Какой самый простой способ ограничить объем памяти raster
, используемый пакетом, R
до 5 ГБ ОЗУ?
В идеале я хочу, чтобы любой растр, который превышает этот размер, записывался на жесткий диск и анализировался из временного файла.
Я использую Windows 7 (64Bit) и R версии 3.0.3.
Вот некоторый код, с которым я играл на машине с 16 ГБ ОЗУ, но он постоянно увеличивается, когда я работаю с большими растрами:
require(raster)
memory.limit(size = 5000)
rasterOptions(format="GTiff",overwrite=TRUE,datatype="INT1S",
tmpdir="C:/Research/BIN",tmptime=1.1,progress="text",chunksize=1000,
maxmemory=1000)
rasterTmpFile("delete_me_")
r <- raster("myraster.tif")
r[r==0] <- NA
Именно на этом этапе в сценарии увеличивается использование оперативной памяти, чтобы занять все 16 ГБ, а затем перестает работать и отменяет функцию.
Что мне нужно изменить здесь?