Панели изменения порядка в geom_bar ggplot2

119

Я пытаюсь сделать столбик, на котором график упорядочен от miRNAсамого высокого valueдо miRNAсамого низкого. Почему мой код не работает?

> head(corr.m)

        miRNA         variable value
1    mmu-miR-532-3p      pos     7
2    mmu-miR-1983        pos    75
3    mmu-miR-301a-3p     pos    70
4    mmu-miR-96-5p       pos     5
5    mmu-miR-139-5p      pos    10
6    mmu-miR-5097        pos    47

ggplot(corr.m, aes(x=reorder(miRNA, value), y=value, fill=variable)) + 
  geom_bar(stat="identity")
user3741035
источник

Ответы:

216

Ваш код работает нормально, за исключением того, что штриховая диаграмма упорядочена от низкого к высокому. Если вы хотите упорядочить столбцы от максимума к минимуму, вам нужно будет добавить -знак перед value:

ggplot(corr.m, aes(x = reorder(miRNA, -value), y = value, fill = variable)) + 
  geom_bar(stat = "identity")

который дает:

введите описание изображения здесь


Используемые данные:

corr.m <- structure(list(miRNA = structure(c(5L, 2L, 3L, 6L, 1L, 4L), .Label = c("mmu-miR-139-5p", "mmu-miR-1983", "mmu-miR-301a-3p", "mmu-miR-5097", "mmu-miR-532-3p", "mmu-miR-96-5p"), class = "factor"),
                         variable = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "pos", class = "factor"),
                         value = c(7L, 75L, 70L, 5L, 10L, 47L)),
                    class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"))
Яап
источник
по какой-то причине он не заказывается в моем сюжете
user3741035 04
@ user3741035 Странно. Вы использовали его в приведенном выше образце набора данных или для всего набора данных?
Jaap
Какую версию R & ggplot вы используете? Можете ли вы также гордиться большим набором данных (желательно с более чем одним значением variable)?
Jaap
6
нашел решение: я загрузил библиотеку (gplots), которая все испортила
user3741035
1
@maycca Это дает мне правильный результат (как на OSX 10.10.4 / Windows 7, R 3.2.3, так и на ggplot2 2.1.0). Может, стоит начать с новой сессии?
Jaap