ipynb импортирует другой файл ipynb

90

Интерактивный Python (ipython) просто потрясающий, особенно если вы собираете все по кусочкам на лету ... и делаете это таким образом, чтобы было легко вернуться назад.

Однако, что кажется интересным, так это случай использования нескольких записных книжек ipython (файлов ipynb). Похоже, что ноутбук НЕ должен иметь связи с другими ноутбуками, что имеет смысл, за исключением того, что я хотел бы импортировать другие файлы ipynb.

Единственный обходной путь, который я вижу, - это преобразование моих файлов * .ipynb в файлы * .py, которые затем можно импортировать в мою записную книжку. Наличие одного файла, содержащего все в проекте, немного странно, особенно если я действительно хочу настаивать на повторном использовании кода (разве это не основной принцип Python?).

Я что-то упускаю? Разве это не поддерживаемый вариант использования ноутбуков ipython? Есть ли другое решение, которое я могу использовать для импорта файла ipynb в другой ноутбук? Я бы с удовольствием продолжил использовать ipynb, но сейчас это действительно мешает моему рабочему процессу :(

Эндрю Харрис
источник
Возможный дубликат: stackoverflow.com/questions/19082397/…
Уоррен Векессер
2
Вы можете запустить сервер записной книжки, --scriptчтобы сохранить копии ваших записных книжек в формате .py. В IPython 2.0 вы сможете %runиспользовать ноутбук. Мы все еще работаем над улучшенными механизмами повторного использования кода.
Thomas K
1
В этом примере показано, как импортировать записные книжки IPython в виде модулей без экспорта дубликатов в виде сценариев.
minrk

Ответы:

130

В новом Jupyter это действительно просто:

%run MyOtherNotebook.ipynb
Johndodo
источник
5
% run MyOtherNotebook.ipynb сделал всю работу за меня. (нет '')
Florian H
6
Будьте осторожны, этот метод полностью запустит дочерний блокнот. Вы можете добавить чек, __name__ == '__main__' and '__file__' not in globals()чтобы проверить, находитесь ли вы в дочерней записной книжке. (от blog.sicara.com/… )
Flavian Hautbois
8
% run 'MyOtherNotebook.ipynb' ОШИБКА: root: файл u'MyOtherNotebook.ipynb.py'не найден.
user3673 06
1
@ Kocur4d Спасибо за исправление! Интересно, что у меня это сработало (с кавычками), когда я попробовал, но примеры в документации не содержат кавычек.
johndodo
3
если кто-нибудь столкнется с этим, вы также можете использовать полный путь, например% run "/path/to/my/file/notebook.ipynb"
Джереми
33

Если вы хотите импортировать A.ipynbв B.ipynbзаписи

import import_ipynb
import A

в B.ipynb.

Созданный import_ipynbмной модуль устанавливается через pip:

pip install import_ipynb

Это всего лишь один файл, и он строго соответствует официальному руководству на сайте jupyter.

PS Он также поддерживает такие вещи, как from A import foo и from A import *т. Д.

пазуха
источник
@Crash pip install import-ipynbтакже работает и устанавливает один и тот же пакет, но, поскольку python не позволяет вам писать import import-ipynbи, учитывая, что это всего лишь один файл, pip install import_ipynbмне кажется, более последовательным.
axil
3
Есть ли разница между import nbimporterи import import_ipynb?
Fractale
1
Это вообще не работает в моем Jupyter с Python 3
Sebastialonso
@Sebastialonso Что именно не работает? Опишите, что вы делаете и какие сообщения об ошибках видите. В идеале открыть тикет на гитхабе.
пазуха
@axil У меня такая же ошибка, когда она не работает у меня в Py3. Это дает мне следующую ошибку - ModuleNotFoundError: ни один модуль с именем 'A' PS: A.ipynb существует в той же папке
Soman Dubey
10

Бегать

!pip install ipynb

а затем импортируйте другую записную книжку как

from ipynb.fs.full.<notebook_name> import *

или

from ipynb.fs.full.<notebook_name> import <function_name>

Убедитесь, что все записные книжки находятся в одном каталоге.

Изменить 1: здесь вы можете увидеть официальную документацию - https://ipynb.readthedocs.io/en/stable/

Кроме того, если вы хотите импортировать из записной книжки только определения классов и функций (а не операторы верхнего уровня), вы можете использовать ipynb.fs.defsвместо ipynb.fs.full. Также оценивается полное присвоение переменной верхнего регистра.

Мальго
источник
Что делать, если в моем имени файла есть пробелы?
Самех
Рекомендуется не оставлять пробелов в имени файла
Malgo
2
Обратите внимание, что в обоих описанных случаях импортированная записная книжка выполняется полностью. ipynbПакет также поддерживает частичное выполнение только определений. Это официальный пакет IPyhton, поэтому я считаю, что это должен быть принятый ответ.
amka66
Можно ли импортировать записные книжки в папку? напримерMyFolder/book.ipynb
bone225
Это выглядело хорошо, но падает, когда встречается, например,% matplotlib inline ....
jtlz2
7

Установите ipynb из командной строки

pip install import-ipynb

Импортируйте в файл записной книжки

import import_ipynb

Теперь используйте обычную команду импорта, чтобы импортировать файл

import MyOtherNotebook
внеземной мир
источник
Самый простой, но объясняющий ответ. Благодарность!
Бедный еврей,
3

Вы можете использовать import nbimporterтогдаimport notebookName

Фрактал
источник
+1, nbimporter для меня работает как шарм, также его можно установить с помощью conda:conda install -c conda-forge importnb
Zuku
2

Вышеупомянутые комментарии очень полезны, но их немного сложно реализовать. Ниже приведены шаги, которые вы можете попробовать, я тоже попробовал, и это сработало:

