Как мне создать новый столбец из вывода pandas groupby (). Sum ()?

84

Попытка создать новый столбец из groupbyрасчета. В приведенном ниже коде я получаю правильные рассчитанные значения для каждой даты (см. Группу ниже), но когда я пытаюсь создать с ним новый столбец ( df['Data4']), я получаю NaN. Итак, я пытаюсь создать новый столбец в фрейме данных с суммой Data3для всех дат и применить это к каждой строке даты. Например, 2015-05-08 находится в 2 строках (всего 50 + 5 = 55), и в этом новом столбце я хотел бы иметь 55 в обеих строках.

import pandas as pd
import numpy as np
from pandas import DataFrame

df = pd.DataFrame({
    'Date' : ['2015-05-08', '2015-05-07', '2015-05-06', '2015-05-05', '2015-05-08', '2015-05-07', '2015-05-06', '2015-05-05'], 
    'Sym'  : ['aapl', 'aapl', 'aapl', 'aapl', 'aaww', 'aaww', 'aaww', 'aaww'], 
    'Data2': [11, 8, 10, 15, 110, 60, 100, 40],
    'Data3': [5, 8, 6, 1, 50, 100, 60, 120]
})

group = df['Data3'].groupby(df['Date']).sum()

df['Data4'] = group
Fener
источник

Ответы:

192

Вы хотите использовать transformэто, вернет Series с индексом, выровненным по df, чтобы вы могли затем добавить его как новый столбец:

In [74]:

df = pd.DataFrame({'Date': ['2015-05-08', '2015-05-07', '2015-05-06', '2015-05-05', '2015-05-08', '2015-05-07', '2015-05-06', '2015-05-05'], 'Sym': ['aapl', 'aapl', 'aapl', 'aapl', 'aaww', 'aaww', 'aaww', 'aaww'], 'Data2': [11, 8, 10, 15, 110, 60, 100, 40],'Data3': [5, 8, 6, 1, 50, 100, 60, 120]})
​
df['Data4'] = df['Data3'].groupby(df['Date']).transform('sum')
df
Out[74]:
   Data2  Data3        Date   Sym  Data4
0     11      5  2015-05-08  aapl     55
1      8      8  2015-05-07  aapl    108
2     10      6  2015-05-06  aapl     66
3     15      1  2015-05-05  aapl    121
4    110     50  2015-05-08  aaww     55
5     60    100  2015-05-07  aaww    108
6    100     60  2015-05-06  aaww     66
7     40    120  2015-05-05  aaww    121
EdChum
источник
Что произойдет, если у нас будет вторая группа, как здесь: stackoverflow.com/a/40067099/281545
Mr_and_Mrs_D
@Mr_and_Mrs_D, вам нужно будет сбросить индекс и выполнить левое слияние общих столбцов в этом случае, чтобы добавить столбец обратно
EdChum
10
В качестве альтернативы можно использовать df.groupby('Date')['Data3'].transform('sum')(что мне легче запомнить).
Cleb
42

Как мне создать новый столбец с помощью Groupby (). Sum ()?

Есть два способа: один более простой, а другой немного более интересный.


Всеми любимый: GroupBy.transform()с'sum'

Ответ @Ed Chum можно немного упростить. Звоните, DataFrame.groupbyа не Series.groupby. Это приводит к упрощению синтаксиса.

# The setup.
df[['Date', 'Data3']]

         Date  Data3
0  2015-05-08      5
1  2015-05-07      8
2  2015-05-06      6
3  2015-05-05      1
4  2015-05-08     50
5  2015-05-07    100
6  2015-05-06     60
7  2015-05-05    120

df.groupby('Date')['Data3'].transform('sum')

0     55
1    108
2     66
3    121
4     55
5    108
6     66
7    121
Name: Data3, dtype: int64 

Это немного быстрее,

df2 = pd.concat([df] * 12345)

%timeit df2['Data3'].groupby(df['Date']).transform('sum')
%timeit df2.groupby('Date')['Data3'].transform('sum')

10.4 ms ± 367 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
8.58 ms ± 559 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

Нетрадиционный, но заслуживающий внимания: GroupBy.sum()+Series.map()

Я наткнулся на интересную особенность API. Судя по тому, что я говорю, вы можете воспроизвести это на любой основной версии выше 0.20 (я тестировал это на 0.23 и 0.24). Похоже, что вы всегда можете сократить время на несколько миллисекунд, transformесли вместо этого используете прямую функцию GroupByи транслируете ее, используя map:

df.Date.map(df.groupby('Date')['Data3'].sum())

0     55
1    108
2     66
3    121
4     55
5    108
6     66
7    121
Name: Date, dtype: int64

Сравнить с

df.groupby('Date')['Data3'].transform('sum')

0     55
1    108
2     66
3    121
4     55
5    108
6     66
7    121
Name: Data3, dtype: int64

Мои тесты показывают , что mapнемного быстрее , если вы можете позволить себе использовать прямую GroupByфункцию (например mean, min, max, firstи т.д.). Это более или менее быстрее для большинства общих ситуаций до ~ 200 тысяч записей. После этого производительность действительно зависит от данных.

(Слева: v0.23, справа: v0.24)

Хорошая альтернатива, которую следует знать, и лучше, если у вас есть меньшие рамки с меньшим количеством групп. . . но я бы рекомендовал transformкак первый выбор. Думал, что этим все равно стоит поделиться.

Код тестирования, для справки:

import perfplot

perfplot.show(
    setup=lambda n: pd.DataFrame({'A': np.random.choice(n//10, n), 'B': np.ones(n)}),
    kernels=[
        lambda df: df.groupby('A')['B'].transform('sum'),
        lambda df:  df.A.map(df.groupby('A')['B'].sum()),
    ],
    labels=['GroupBy.transform', 'GroupBy.sum + map'],
    n_range=[2**k for k in range(5, 20)],
    xlabel='N',
    logy=True,
    logx=True
)
cs95
источник
1
Это полезно знать! Не могли бы вы включить (по крайней мере, в будущие перфплоты) номера версий? Разница в производительности интересна, но это, в конце концов, детали реализации, которые могут быть исправлены в будущем. Особенно, если разработчики обратят внимание на ваши сообщения.
jpp
@jpp да это честно! Добавили версии. Это было протестировано на 0.23, но я считаю, что разница заметна, если у вас есть версия выше 0.20.
cs95