my_bucket_name')['Contents']
и фильтровать ключи папки и создавать их.import os import boto3 #initiate s3 resource s3 = boto3.resource('s3') # select bucket my_bucket = s3.Bucket('my_bucket_name') # download file into current directory for s3_object in my_bucket.objects.all(): # Need to split s3_object.key into path and file name, else it will give error file not found. path, filename = os.path.split(s3_object.key) my_bucket.download_file(s3_object.key, filename)
источник
os.makedirs(path)
и тогда должно быть место загрузкиobject.key
.В настоящее время я выполняю задачу, используя следующие
#!/usr/bin/python import boto3 s3=boto3.client('s3') list=s3.list_objects(Bucket='bucket')['Contents'] for s3_key in list: s3_object = s3_key['Key'] if not s3_object.endswith("/"): s3.download_file('bucket', s3_object, s3_object) else: import os if not os.path.exists(s3_object): os.makedirs(s3_object)
Хотя он выполняет свою работу, я не уверен, что это хорошо. Я оставляю это здесь, чтобы помочь другим пользователям и получить дополнительные ответы, чтобы лучше достичь этого
источник
Лучше поздно, чем никогда :) Предыдущий ответ с пагинатором действительно хорош. Однако это рекурсивно, и вы можете выйти за пределы рекурсии Python. Вот альтернативный подход с парочкой дополнительных проверок.
import os import errno import boto3 def assert_dir_exists(path): """ Checks if directory tree in path exists. If not it created them. :param path: the path to check if it exists """ try: os.makedirs(path) except OSError as e: if e.errno != errno.EEXIST: raise def download_dir(client, bucket, path, target): """ Downloads recursively the given S3 path to the target directory. :param client: S3 client to use. :param bucket: the name of the bucket to download from :param path: The S3 directory to download. :param target: the local directory to download the files to. """ # Handle missing / at end of prefix if not path.endswith('/'): path += '/' paginator = client.get_paginator('list_objects_v2') for result in paginator.paginate(Bucket=bucket, Prefix=path): # Download each file individually for key in result['Contents']: # Calculate relative path rel_path = key['Key'][len(path):] # Skip paths ending in / if not key['Key'].endswith('/'): local_file_path = os.path.join(target, rel_path) # Make sure directories exist local_file_dir = os.path.dirname(local_file_path) assert_dir_exists(local_file_dir) client.download_file(bucket, key['Key'], local_file_path) client = boto3.client('s3') download_dir(client, 'bucket-name', 'path/to/data', 'downloads')
источник
KeyError: 'Contents'
. входной путь'/arch/R/storeincomelogs/
, полный путь/arch/R/storeincomelogs/201901/01/xxx.parquet
.У меня есть обходной путь, который запускает AWS CLI в том же процессе.
Установить
awscli
как python lib:Затем определите эту функцию:
from awscli.clidriver import create_clidriver def aws_cli(*cmd): old_env = dict(os.environ) try: # Environment env = os.environ.copy() env['LC_CTYPE'] = u'en_US.UTF' os.environ.update(env) # Run awscli in the same process exit_code = create_clidriver().main(*cmd) # Deal with problems if exit_code > 0: raise RuntimeError('AWS CLI exited with code {}'.format(exit_code)) finally: os.environ.clear() os.environ.update(old_env)
Выполнить:
aws_cli('s3', 'sync', '/path/to/source', 's3://bucket/destination', '--delete')
источник
sync
команды, а просто выполнял командуaws s3 cp s3://{bucket}/{folder} {local_folder} --recursive
. Время сокращено с минут (почти 1 час) до буквально секундlogging.basicConfig(format='%(levelname)s: %(message)s', level=logging.WARNING) logger = logging.getLogger()
и хочу, чтобы журналы выводились только из root. Есть идеи?Получать все файлы за один раз - очень плохая идея. Лучше получать их партиями.
