Разделить большой фрейм данных pandas

86

У меня большой фрейм данных с 423244 строками. Я хочу разделить это на 4. Я пробовал следующий код, который дал ошибку?ValueError: array split does not result in an equal division

for item in np.split(df, 4):
    print item

Как разделить этот фрейм данных на 4 группы?

Нилани Альгирияге
источник
Нам нужна np.split(df, N)функция, пожалуйста.
Sören

Ответы:

182

Использование np.array_split:

Docstring:
Split an array into multiple sub-arrays.

Please refer to the ``split`` documentation.  The only difference
between these functions is that ``array_split`` allows
`indices_or_sections` to be an integer that does *not* equally
divide the axis.

In [1]: import pandas as pd

In [2]: df = pd.DataFrame({'A' : ['foo', 'bar', 'foo', 'bar',
   ...:                           'foo', 'bar', 'foo', 'foo'],
   ...:                    'B' : ['one', 'one', 'two', 'three',
   ...:                           'two', 'two', 'one', 'three'],
   ...:                    'C' : randn(8), 'D' : randn(8)})

In [3]: print df
     A      B         C         D
0  foo    one -0.174067 -0.608579
1  bar    one -0.860386 -1.210518
2  foo    two  0.614102  1.689837
3  bar  three -0.284792 -1.071160
4  foo    two  0.843610  0.803712
5  bar    two -1.514722  0.870861
6  foo    one  0.131529 -0.968151
7  foo  three -1.002946 -0.257468

In [4]: import numpy as np
In [5]: np.array_split(df, 3)
Out[5]: 
[     A    B         C         D
0  foo  one -0.174067 -0.608579
1  bar  one -0.860386 -1.210518
2  foo  two  0.614102  1.689837,
      A      B         C         D
3  bar  three -0.284792 -1.071160
4  foo    two  0.843610  0.803712
5  bar    two -1.514722  0.870861,
      A      B         C         D
6  foo    one  0.131529 -0.968151
7  foo  three -1.002946 -0.257468]
корень
источник
Огромное спасибо! В дополнение к этому я хочу применить некоторую функцию к каждой группе? Как получить доступ к группам по одной?
Nilani Algiriyage
7
@NilaniAlgiriyage - array_splitвозвращает список DataFrames, так что вы можете просто просмотреть список ...
root
Я разделяю фрейм данных, так как он слишком велик. Я хочу взять первую группу и применить функцию, затем вторую группу и применить функцию и т. Д., Так как мне получить доступ к каждой группе?
Nilani Algiriyage
1
Как не получить AttributeError, поскольку Dataframe не имеет «размера».
Boosted_d16 06
2
Этот ответ устарел:AttributeError: 'DataFrame' object has no attribute 'size'
Tjorriemorrie
33

Я хотел сделать то же самое, и у меня сначала были проблемы с функцией разделения, затем проблемы с установкой pandas 0.15.2, поэтому я вернулся к своей старой версии и написал небольшую функцию, которая работает очень хорошо. Надеюсь, это поможет!

# input - df: a Dataframe, chunkSize: the chunk size
# output - a list of DataFrame
# purpose - splits the DataFrame into smaller chunks
def split_dataframe(df, chunk_size = 10000): 
    chunks = list()
    num_chunks = len(df) // chunk_size + 1
    for i in range(num_chunks):
        chunks.append(df[i*chunk_size:(i+1)*chunk_size])
    return chunks
эликсир
источник
5
намного быстрее, чем использование np.array_split ()
jgaw
4
Правильный способ вычисления numberChunks import math numberChunks = math.ceil (len (df) / chunkSize)
Сергей Лейко
21

Думаю, теперь мы можем использовать для этого plain ilocс range.

chunk_size = int(df.shape[0] / 4)
for start in range(0, df.shape[0], chunk_size):
    df_subset = df.iloc[start:start + chunk_size]
    process_data(df_subset)
    ....
пратпор
источник
1
Просто и интуитивно
понятно
13

Имейте в np.array_split(df, 3)виду, что фрейм данных разбивается на 3 подфрейма данных, а split_dataframeфункция, определенная в ответе @ elixir , при вызове as split_dataframe(df, chunk_size=3)разделяет фрейм данных по каждой chunk_sizeстроке.

Пример:

С np.array_split:

df = pd.DataFrame([1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11], columns=['TEST'])
df_split = np.array_split(df, 3)

... вы получаете 3 субфрейма данных:

df_split[0] # 1, 2, 3, 4
df_split[1] # 5, 6, 7, 8
df_split[2] # 9, 10, 11

С split_dataframe:

df_split2 = split_dataframe(df, chunk_size=3)

... вы получаете 4 субфрейма данных:

df_split2[0] # 1, 2, 3
df_split2[1] # 4, 5, 6
df_split2[2] # 7, 8, 9
df_split2[3] # 10, 11

Надеюсь, я прав, и что это полезно.

Жильберто
источник
есть ли простой способ сделать этот процесс случайным. Я могу думать только о добавлении случайного столбца, разделении и удалении случайного столбца, но может быть более простой способ
Рутгер Хофсте
они должны быть одинакового размера?
InquilineKea,
8

Осторожно:

np.array_splitне работает с numpy-1.9.0. Проверил: работает с 1.8.1.

Ошибка:

Dataframe не имеет атрибута size

Йему
источник
6
Я зарегистрировал ошибку в pandas github: github.com/pydata/pandas/issues/8846 кажется, что она уже исправлена ​​для pandas 0.15.2
yemu
4

Вы можете использовать groupby, если у вас есть целочисленный индекс:

import math
df = pd.DataFrame(dict(sample=np.arange(99)))
rows_per_subframe = math.ceil(len(df) / 4.)

subframes = [i[1] for i in df.groupby(np.arange(len(df))//rows_per_subframe)]

Примечание: groupbyвозвращает кортеж, в котором 2-й элемент является фреймом данных, поэтому извлечение немного усложняется.

>>> len(subframes), [len(i) for i in subframes]
(4, [25, 25, 25, 24])
Румпель
источник
1

Я также столкнулся с тем, что np.array_split не работал с Pandas DataFrame, мое решение заключалось в том, чтобы разделить только индекс DataFrame, а затем ввести новый столбец с меткой «группа»:

indexes = np.array_split(df.index,N, axis=0)
for i,index in enumerate(indexes):
   df.loc[index,'group'] = i

Это делает операции группировки очень удобными, например, для расчета среднего значения каждой группы:

df.groupby(by='group').mean()
Мартин Александерссон
источник
0

вы можете использовать списки, чтобы сделать это в одной строке

n = 4
chunks = [df[i:i+n] for i in range(0,df.shape[0],n)]
Ришаб Видж
источник