  1. Загрузите этот файл из записной книжки в формате файла PY (этот параметр можно найти на вкладке «Файл»).
  2. Теперь скопируйте этот загруженный файл в рабочий каталог Jupyter Notebook.
  3. Теперь вы готовы его использовать. Просто импортируйте файл .PY в файл ipynb
Яш Бансал
источник
хм ... Я преобразовал callee.ipync в файл callee.py, а затем загрузил файл callee.py в записную книжку в той же папке с caller.ipync и только что написал в caller.ipync import callee, просто не мог Работа.
Эльза Лин
ps IPython - это версия: 5.1.0.
Эльза Лин
1

Проблема в том, что записные книжки - это не простой файл Python. Шаги по импорту .ipynbфайла описаны ниже: Импорт записной книжки

Я вставляю код, поэтому, если он вам нужен ... вы можете просто быстро скопировать и вставить. Обратите внимание, что в конце у меня есть import primesутверждение. Вам, конечно, придется это изменить. Имя моего файла primes.ipynb. С этого момента вы можете использовать содержимое внутри этого файла, как обычно.

Хотелось бы, чтобы был более простой метод, но он прямо из документации.
Примечание: я использую jupyter, а не ipython.

import io, os, sys, types
from IPython import get_ipython
from nbformat import current
from IPython.core.interactiveshell import InteractiveShell


def find_notebook(fullname, path=None):
    """find a notebook, given its fully qualified name and an optional path

    This turns "foo.bar" into "foo/bar.ipynb"
    and tries turning "Foo_Bar" into "Foo Bar" if Foo_Bar
    does not exist.
    """
    name = fullname.rsplit('.', 1)[-1]
    if not path:
        path = ['']
    for d in path:
        nb_path = os.path.join(d, name + ".ipynb")
        if os.path.isfile(nb_path):
            return nb_path
        # let import Notebook_Name find "Notebook Name.ipynb"
        nb_path = nb_path.replace("_", " ")
        if os.path.isfile(nb_path):
            return nb_path


class NotebookLoader(object):
    """Module Loader for Jupyter Notebooks"""
    def __init__(self, path=None):
        self.shell = InteractiveShell.instance()
        self.path = path

    def load_module(self, fullname):
        """import a notebook as a module"""
        path = find_notebook(fullname, self.path)

        print ("importing Jupyter notebook from %s" % path)

        # load the notebook object
        with io.open(path, 'r', encoding='utf-8') as f:
            nb = current.read(f, 'json')


        # create the module and add it to sys.modules
        # if name in sys.modules:
        #    return sys.modules[name]
        mod = types.ModuleType(fullname)
        mod.__file__ = path
        mod.__loader__ = self
        mod.__dict__['get_ipython'] = get_ipython
        sys.modules[fullname] = mod

        # extra work to ensure that magics that would affect the user_ns
        # actually affect the notebook module's ns
        save_user_ns = self.shell.user_ns
        self.shell.user_ns = mod.__dict__

        try:
        for cell in nb.worksheets[0].cells:
            if cell.cell_type == 'code' and cell.language == 'python':
                # transform the input to executable Python
                code = self.shell.input_transformer_manager.transform_cell(cell.input)
                # run the code in themodule
                exec(code, mod.__dict__)
        finally:
            self.shell.user_ns = save_user_ns
        return mod


class NotebookFinder(object):
    """Module finder that locates Jupyter Notebooks"""
    def __init__(self):
        self.loaders = {}

    def find_module(self, fullname, path=None):
        nb_path = find_notebook(fullname, path)
        if not nb_path:
            return

        key = path
        if path:
            # lists aren't hashable
            key = os.path.sep.join(path)

        if key not in self.loaders:
            self.loaders[key] = NotebookLoader(path)
        return self.loaders[key]

sys.meta_path.append(NotebookFinder())

import primes
зародыш13
источник
1

Нет никаких проблем с использованием Jupyter с существующими или новыми модулями Python .py. При запущенном Jupyter просто запустите Spyder (или любой другой редактор по вашему выбору), чтобы создать / изменить определения классов вашего модуля в файле .py, а затем просто импортируйте модули по мере необходимости в Jupyter.

Одна вещь, которая делает это действительно бесшовным, - это использование магического расширения автозагрузки. Вы можете увидеть документацию по автоперезагрузке здесь:

http://ipython.readthedocs.io/en/stable/config/extensions/autoreload.html

Вот код для автоматической перезагрузки модуля каждый раз, когда он был изменен:

# autoreload sets up auto reloading of modified .py modules
import autoreload
%load_ext autoreload
%autoreload 2

Обратите внимание, что я пробовал код, упомянутый в предыдущем ответе, для имитации загрузки файлов .ipynb как модулей, и заставил его работать, но он давится, когда вы вносите изменения в файл .ipynb. Похоже, вам нужно перезапустить среду разработки Jupyter, чтобы перезагрузить «модуль» .ipynb, что для меня было неприемлемо, поскольку я вношу много изменений в свой код.

Дэвид Миллер
источник
0

Убедитесь, что вы также добавили __init__.py в пакет файл, в котором находятся все остальные файлы .ipynb.

Это в дополнение к ссылке nbviewer, которая minrkиsyi приведенной выше.

У меня тоже была похожая проблема, и я написал решение, а также ссылку на мою общедоступную папку диска Google, в которой есть рабочий пример :)

Мой пост в Stackoverflow с пошаговыми экспериментами и решением:

Блокнот Jupyter: импорт файла .ipynb и доступ к его методу в другом файле .ipynb с ошибкой

Надеюсь, это поможет и другим. Спасибо всем!

анугра
источник