Одна реализация, которую я использую для получения определенной папки (каталога) из S3, это:
def get_directory(directory_path, download_path, exclude_file_names): # prepare session session = Session(aws_access_key_id, aws_secret_access_key, region_name) # get instances for resource and bucket resource = session.resource('s3') bucket = resource.Bucket(bucket_name) for s3_key in self.client.list_objects(Bucket=self.bucket_name, Prefix=directory_path)['Contents']: s3_object = s3_key['Key'] if s3_object not in exclude_file_names: bucket.download_file(file_path, download_path + str(s3_object.split('/')[-1])
и все же, если вы хотите получить все ведро, используйте его через CIL, как @John Rotenstein, как указано ниже,
источник
for objs in my_bucket.objects.all(): print(objs.key) path='/tmp/'+os.sep.join(objs.key.split(os.sep)[:-1]) try: if not os.path.exists(path): os.makedirs(path) my_bucket.download_file(objs.key, '/tmp/'+objs.key) except FileExistsError as fe: print(objs.key+' exists')
Этот код загрузит содержимое в
/tmp/
каталог. Если хотите, можете сменить каталог.источник
Если вы хотите вызвать сценарий bash с помощью python, вот простой способ загрузить файл из папки в корзине S3 в локальную папку (на машине Linux):
import boto3 import subprocess import os ###TOEDIT### my_bucket_name = "your_my_bucket_name" bucket_folder_name = "your_bucket_folder_name" local_folder_path = "your_local_folder_path" ###TOEDIT### # 1.Load thes list of files existing in the bucket folder FILES_NAMES = [] s3 = boto3.resource('s3') my_bucket = s3.Bucket('{}'.format(my_bucket_name)) for object_summary in my_bucket.objects.filter(Prefix="{}/".format(bucket_folder_name)): # print(object_summary.key) FILES_NAMES.append(object_summary.key) # 2.List only new files that do not exist in local folder (to not copy everything!) new_filenames = list(set(FILES_NAMES )-set(os.listdir(local_folder_path))) # 3.Time to load files in your destination folder for new_filename in new_filenames: upload_S3files_CMD = """aws s3 cp s3://{}/{}/{} {}""".format(my_bucket_name,bucket_folder_name,new_filename ,local_folder_path) subprocess_call = subprocess.call([upload_S3files_CMD], shell=True) if subprocess_call != 0: print("ALERT: loading files not working correctly, please re-check new loaded files")
источник
Я получил аналогичное требование и получил помощь, прочитав несколько из вышеперечисленных решений и на других веб-сайтах, я придумал сценарий ниже, просто хотел поделиться, может ли это кому-то помочь.
from boto3.session import Session import os def sync_s3_folder(access_key_id,secret_access_key,bucket_name,folder,destination_path): session = Session(aws_access_key_id=access_key_id,aws_secret_access_key=secret_access_key) s3 = session.resource('s3') your_bucket = s3.Bucket(bucket_name) for s3_file in your_bucket.objects.all(): if folder in s3_file.key: file=os.path.join(destination_path,s3_file.key.replace('/','\\')) if not os.path.exists(os.path.dirname(file)): os.makedirs(os.path.dirname(file)) your_bucket.download_file(s3_file.key,file) sync_s3_folder(access_key_id,secret_access_key,bucket_name,folder,destination_path)
источник
Повторная публикация ответа @glefait с условием if в конце, чтобы избежать ошибки ОС 20. Первый ключ, который он получает, - это само имя папки, которое не может быть записано в путь назначения.
def download_dir(client, resource, dist, local='/tmp', bucket='your_bucket'): paginator = client.get_paginator('list_objects') for result in paginator.paginate(Bucket=bucket, Delimiter='/', Prefix=dist): if result.get('CommonPrefixes') is not None: for subdir in result.get('CommonPrefixes'): download_dir(client, resource, subdir.get('Prefix'), local, bucket) for file in result.get('Contents', []): print("Content: ",result) dest_pathname = os.path.join(local, file.get('Key')) print("Dest path: ",dest_pathname) if not os.path.exists(os.path.dirname(dest_pathname)): print("here last if") os.makedirs(os.path.dirname(dest_pathname)) print("else file key: ", file.get('Key')) if not file.get('Key') == dist: print("Key not equal? ",file.get('Key')) resource.meta.client.download_file(bucket, file.get('Key'), dest_pathname)enter code here
источник
Я столкнулся с этой проблемой какое-то время, и на всех форумах, которые я посещал, я не видел полного сквозного фрагмента того, что работает. Итак, я взял все части (добавил кое-что самостоятельно) и создал полный сквозной загрузчик S3!
Это не только автоматически загрузит файлы, но и, если файлы S3 находятся в подкаталогах, они будут созданы в локальном хранилище. В моем экземпляре приложения мне нужно установить разрешения и владельцев, поэтому я тоже добавил это (можно закомментировать, если не нужно).
Это было протестировано и работает в среде Docker (K8), но я добавил переменные среды в сценарий на всякий случай, если вы хотите протестировать / запустить его локально.
Я надеюсь, что это поможет кому-нибудь в поисках автоматизации загрузки S3. Я также приветствую любые советы, информацию и т. Д. О том, как это можно лучше оптимизировать, если это необходимо.
