Найти целочисленный индекс строк с NaN в кадре данных pandas

96

У меня есть DataFrame панд вроде этого:

                    a         b
2011-01-01 00:00:00 1.883381  -0.416629
2011-01-01 01:00:00 0.149948  -1.782170
2011-01-01 02:00:00 -0.407604 0.314168
2011-01-01 03:00:00 1.452354  NaN
2011-01-01 04:00:00 -1.224869 -0.947457
2011-01-01 05:00:00 0.498326  0.070416
2011-01-01 06:00:00 0.401665  NaN
2011-01-01 07:00:00 -0.019766 0.533641
2011-01-01 08:00:00 -1.101303 -1.408561
2011-01-01 09:00:00 1.671795  -0.764629

Есть ли эффективный способ найти "целочисленный" индекс строк с NaN? В этом случае желаемый результат должен быть [3, 6].

Жан-Франсуа Корбетт
источник
12
Если вы просто хотите выделить строки с помощью nan, вы можете сделать этоdf[np.isnan(df['b'])]
lazy1
4
Продолжая @ lazy1 - вместо использования numpy's isnanвы также можете использоватьdf['b'].isnull()
jmetz

Ответы:

48

Для DataFrame df:

import numpy as np
index = df['b'].index[df['b'].apply(np.isnan)]

вернет вам то, MultiIndexчто вы можете использовать для индексации df, например:

df['a'].ix[index[0]]
>>> 1.452354

Для целочисленного индекса:

df_index = df.index.values.tolist()
[df_index.index(i) for i in index]
>>> [3, 6]
делиоп
источник
1
Как бы интуитивно это ни ixзвучало, по некоторым причинам это звучит так, будто оно устарело в пользуiloc
кардамона
145

Вот более простое решение:

inds = pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]

In [9]: df
Out[9]: 
          0         1
0  0.450319  0.062595
1 -0.673058  0.156073
2 -0.871179 -0.118575
3  0.594188       NaN
4 -1.017903 -0.484744
5  0.860375  0.239265
6 -0.640070       NaN
7 -0.535802  1.632932
8  0.876523 -0.153634
9 -0.686914  0.131185

In [10]: pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]
Out[10]: array([3, 6])
Уэс МакКинни
источник
29
В итоге я использовал это:np.where(df['b'].notnull())[0]
спасибо, .nonzero()[0]лучше чем [i for i, k in enumerate(mask) if k].)
Winand
2
Вы, вероятно, могли бы еще больше упростить это:r, _ = np.where(df.isna())
cs95
2
.to_numpy()сначала добавить, чтобы преобразовать в массив numpy -pd.isnull(df).any(1).to_numpy().nonzero()
7bStan
14

Однострочное решение. Однако это работает только для одного столбца.

df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index
Василий Васьковский
источник
Это то, что я искал. Я составил список, обернув его list(...)примерно так:list(df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index)
Дэниел Батлер,
10

И на всякий случай, если вы хотите вместо этого найти координаты nan для всех столбцов (предположим, что все они числовые), вот вам:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

df
   0  1  2    3    4  5
0  0  1  3  4.0  NaN  2
1  3  5  6  NaN  3.0  3

np.where(np.asanyarray(np.isnan(df)))
(array([0, 1]), array([4, 3]))
Филиппо Мацца
источник
9

Не знаю, слишком ли поздно, но вы можете использовать np.where, чтобы найти индексы не-значений как таковых:

indices = list(np.where(df['b'].isna()[0]))
природа
источник
4

в случае, если у вас есть индекс datetime и вы хотите иметь значения:

df.loc[pd.isnull(df).any(1), :].index.values
Амирхм
источник
4

Вот тесты для нескольких методов:

%timeit np.where(np.isnan(df['b']))[0]
%timeit pd.isnull(df['b']).nonzero()[0]
%timeit np.where(df['b'].isna())[0]
%timeit df.loc[pd.isna(df['b']), :].index

И их соответствующие тайминги:

333 µs ± 9.95 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
280 µs ± 220 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
313 µs ± 128 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
6.84 ms ± 1.59 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

Казалось бы, это pd.isnull(df['DRGWeight']).nonzero()[0]выигрывает день с точки зрения времени, но любой из трех лучших методов имеет сопоставимую производительность.

Адам Эриксон
источник
2

Еще одно простое решение: list(np.where(df['b'].isnull())[0])

Картикеян
источник
1

Вот еще один более простой вариант:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

inds = np.asarray(df.isnull()).nonzero()

(array([0, 1], dtype=int64), array([4, 3], dtype=int64))
пчелиный воск ноня
источник
1

Я искал все индексы строк со значениями NaN.
Мое рабочее решение:

def get_nan_indexes(data_frame):
    indexes = []
    print(data_frame)
    for column in data_frame:
        index = data_frame[column].index[data_frame[column].apply(np.isnan)]
        if len(index):
            indexes.append(index[0])
    df_index = data_frame.index.values.tolist()
    return [df_index.index(i) for i in set(indexes)]
мурти10
источник
0

Пусть фрейм данных будет называться df, а интересующий столбец (т. Е. Столбец, в котором мы пытаемся найти нули ) - «b» . Затем следующий фрагмент дает желаемый индекс нуля в фрейме данных:

   for i in range(df.shape[0]):
       if df['b'].isnull().iloc[i]:
           print(i)
Стоун Остин
источник