Сделайте что -нибудь файл в папке

find . -type d '!' -exec test -e "{}/yourfile" ';' -print  |  awk '{if($1==".") system("sbatch ../../../../runthis.sh")}' 
									^ your file name       ^ output will be "."    if we have a "." as output do this                            

Hutch Polecat