#!/usr/bin/python3 import gc import logging import os import signal import sys import time from datetime import datetime import boto from boto.exception import S3ResponseError from pythonjsonlogger import jsonlogger formatter = jsonlogger.JsonFormatter('%(message)%(levelname)%(name)%(asctime)%(filename)%(lineno)%(funcName)') json_handler_out = logging.StreamHandler() json_handler_out.setFormatter(formatter) #Manual Testing Variables If Needed #os.environ["DOWNLOAD_LOCATION_PATH"] = "some_path" #os.environ["BUCKET_NAME"] = "some_bucket" #os.environ["AWS_ACCESS_KEY"] = "some_access_key" #os.environ["AWS_SECRET_KEY"] = "some_secret" #os.environ["LOG_LEVEL_SELECTOR"] = "DEBUG, INFO, or ERROR" #Setting Log Level Test logger = logging.getLogger('json') logger.addHandler(json_handler_out) logger_levels = { 'ERROR' : logging.ERROR, 'INFO' : logging.INFO, 'DEBUG' : logging.DEBUG } logger_level_selector = os.environ["LOG_LEVEL_SELECTOR"] logger.setLevel(logger_level_selector) #Getting Date/Time now = datetime.now() logger.info("Current date and time : ") logger.info(now.strftime("%Y-%m-%d %H:%M:%S")) #Establishing S3 Variables and Download Location download_location_path = os.environ["DOWNLOAD_LOCATION_PATH"] bucket_name = os.environ["BUCKET_NAME"] aws_access_key_id = os.environ["AWS_ACCESS_KEY"] aws_access_secret_key = os.environ["AWS_SECRET_KEY"] logger.debug("Bucket: %s" % bucket_name) logger.debug("Key: %s" % aws_access_key_id) logger.debug("Secret: %s" % aws_access_secret_key) logger.debug("Download location path: %s" % download_location_path) #Creating Download Directory if not os.path.exists(download_location_path): logger.info("Making download directory") os.makedirs(download_location_path) #Signal Hooks are fun class GracefulKiller: kill_now = False def __init__(self): signal.signal(signal.SIGINT, self.exit_gracefully) signal.signal(signal.SIGTERM, self.exit_gracefully) def exit_gracefully(self, signum, frame): self.kill_now = True #Downloading from S3 Bucket def download_s3_bucket(): conn = boto.connect_s3(aws_access_key_id, aws_access_secret_key) logger.debug("Connection established: ") bucket = conn.get_bucket(bucket_name) logger.debug("Bucket: %s" % str(bucket)) bucket_list = bucket.list() # logger.info("Number of items to download: {0}".format(len(bucket_list))) for s3_item in bucket_list: key_string = str(s3_item.key) logger.debug("S3 Bucket Item to download: %s" % key_string) s3_path = download_location_path + "/" + key_string logger.debug("Downloading to: %s" % s3_path) local_dir = os.path.dirname(s3_path) if not os.path.exists(local_dir): logger.info("Local directory doesn't exist, creating it... %s" % local_dir) os.makedirs(local_dir) logger.info("Updating local directory permissions to %s" % local_dir) #Comment or Uncomment Permissions based on Local Usage os.chmod(local_dir, 0o775) os.chown(local_dir, 60001, 60001) logger.debug("Local directory for download: %s" % local_dir) try: logger.info("Downloading File: %s" % key_string) s3_item.get_contents_to_filename(s3_path) logger.info("Successfully downloaded File: %s" % s3_path) #Updating Permissions logger.info("Updating Permissions for %s" % str(s3_path)) #Comment or Uncomment Permissions based on Local Usage os.chmod(s3_path, 0o664) os.chown(s3_path, 60001, 60001) except (OSError, S3ResponseError) as e: logger.error("Fatal error in s3_item.get_contents_to_filename", exc_info=True) # logger.error("Exception in file download from S3: {}".format(e)) continue logger.info("Deleting %s from S3 Bucket" % str(s3_item.key)) s3_item.delete() def main(): killer = GracefulKiller() while not killer.kill_now: logger.info("Checking for new files on S3 to download...") download_s3_bucket() logger.info("Done checking for new files, will check in 120s...") gc.collect() sys.stdout.flush() time.sleep(120) if __name__ == '__main__': main()
источник
Из Документов AWS S3 (Как использовать папки в корзине S3?):
Чтобы загрузить все файлы из «mybucket» в текущий каталог, соблюдая эмулируемую структуру каталогов корзины (создание папок из корзины, если они еще не существуют локально):
import boto3 import os bucket_name = "mybucket" s3 = boto3.client("s3") objects = s3.list_objects(Bucket = bucket_name)["Contents"] for s3_object in objects: s3_key = s3_object["Key"] path, filename = os.path.split(s3_key) if len(path) != 0 and not os.path.exists(path): os.makedirs(path) if not s3_key.endswith("/"): download_to = path + '/' + filename if path else filename s3.download_file(bucket_name, s3_key, download_to)
источник